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Structure paper

タイトルThe hypertrophic cardiomyopathy-associated A331P actin variant enhances basal contractile activity and elicits resting muscle dysfunction.
ジャーナル・号・ページiScience, Vol. 28, Issue 2, Page 111816, Year 2025
掲載日2025年2月21日
著者Matthew H Doran / Michael J Rynkiewicz / Evan Despond / Meera C Viswanathan / Aditi Madan / Kripa Chitre / Axel J Fenwick / Duncan Sousa / William Lehman / John F Dawson / Anthony Cammarato /
PubMed 要旨Previous studies aimed at defining the mechanistic basis of hypertrophic cardiomyopathy caused by A331P cardiac actin have reported conflicting results. The mutation is located along an actin surface ...Previous studies aimed at defining the mechanistic basis of hypertrophic cardiomyopathy caused by A331P cardiac actin have reported conflicting results. The mutation is located along an actin surface strand, proximal to residues that interact with tropomyosin. These F-actin-tropomyosin associations are vital for proper contractile inhibition. To help resolve disease pathogenesis, we implemented a multidisciplinary approach. Transgenic , expressing A331P actin, displayed skeletal muscle hypercontraction and elevated basal myocardial activity. A331P thin filaments, reconstituted using recombinant human cardiac actin, exhibited higher myosin-based sliding speeds, exclusively at low Ca concentrations. Cryo-EM-based reconstructions revealed no detectable A331P-related structural perturbations in F-actin. , however, the P331-containing actin surface strand was less mobile and established diminished van der Waal's attractive forces with tropomyosin, which correlated with greater variability in inhibitory tropomyosin positioning. Such mutation-induced effects potentially elevate resting contractile activity among our models and may stimulate pathology in patients.
リンクiScience / PubMed:39981516 / PubMed Central
手法EM (らせん対称)
解像度3.5 Å
構造データ

44154

9b3r

EMDB-44154, PDB-9b3r:
The structure of human cardiac F-actin
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.5 Å

化合物

ChemComp-MG:
Unknown entry / マグネシウムジカチオン

ChemComp-ADP:
ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / ADP / ADP, エネルギー貯蔵分子*YM

由来
  • Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ)
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードCONTRACTILE PROTEIN / actin / cardiac / human / sarcomere

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース

  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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