[日本語] English
万見文献
- EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース -

+
検索条件

キーワード
構造解析手法
著者・登録者
ジャーナル
IF

-
Structure paper

タイトルBioactive lipid-mediated structural and functional regulation of the essential human potassium channel Kir7.1.
ジャーナル・号・ページNat Commun, Year 2026
掲載日2026年2月11日
著者Qingwei Niu / Simon Vu / Yuanjiang Xu / Mingxing Qian / Anastasiia Rudenko / Jin Ye / Jianwei Zeng / Wei Huang / Douglas F Covey / Rui Zhang / Ziao Fu / Polina V Lishko /
PubMed 要旨The inwardly rectifying potassium channel Kir7.1 is essential for the physiological function of diverse tissues, including the retinal pigment epithelium and the gestational myometrium. Loss-of- ...The inwardly rectifying potassium channel Kir7.1 is essential for the physiological function of diverse tissues, including the retinal pigment epithelium and the gestational myometrium. Loss-of-function mutations in KCNJ13, which encodes Kir7.1, or conditional ablation of Kir7.1 in the retinal pigment epithelium, lead to early-onset vision loss. Despite strong genetic evidence supporting Kir7.1 as a therapeutic target, its regulation by endogenous ligands-beyond phosphoinositides-remains poorly understood. Here, we report cryo-electron microscopy structures of human Kir7.1 in multiple functional states at resolutions ranging from 2.8 Å to 4.0 Å. These structures uncover the molecular basis of Kir7.1 modulation by PIP, its selectivity, rectification, and identify a distinct steroid-binding site that may mediate cooperative channel gating. Our data suggest that endogenous cholesterol acts as an inhibitory ligand, which is displaced by select activating steroids. These activating steroids work in concert with PIP to promote channel opening through profound changes in cytoplasmic domains, and the linker region. Electrophysiological analyses define a pharmacological landscape of Kir7.1 activators, providing innovative tools to probe and modulate channel function in both physiological and pathological contexts.
リンクNat Commun / PubMed:41672996
手法EM (単粒子)
解像度3.3 - 4.0 Å
構造データ

71798

9pr5

EMDB-71798, PDB-9pr5:
Cryo-EM structure of the human inward-rectifier potassium 7.1 channel (Kir7.1) extended state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.3 Å

71799

9pr6

EMDB-71799, PDB-9pr6:
Cryo-EM structure of the human inward-rectifier potassium 7.1 channel (Kir7.1) docked state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.9 Å

71800

9pr7

EMDB-71800, PDB-9pr7:
Cryo-EM structure of the human inward-rectifier potassium 7.1 channel (Kir7.1) with enantiomer of 17-hydroxyprogesterone caproate
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.0 Å

化合物

ChemComp-PIO:
[(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate / 1-O-(1-O,2-O-ジオクタノイル-L-グリセロ-3-ホスホ)-D-myo-イノシト-ル4,5-ビスりん酸

ChemComp-CLR:
CHOLESTEROL / コレステロ-ル

PDB-1cjg:
NMR STRUCTURE OF LAC REPRESSOR HP62-DNA COMPLEX

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードMEMBRANE PROTEIN / inwardly rectifying potassium channel Kir7.1 / KCNJ13 / electrophysiology / ion channels / steroids / steroid enantiomers

+
万見文献について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見文献

EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース

  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る