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タイトルStructural basis of poxvirus fusion regulation and anti-A16/G9 antibody-mediated neutralization and protection.
ジャーナル・号・ページCell, Vol. 188, Issue 22, Page 6266-6282.e18, Year 2025
掲載日2025年10月30日
著者Annalisa Meola / Riccardo Vernuccio / Leandro Battini / Guillermo Albericio / Pilar Delgado / Rebecca Bamford / Laura Pokorny / Manon Broutin / Alejandro Martínez León / Sébastien Gallien / María Gil / María A Noriega / Florence Guivel-Benhassine / Françoise Porrot / Jeanne Postal / Julian Buchrieser / Mathieu Hubert / Ahmed Haouz / Pierre Lafaye / Mariano Esteban / Jochen S Hub / Matthieu Mahévas / Pascal Chappert / Jason Mercer / Juan Garcia-Arriaza / Olivier Schwartz / Pablo Guardado-Calvo /
PubMed 要旨Monkeypox virus (MPXV) is a poxvirus endemic to Central and West Africa with high epidemic potential. Poxviruses enter host cells via a conserved entry-fusion complex (EFC), which mediates viral ...Monkeypox virus (MPXV) is a poxvirus endemic to Central and West Africa with high epidemic potential. Poxviruses enter host cells via a conserved entry-fusion complex (EFC), which mediates viral fusion to the cell membrane. The EFC is a promising therapeutic target, but the absence of structural data has limited the development of fusion-inhibiting treatments. Here, we investigated A16/G9, a subcomplex of the EFC that controls fusion timing. Using cryo-electron microscopy, we showed how A16/G9 interacts with A56/K2, a viral fusion suppressor that prevents superinfection. Immunization with A16/G9 elicited a protective immune response in mice. Using X-ray crystallography, we characterized two neutralizing antibodies and engineered a chimeric antibody that cross-neutralizes several poxviruses more efficiently than 7D11, the most potent antibody targeting the EFC described to date. These findings highlight the potential of A16/G9 as a candidate for subunit vaccines and identify regions of the EFC as targets for antiviral development.
リンクCell / PubMed:40865523
手法EM (単粒子) / X線回折
解像度2.45 - 4.0 Å
構造データ

52019

9hbk

EMDB-52019, PDB-9hbk:
Structure of A16/G9 in complex with A56/K2 (vaccinia virus)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

53936

9rdh

EMDB-53936, PDB-9rdh:
Structure of A16/G9 in complex with A56/K2 at pH 5.5 (vaccinia virus)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.0 Å

PDB-9hl2:
Structure of A56/K2 (vaccinia virus)
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.8 Å

PDB-9hls:
Structure of A16/G9 (vaccinia virus) in complex with VHH D07, VHH B01 and VHH C05
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 3.2 Å

PDB-9hng:
Structure of A16/G9 (G9 mutant - H44Y) of Vaccinia virus in complex with VHH D07
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.5 Å

PDB-9hpa:
Structure of A16/G9 (vaccinia virus) in complex with VHH D07 and VHH E12
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 3.1 Å

PDB-9r09:
Structure of A16/G9 (vaccinia virus) in complex with VHH D07 at pH 5.7
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.45 Å

PDB-9r0b:
Structure of A16/G9 (vaccinia virus) in complex with VHH D07 at pH 6.5
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.45 Å

PDB-9r0j:
Structure of A16/G9 (vaccinia virus) in complex with VHH D07 at pH 7.2
手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.45 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose

ChemComp-PEG:
DI(HYDROXYETHYL)ETHER

ChemComp-HOH:
WATER

ChemComp-K:
Unknown entry

ChemComp-PO4:
PHOSPHATE ION

ChemComp-SO4:
SULFATE ION

ChemComp-MES:
2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID / pH緩衝剤*YM

ChemComp-GOL:
GLYCEROL

由来
  • Vaccinia virus (ウイルス)
  • vaccinia virus western reserve (ウイルス)
  • vicugna pacos (アルパカ)
キーワードVIRAL PROTEIN / poxvirus / viral fusion / vaccinia virus / mpox virus

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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