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タイトルTumor-agnostic cancer therapy using antibodies targeting oncofetal chondroitin sulfate.
ジャーナル・号・ページNat Commun, Vol. 15, Issue 1, Page 7553, Year 2024
掲載日2024年8月30日
著者Elena Ethel Vidal-Calvo / Anne Martin-Salazar / Swati Choudhary / Robert Dagil / Sai Sundar Rajan Raghavan / Lara Duvnjak / Mie Anemone Nordmaj / Thomas Mandel Clausen / Ann Skafte / Jan Oberkofler / Kaituo Wang / Mette Ø Agerbæk / Caroline Løppke / Amalie Mundt Jørgensen / Daria Ropac / Joana Mujollari / Shona Willis / Agnès Garcias López / Rebecca Louise Miller / Richard Torbjörn Gustav Karlsson / Felix Goerdeler / Yen-Hsi Chen / Ana R Colaço / Yong Wang / Thomas Lavstsen / Agnieszka Martowicz / Irina Nelepcu / Mona Marzban / Htoo Zarni Oo / Maj Sofie Ørum-Madsen / Yuzhuo Wang / Morten A Nielsen / Henrik Clausen / Michael Wierer / Dominik Wolf / Ismail Gögenur / Thor G Theander / Nader Al-Nakouzi / Tobias Gustavsson / Mads Daugaard / Ali Salanti /
PubMed 要旨Molecular similarities between embryonic and malignant cells can be exploited to target tumors through specific signatures absent in healthy adult tissues. One such embryonic signature tumors express ...Molecular similarities between embryonic and malignant cells can be exploited to target tumors through specific signatures absent in healthy adult tissues. One such embryonic signature tumors express is oncofetal chondroitin sulfate (ofCS), which supports disease progression and dissemination in cancer. Here, we report the identification and characterization of phage display-derived antibody fragments recognizing two distinct ofCS epitopes. These antibody fragments show binding affinity to ofCS in the low nanomolar range across a broad selection of solid tumor types in vitro and in vivo with minimal binding to normal, inflamed, or benign tumor tissues. Anti-ofCS antibody drug conjugates and bispecific immune cell engagers based on these targeting moieties disrupt tumor progression in animal models of human and murine cancers. Thus, anti-ofCS antibody fragments hold promise for the development of broadly effective therapeutic and diagnostic applications targeting human malignancies.
リンクNat Commun / PubMed:39215044 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.2 Å
構造データ

17362

8p2e

EMDB-17362, PDB-8p2e:
Homotypic interacting B1 fab bound to Chondroitin Sulfate A
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードSUGAR BINDING PROTEIN / Chondroitin Sulfate A

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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