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タイトルGAD65 tunes the functions of Best1 as a GABA receptor and a neurotransmitter conducting channel.
ジャーナル・号・ページNat Commun, Vol. 15, Issue 1, Page 8051, Year 2024
掲載日2024年9月14日
著者Jiali Wang / Aaron P Owji / Alec Kittredge / Zada Clark / Yu Zhang / Tingting Yang /
PubMed 要旨Bestrophin-1 (Best1) is an anion channel genetically linked to vision-threatening retinal degenerative channelopathies. Here, we identify interactions between Best1 and both isoforms of glutamic acid ...Bestrophin-1 (Best1) is an anion channel genetically linked to vision-threatening retinal degenerative channelopathies. Here, we identify interactions between Best1 and both isoforms of glutamic acid decarboxylases (GAD65 and GAD67), elucidate the distinctive influences of GAD65 and GAD67 on Best1's permeability to various anions/neurotransmitters, discover the functionality of Best1 as a γ-Aminobutyric acid (GABA) type A receptor, and solve the structure of GABA-bound Best1. GAD65 and GAD67 both promote Best1-mediated Cl currents, but only GAD65 drastically enhances the permeability of Best1 to glutamate and GABA, for which GAD67 has no effect. GABA binds to Best1 on an extracellular site and stimulates Best1-mediated Cl currents at the nano-molar concentration level. The physiological role of GAD65 as a cell type-specific binding partner and facilitator of Best1 is demonstrated in retinal pigment epithelial cells. Together, our results reveal critical regulators of Best1 and inform a network of membrane transport metabolons formed between bestrophin channels and glutamate metabolic enzymes.
リンクNat Commun / PubMed:39277606 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.41 - 2.5 Å
構造データ

45915

9ctq

EMDB-45915, PDB-9ctq:
Best1 + GABA open state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.41 Å

45916

9ctr

EMDB-45916, PDB-9ctr:
Best1 + GABA intermediate state 1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.42 Å

45917

9cts

EMDB-45917, PDB-9cts:
Best1 + GABA intermediate state 2
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.45 Å

45918

9ctt

EMDB-45918, PDB-9ctt:
Best1 + GABA closed state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.5 Å

化合物

ChemComp-CA:
Unknown entry / カルシウムジカチオン

ChemComp-ABU:
GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID / GABA

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードMEMBRANE PROTEIN / calcium-activated chloride channel / GABA type A receptor / GABA-bound anion channel / channel-activator complex

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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