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タイトルSLC45A4 is a pain gene encoding a neuronal polyamine transporter.
ジャーナル・号・ページNature, Vol. 646, Issue 8084, Page 404-412, Year 2025
掲載日2025年8月20日
著者Steven J Middleton / Sigurbjörn Markússon / Mikael Åkerlund / Justin C Deme / Mandy Tseng / Wenqianglong Li / Sana R Zuberi / Gabriel Kuteyi / Peter Sarkies / Georgios Baskozos / Jimena Perez-Sanchez / Adham Farah / Harry L Hébert / Sylvanus Toikumo / Zhanru Yu / Susan Maxwell / Yin Y Dong / Benedikt M Kessler / Henry R Kranzler / John E Linley / Blair H Smith / Susan M Lea / Joanne L Parker / Valeriya Lyssenko / Simon Newstead / David L Bennett /
PubMed 要旨Polyamines are regulatory metabolites with key roles in transcription, translation, cell signalling and autophagy. They are implicated in multiple neurological disorders, including stroke, epilepsy ...Polyamines are regulatory metabolites with key roles in transcription, translation, cell signalling and autophagy. They are implicated in multiple neurological disorders, including stroke, epilepsy and neurodegeneration, and can regulate neuronal excitability through interactions with ion channels. Polyamines have been linked to pain, showing altered levels in human persistent pain states and modulation of pain behaviour in animal models. However, the systems governing polyamine transport within the nervous system remain unclear. Here, undertaking a genome-wide association study (GWAS) of chronic pain intensity in the UK Biobank (UKB), we found a significant association between pain intensity and variants mapping to the SLC45A4 gene locus. In the mouse nervous system, Slc45a4 expression is enriched in all sensory neuron subtypes within the dorsal root ganglion, including nociceptors. Cell-based assays show that SLC45A4 is a selective plasma membrane polyamine transporter, and the cryo-electron microscopy (cryo-EM) structure reveals a regulatory domain and basis for polyamine recognition. Mice lacking SLC45A4 show normal mechanosensitivity but reduced sensitivity to noxious heat- and algogen-induced tonic pain that is associated with reduced excitability of C-polymodal nociceptors. Our findings therefore establish a role for neuronal polyamine transport in pain perception and identify a target for therapeutic intervention in pain treatment.
リンクNature / PubMed:40836097 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.8 - 3.25 Å
構造データ

51365

9ghz

EMDB-51365, PDB-9ghz:
Cryo-EM structure of human SLC45A4 in lipid nanodiscs
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.25 Å

51377

9giu

EMDB-51377, PDB-9giu:
Cryo-EM structure of human SLC45A4 in detergent
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.8 Å

化合物

ChemComp-3PE:
1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine / リン脂質*YM

ChemComp-CLR:
CHOLESTEROL

ChemComp-HOH:
WATER

ChemComp-Y01:
CHOLESTEROL HEMISUCCINATE

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードTRANSPORT PROTEIN / Transporter / SLC / MFS / Polyamine / Spermidine

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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