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タイトルStructure and function of the ABC transporter ABCB19 in brassinosteroid export.
ジャーナル・号・ページScience, Vol. 383, Issue 6689, Page eadj4591, Year 2024
掲載日2024年3月22日
著者Wei Ying / Yaowei Wang / Hong Wei / Yongming Luo / Qian Ma / Heyuan Zhu / Hilde Janssens / Nemanja Vukašinović / Miroslav Kvasnica / Johan M Winne / Yongxiang Gao / Shutang Tan / Jiří Friml / Xin Liu / Eugenia Russinova / Linfeng Sun /
PubMed 要旨Brassinosteroids are steroidal phytohormones that regulate plant development and physiology, including adaptation to environmental stresses. Brassinosteroids are synthesized in the cell interior but ...Brassinosteroids are steroidal phytohormones that regulate plant development and physiology, including adaptation to environmental stresses. Brassinosteroids are synthesized in the cell interior but bind receptors at the cell surface, necessitating a yet to be identified export mechanism. Here, we show that a member of the ATP-binding cassette (ABC) transporter superfamily, ABCB19, functions as a brassinosteroid exporter. We present its structure in both the substrate-unbound and the brassinosteroid-bound states. Bioactive brassinosteroids are potent activators of ABCB19 ATP hydrolysis activity, and transport assays showed that ABCB19 transports brassinosteroids. In , ABCB19 and its close homolog, ABCB1, positively regulate brassinosteroid responses. Our results uncover an elusive export mechanism for bioactive brassinosteroids that is tightly coordinated with brassinosteroid signaling.
リンクScience / PubMed:38513023
手法EM (単粒子)
解像度3.4 - 3.9 Å
構造データ

37690

8woi

EMDB-37690, PDB-8woi:
Structure of the wild-type Arabidopsis ABCB19 in the apo state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.4 Å

37692

8wom

EMDB-37692, PDB-8wom:
Structure of the wild-type Arabidopsis ABCB19 in the brassinolide-bound state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.5 Å

37694

8woo

EMDB-37694, PDB-8woo:
Structure of the wild-type Arabidopsis ABCB19 in the brassinolide and AMP-PNP bound state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.9 Å

37705

8wp0

EMDB-37705, PDB-8wp0:
Structure of the Arabidopsis E529Q/E1174Q ABCB19 in the ATP bound state
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.4 Å

化合物

ChemComp-BLD:
Brassinolide / ブラシノリド / ホルモン*YM

ChemComp-MG:
Unknown entry / マグネシウムジカチオン

ChemComp-ANP:
PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER / AMP-PNP / AMP-PNP, エネルギー貯蔵分子類似体*YM

ChemComp-ATP:
ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / ATP / ATP, エネルギー貯蔵分子*YM

由来
  • arabidopsis thaliana (シロイヌナズナ)
キーワードTRANSPORT PROTEIN / ABC transporter / wild-type / apo state / brassinolide-bound state

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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