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タイトルAdipogenin promotes the development of lipid droplets by binding a dodecameric seipin complex.
ジャーナル・号・ページScience, Vol. 390, Issue 6773, Page eadr9755, Year 2025
掲載日2025年11月6日
著者Chao Li / Xue-Nan Sun / Jan-Bernd Funcke / Lauri Vanharanta / Xavier Prasanna / Kaitlynn Gov / Yan Li / Megan Virostek / Chanmin Joung / Nolwenn Joffin / Kristiina Kanerva / Abel Szkalisity / Waldemar Kulig / Leon Straub / Shiuhwei Chen / Joselin Velasco / Ayanna Cobb / Davide La Padula / May-Yun Wang / Toshiharu Onodera / Csaba Vörös / Dae-Seok Kim / Min Kim / Oleg Varlamov / Yang Li / Chen Liu / Andrea R Nawrocki / Shangang Zhao / Da Young Oh / Zhao V Wang / Ruth Gordillo / Joel M Goodman / R Max Wynn / W Mike Henne / Ilpo Vattulainen / Yan Han / Elina Ikonen / Philipp E Scherer /
PubMed 要旨The microprotein adipogenin (Adig) is predominantly expressed in adipose tissues. Here, we found that Adig interacts with seipin to form a stable, rigid complex. We present the structure of the ...The microprotein adipogenin (Adig) is predominantly expressed in adipose tissues. Here, we found that Adig interacts with seipin to form a stable, rigid complex. We present the structure of the seipin-Adig complex at an overall resolution of ~3.0 angstroms. The structure revealed that mammalian seipin assembles into two distinct oligomeric forms: undecamers and dodecamers. Adig selectively bound to the dodecameric form and enhanced seipin assembly by bridging and stabilizing adjacent subunits. Functionally, this complex promoted lipid droplet development at both early and late stages. In transgenic mice, adipocyte-specific overexpression of Adig increased fat mass and enlarged lipid droplets, whereas Adig deletion disrupted triglyceride accumulation in brown adipose tissues. Thus, Adig can modulate lipid storage through its structural and functional interactions with seipin.
リンクScience / PubMed:41196993
手法EM (単粒子)
解像度2.98 - 3.19 Å
構造データ

45301

9c8d

EMDB-45301, PDB-9c8d:
mouse Seipin/Adig complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.98 Å

45302

9c8e

EMDB-45302, PDB-9c8e:
mouse Seipin complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.19 Å

由来
  • mus musculus (ハツカネズミ)
キーワードMEMBRANE PROTEIN / seipin / adipogenin / lipid droplets / adipose

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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