[日本語] English
文献
- EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース -

+
検索条件

キーワード
構造解析手法
著者・登録者
ジャーナル
IF

-
Structure paper

タイトルHow short peptides disassemble tau fibrils in Alzheimer's disease.
ジャーナル・号・ページNature, Vol. 644, Issue 8078, Page 1020-1027, Year 2025
掲載日2025年7月9日
著者Ke Hou / Peng Ge / Michael R Sawaya / Liisa Lutter / Joshua L Dolinsky / Yuan Yang / Yi Xiao Jiang / David R Boyer / Xinyi Cheng / Justin Pi / Jeffrey Zhang / Jiahui Lu / Romany Abskharon / Shixin Yang / Zhiheng Yu / Juli Feigon / David S Eisenberg /
PubMed 要旨Reducing fibrous aggregates of the protein tau is a possible strategy for halting the progression of Alzheimer's disease (AD). Previously, we found that in vitro, the D-enantiomeric peptide (D- ...Reducing fibrous aggregates of the protein tau is a possible strategy for halting the progression of Alzheimer's disease (AD). Previously, we found that in vitro, the D-enantiomeric peptide (D-peptide) D-TLKIVWC disassembles ultra-stable tau fibrils extracted from the autopsied brains of individuals with AD (hereafter, these tau fibrils are referred to as AD-tau) into benign segments, with no energy source other than ambient thermal agitation. To consider D-peptide-mediated disassembly as a potential route to therapeutics for AD, it is essential to understand the mechanism and energy source of the disassembly action. Here, we show that the assembly of D-peptides into amyloid-like ('mock-amyloid') fibrils is essential for AD-tau disassembly. These mock-amyloid fibrils have a right-handed twist but are constrained to adopt a left-handed twist when templated in complex with AD-tau. The release of strain that accompanies the conversion of left-twisted to right-twisted, relaxed mock-amyloid produces a torque that is sufficient to break the local hydrogen bonding between tau molecules, and leads to the fragmentation of AD-tau. This strain-relief mechanism seems to operate in other examples of amyloid fibril disassembly, and could inform the development of first-in-class therapeutics for amyloid diseases.
リンクNature / PubMed:40634605 / PubMed Central
手法EM (らせん対称)
解像度3.1 - 3.7 Å
構造データ

EMDB-44181, PDB-9b4i:
Filament of D-TLKIVWI, a D-peptide that disaggregates Alzheimer's Paired Helical Filaments, determined by Cryo-EM
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.6 Å

EMDB-44182, PDB-9b4j:
Filament of D-TLKIVWS, a D-peptide that disaggregates Alzheimer's Paired Helical Filaments, determined by Cryo-EM
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.5 Å

EMDB-44183, PDB-9b4k:
Filament of D-TLKIVWR, a D-peptide that disaggregates Alzheimer's Paired Helical Filaments, determined by Cryo-EM
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.7 Å

EMDB-44184, PDB-9b4l:
Filament of Tau in complex with D-TLKIVWI, a D-peptide that disaggregates Alzheimer's Paired Helical Filaments, determined by Cryo-EM
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.1 Å

EMDB-44185, PDB-9b4m:
Filament of Tau in complex with D-TLKIVWS, a D-peptide that disaggregates Alzheimer's Paired Helical Filaments, determined by Cryo-EM
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.1 Å

EMDB-44186, PDB-9b4n:
Filament of Tau in complex with D-TLKIVWR, a D-peptide that disaggregates Alzheimer's Paired Helical Filaments, determined by Cryo-EM
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.5 Å

EMDB-44187, PDB-9b4o:
Alzheimer's Tau Paired Helical Filaments, determined by CryoEM, before addition of D-peptide disaggregants
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.5 Å

化合物

ChemComp-EDT:
{[-(BIS-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ETHYL]-CARBOXYMETHYL-AMINO}-ACETIC ACID / EDTA

由来
  • synthetic construct (人工物)
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードUNKNOWN FUNCTION / Alzheimer's disease / Tau / fibril / cryo-EM / helix / PROTEIN FIBRIL

+
万見文献について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見文献

EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース

  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る