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タイトルRapid elicitation of neutralizing Asn332-glycan-independent antibodies to the V3-glycan epitope of HIV-1 Env in nonhuman primates.
ジャーナル・号・ページNat Immunol, Year 2026
掲載日2026年2月3日
著者Ignacio Relano-Rodriguez / Jianqiu Du / Zi Jie Lin / Margaret Kerwin / Marta Tarquis-Medina / Eduardo Urbano / Jiayan Cui / Meagan Watkins / Christy L Lavine / Peng Zhao / Rumi Habib / Colby Agostino / Sukanya Ghosh / Joyce Park / Caroline Boroughs / Agnes A Walsh / Mariane B Melo / Niharika Shukla / George M Shaw / Beatrice H Hahn / Darrell J Irvine / Lance Wells / David B Weiner / Michael S Seaman / Daniel W Kulp / Ronald S Veazey / Jesper Pallesen / Amelia Escolano /
PubMed 要旨Sequential immunization is a promising approach to elicit broadly neutralizing antibodies (bNAbs) against the HIV-1 Envelope (Env). However, available protocols are inefficient and involve multiple ...Sequential immunization is a promising approach to elicit broadly neutralizing antibodies (bNAbs) against the HIV-1 Envelope (Env). However, available protocols are inefficient and involve multiple immunizations over long periods of time. Here, we present WIN332, a new engineered Env immunogen that induces a new class of Asn332-glycan-independent antibodies to the conserved V3-glycan epitope of Env with low inhibitory activity indicative of a neutralization activity after a single bolus immunization in nonhuman primates. WIN332 binds to precursors of canonical human Asn332-glycan-dependent (type-I) V3-glycan bNAbs but also of a first-of-its-class Asn332-glycan-independent (type-II) V3-glycan bNAb. A single immunization elicits low inhibitory serum and monoclonal antibodies that are boosted and affinity matured with a heterologous immunogen. Electron microscopy polyclonal epitope mapping analysis of serum antibodies, antibody cloning and cryogenic electron microscopy analysis reveals that WIN332 elicits Asn332-glycan-independent antibodies with striking sequence and binding similarities with the most potent human type-I and type-II V3-glycan bNAbs. Thus, WIN332 is a promising vaccine candidate to streamline V3-glycan bNAb elicitation.
リンクNat Immunol / PubMed:41634485
手法EM (単粒子)
解像度3.79 - 3.94 Å
構造データ

70231

9o8m

EMDB-70231, PDB-9o8m:
Ab1983 in complex with HIV-1 Env variant WIN332
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.79 Å

70395

9oed

EMDB-70395, PDB-9oed:
Ab1999 in complex with HIV-1 Env RC1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.94 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-アセチル-β-D-グルコサミン

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • human immunodeficiency virus 1 (ヒト免疫不全ウイルス)
  • macaca mulatta (アカゲザル)
キーワードVIRAL PROTEIN / HIV-1 Env / antibody

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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