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タイトルNucleocapsid assembly drives Ebola viral factory maturation and dispersion.
ジャーナル・号・ページCell, Vol. 188, Issue 3, Page 704-720.e17, Year 2025
掲載日2025年2月6日
著者Melina Vallbracht / Bianca S Bodmer / Konstantin Fischer / Jana Makroczyova / Sophie L Winter / Lisa Wendt / Moritz Wachsmuth-Melm / Thomas Hoenen / Petr Chlanda /
PubMed 要旨Replication and genome encapsidation of many negative-sense RNA viruses take place in virus-induced membraneless organelles termed viral factories (VFs). Although liquid properties of VFs are ...Replication and genome encapsidation of many negative-sense RNA viruses take place in virus-induced membraneless organelles termed viral factories (VFs). Although liquid properties of VFs are believed to control the transition from genome replication to nucleocapsid (NC) assembly, VF maturation and interactions with the cellular environment remain elusive. Here, we apply in situ cryo-correlative light and electron tomography to follow NC assembly and changes in VF morphology and their liquid properties during Ebola virus infection. We show that viral NCs transition from loosely packed helical assemblies in early VFs to compact cylinders that arrange into highly organized parallel bundles later in infection. Early VFs associate with intermediate filaments and are devoid of other host material but become progressively accessible to cellular components. Our data suggest that this process is coupled to VF solidification, loss of sphericity, and dispersion and promotes cytoplasmic exposure of NCs to facilitate their transport to budding sites.
リンクCell / PubMed:39742805
手法EM (トモグラフィー) / EM (サブトモグラム平均)
解像度21.0 Å
構造データ

EMDB-18675: Cryo-ET of cryo-FIB milled Ebola virus infected Huh7 cells at 22 hours post infection.
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-18676: Cryo-ET of cryo-FIB milled Ebola virus infected Huh7 cells at 22 hours post infection
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-18678: Cryo-ET of cryo-FIB milled Ebola virus infected Huh7 cells at 14 hours post infection
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-18679: Cryo-ET of cryo-FIB milled of Huh7 cells transfected with Ebola virus proteins NP, VP35, L, VP30-GFP vitrified at 28 hours post transfection
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-18686: Cryo-ET of cryo-FIB milled of Huh7 cells transfected with Ebola virus proteins NP, VP35, L, VP30-GFP, VP40 and VP24 vitrified at 28 hours post transfection
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-18690: Cryo-ET of cryo-FIB milled Ebola virus-VP30-GFP infected Huh7 cells at 14 hours post infection
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-18695: Cryo-ET of cryo-FIB milled Ebola virus-VP30-GFP infected Huh7 cells at 22 hours post infection
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-18696: Cryo-ET of cryo-FIB milled Ebola virus infected Huh7 cells at 14 hours post infection
手法: EM (トモグラフィー)

EMDB-18697: Subtomogram average of Ebola virus nucleocapsid obtained from cryo-FIB milled Ebola virus infected Huh7 cells at 22 hours post infection
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 21.0 Å

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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