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タイトルFilamentous structure of the CotVW complex, the crust proteins of the Bacillus subtilis endospore.
ジャーナル・号・ページJ Biol Chem, Vol. 301, Issue 11, Page 110714, Year 2025
掲載日2025年9月11日
著者Eunbyul Jo / Doyeon Kim / Yeongjin Baek / Migak Park / Hyojeong Lee / Nam-Chul Ha /
PubMed 要旨The endospores of Bacillus subtilis are encased in a multilayered protective structure comprising core, cortex, inner and outer coats, and an outermost crust. Among the proteins required for crust ...The endospores of Bacillus subtilis are encased in a multilayered protective structure comprising core, cortex, inner and outer coats, and an outermost crust. Among the proteins required for crust formation, CotV and CotW are unique to B. subtilis and are hypothesized to be instrumental in maintaining spore surface integrity. However, their structural organization and functional mechanisms remain unclear. This study determined the cryo-EM structure of the CotVW complex and revealed its filamentous helical architecture. Structural analysis showed that CotVW possesses a negatively charged surface that enables pH-dependent binding interactions. Specifically, at pH 6.0, CotVW engages in electrostatic interactions with histidine and positively charged residues, suggesting a potential regulatory mechanism influenced by the environmental pH. Our results elucidate the molecular basis of CotVW function in B. subtilis spore crust formation, highlighting its role in spore surface organization. This study advances our understanding of the spore coat architecture and may inform future research on bacterial spore resilience and structural adaptation.
リンクJ Biol Chem / PubMed:40945727 / PubMed Central
手法EM (らせん対称)
解像度3.32 Å
構造データ

63065

9lgh

EMDB-63065, PDB-9lgh:
Cryo-EM structure of CotVW filament, bacillus subtilis endospore protein
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.32 Å

由来
  • bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 (枯草菌)
キーワードSTRUCTURAL PROTEIN / bacillus / spore protein / complex / filament / helical / PROTEIN FIBRIL

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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