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タイトルHuman enterotoxigenic (ETEC) infections elicit antibodies that broadly neutralize mucinases of pathogenic and .
ジャーナル・号・ページProc Natl Acad Sci U S A, Vol. 123, Issue 25, Page e2614012123, Year 2026
掲載日2026年6月23日
著者David P Buckley / Marjahan Akhtar / Mahima Thapa / Aaron Schmitz / Jackson Turner / Tim J Vickers / Nazia Khatoon / M Hasanul Kaisar / Jonathan A Coggin / Debayan Ganguli / Alaullah Sheikh / Renee M Laird / Frédéric Poly / Chad K Porter / Fernando Ruiz-Perez / Mark J Miller / Fahima Chowdhury / Tafiqur R Bhuiyan / Firdausi Qadri / Sergio Trillo-Muyo / Brendan Dolan / Sjoerd van der Post / Ali Ellebedy / Zachary T Berndsen / James M Fleckenstein /
PubMed 要旨Enterotoxigenic (ETEC) and are the most common bacterial diarrheal pathogens among young children of low-middle income regions. Enteric pathogens must overcome formidable host defenses, including ...Enterotoxigenic (ETEC) and are the most common bacterial diarrheal pathogens among young children of low-middle income regions. Enteric pathogens must overcome formidable host defenses, including the protective barrier formed by intestinal mucus. ETEC produce a virulence protein called EatA, a member of the Serine Protease Autotransporter of the (SPATE) family, where the secreted passenger domain (EatA) specifically degrades MUC2, the major mucus secreted by goblet cells of the human intestine. Notably, some spp., as well as other diarrheagenic pathovars, secrete homologues of EatA known as SepA, and Pic. Here, we demonstrate that EatA, SepA, and Pic are functionally redundant MUC2 mucinases and that recombinant monoclonal antibodies (mAbs) derived from plasmablasts of ETEC-infected humans can inhibit MUC2 degradation by all three proteases. We present cryo-EM structures of EatA and the related SPATE proteins, SepA, and Pic, complexed to fragment antigen-binding portions of these mAbs to demonstrate that those targeting a core β-helix epitope shared by all three SPATE molecules broadly neutralize the capacity to degrade MUC2. These mAbs effectively prevent MUC2 degradation by each SPATE as well as mucus penetration by ETEC, , and Pic-producing enteroaggregative (EAEC). We anticipate that these studies could facilitate rational design of vaccines that broadly protect against major enteric pathogens by targeting a shared virulence feature.
リンクProc Natl Acad Sci U S A / PubMed:42296351 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度1.99 - 3.7 Å
構造データ

EMDB-73866: Raw consensus map of rEatAp complexed with Fab G12
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.29 Å

EMDB-73867: Constituent EM map: local refinement of putative MUC2 binding domain of rEatAp and Fv domain of Fab G12
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.68 Å

EMDB-73868: Constituent EM map: local refinement of putative MUC2 binding domain of rEatAp and Fab G12 from best Fab-containing 2D classes
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.69 Å

73869

9z76

EMDB-73869, PDB-9z76:
Cryo-EM structure of Enterotoxigenic Escherichia coli autotransporter A (EatA) complexed with the fragment antigen binding domain of monoclonal antibody 25
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.32 Å

73870

9z77

EMDB-73870, PDB-9z77:
Cryo-EM structure of Enterotoxigenic Escherichia coli autotransporter A (EatA) complexed with the fragment antigen binding domain of monoclonal antibody G12
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.7 Å

73871

9z78

EMDB-73871, PDB-9z78:
Cryo-EM structure of Enterotoxigenic Escherichia coli autotransporter A (EatA) complexed with the fragment antigen binding domain of monoclonal antibody 15
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.64 Å

73872

9z79

EMDB-73872, PDB-9z79:
Cryo-EM structure of Enterotoxigenic Escherichia coli autotransporter A (EatA) complexed with the fragment antigen binding domain of monoclonal antibody 40
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.66 Å

73873

9z7a

EMDB-73873, PDB-9z7a:
Cryo-EM structure of Secreted extracellular protein A (SepA) from Shigella flexneri complexed with the fragment antigen binding domain of monoclonal antibody 40
手法: EM (単粒子) / 解像度: 1.99 Å

73874

9z7b

EMDB-73874, PDB-9z7b:
Cryo-EM structure of Protein involved in colonization (Pic) from Enteroaggregative Escherichia coli complexed with the fragment antigen binding domain of monoclonal antibody 40
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.69 Å

由来
  • escherichia coli (大腸菌)
  • homo sapiens (ヒト)
  • shigella flexneri 2a str. 2457t (フレクスナー赤痢菌)
  • escherichia coli 042 (大腸菌)
キーワードHYDROLASE/IMMUNE SYSTEM / PROTEASE / BETA-HELIX / SECRETED / MONOCLONAL ANTIBODY / HYDROLASE / HYDROLASE-IMMUNE SYSTEM complex

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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