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タイトルNS2 induces an influenza A RNA polymerase hexamer and acts as a transcription to replication switch.
ジャーナル・号・ページEMBO Rep, Vol. 25, Issue 11, Page 4708-4727, Year 2024
掲載日2024年7月18日
著者Junqing Sun / Lu Kuai / Lei Zhang / Yufeng Xie / Yanfang Zhang / Yan Li / Qi Peng / Yuekun Shao / Qiuxian Yang / Wen-Xia Tian / Junhao Zhu / Jianxun Qi / Yi Shi / Tao Deng / George F Gao /
PubMed 要旨Genome transcription and replication of influenza A virus (FluA), catalyzed by viral RNA polymerase (FluAPol), are delicately controlled across the virus life cycle. A switch from transcription to ...Genome transcription and replication of influenza A virus (FluA), catalyzed by viral RNA polymerase (FluAPol), are delicately controlled across the virus life cycle. A switch from transcription to replication occurring at later stage of an infection is critical for progeny virion production and viral non-structural protein NS2 has been implicated in regulating the switch. However, the underlying regulatory mechanisms and the structure of NS2 remained elusive for years. Here, we determine the cryo-EM structure of the FluAPol-NS2 complex at ~3.0 Å resolution. Surprisingly, three domain-swapped NS2 dimers arrange three symmetrical FluPol dimers into a highly ordered barrel-like hexamer. Further structural and functional analyses demonstrate that NS2 binding not only hampers the interaction between FluAPol and the Pol II CTD because of steric conflicts, but also impairs FluAPol transcriptase activity by stalling it in the replicase conformation. Moreover, this is the first visualization of the full-length NS2 structure. Our findings uncover key molecular mechanisms of the FluA transcription-replication switch and have implications for the development of antivirals.
リンクEMBO Rep / PubMed:39026012 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.74 - 3.03 Å
構造データ

39020

8y7m

EMDB-39020, PDB-8y7m:
FluPol-NS2 complex (local refinement)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.0 Å

39022

8y7o

EMDB-39022, PDB-8y7o:
FluPol-NS2 complex (hexamer)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.0 Å

EMDB-39242: FluPol-NS2-1 complex (hexamer)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.77 Å

EMDB-39247: FluPol-NS2-raw complex(hexamer)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.03 Å

EMDB-39248: FluPol-NS2-2 Complex (hexamer)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.85 Å

EMDB-39251: FluPol-NS2-3 complex (hexamer)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.74 Å

由来
  • Influenza A virus (A/Aichi/2/1968(H3N2)) (A型インフルエンザウイルス)
  • influenza a virus (a/nt/60/1968(h3n2)) (A型インフルエンザウイルス)
  • influenza a virus (strain a/hong kong/1/1968 h3n2) (A型インフルエンザウイルス)
  • influenza a virus (a/hong kong/1/1968(h3n2)) (A型インフルエンザウイルス)
キーワードPROTEIN BINDING

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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