タイトル Biochemical and structural analysis of a dehydrogenase, KanD2, and an aminotransferase, KanS2, that are responsible for the construction of the kanosamine moiety in kanamycin biosynthesis. ジャーナル・号・ページ Biochemistry , Vol. 59, Page 1470-1473, Year 2020掲載日 2019年4月18日 (構造データの登録日) 著者Kudo, F. / Kitayama, Y. / Miyanaga, A. / Hirayama, A. / Eguchi, T. リンク Biochemistry / PubMed:32237736手法 X線回折 解像度 2.36 - 2.8 Å 構造データ PDB-6jw6 : 構造ビューア The crystal structure of KanD2 in complex with NAD 手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 2.8 Å
PDB-6jw7 : 構造ビューア The crystal structure of KanD2 in complex with NADH and 3"-deamino-3"-hydroxykanamycin A 手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 2.36 Å
PDB-6jw8 : 構造ビューア The crystal structure of KanD2 in complex with NADH and 3"-deamino-3"-hydroxykanamycin B 手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 2.4 Å
化合物 ChemComp-NAD : 構造ビューア NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE / NAD*YM / ニコチンアミドアデニンジヌクレオチド
ChemComp-NAI : 構造ビューア 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE / NADH / ニコチンアミドアデニンジヌクレオチド
ChemComp-CJX : 構造ビューア (2R,3S,4S,5R,6R)-2-(aminomethyl)-6-[(1R,2S,3S,4R,6S)-4,6-bis(azanyl)-3-[(2S,3R,4S,5S,6R)-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-2-oxidanyl-cyclohexyl]oxy-oxane-3,4,5-triol / カナマイシンD
ChemComp-CK0 : 構造ビューア (2S,3R,4S,5S,6R)-2-[(1S,2S,3R,4S,6R)-3-[(2R,3R,4R,5S,6R)-6-(aminomethyl)-3-azanyl-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,6-bis(azanyl)-2-oxidanyl-cyclohexyl]oxy-6-(hydroxymethyl)oxane-3,4,5-triol / ネブラマイシンIII
由来 streptomyces kanamyceticus (カナマイシン生産菌) キーワード OXIDOREDUCTASE (酸化還元酵素) / Rossmann fold (ロスマンフォールド) / NAD binding