タイトル A highly conserved ligand-binding site for AccA transporters of antibiotic and quorum-sensing regulator in Agrobacterium leads to a different specificity. ジャーナル・号・ページ Biochem. J. , Vol. 481, Page 93-117, Year 2024掲載日 2023年1月12日 (構造データの登録日) 著者Morera, S. / Vigouroux, A. / Aumont-Nicaise, M. / Ahmar, M. / Meyer, T. / El Sahili, A. / Deicsics, G. / Gonzalez-Mula, A. / Li, S. / Dore, J. ...Morera, S. / Vigouroux, A. / Aumont-Nicaise, M. / Ahmar, M. / Meyer, T. / El Sahili, A. / Deicsics, G. / Gonzalez-Mula, A. / Li, S. / Dore, J. / Sirigu, S. / Legrand, P. / Penot, C. / Andre, F. / Faure, D. / Soulere, L. / Queneau, Y. / Vial, L. リンク Biochem. J. / PubMed:38058289手法 X線回折 解像度 1.199 - 2.8 Å 構造データ PDB-8c6r : 構造ビューア PBP AccA from A. tumefaciens Bo542 in apoform 4 手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 1.884 Å
PDB-8c6u : 構造ビューア PBP AccA-G145YG440Q mutant from A. tumefaciens Bo542 in apoform 4手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 1.843 Å
PDB-8c6w : 構造ビューア PBP AccA from A. tumefaciens Bo542 in apoform 1 手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 2.8 Å
PDB-8c6y : 構造ビューア PBP AccA from A. tumefaciens Bo542 in apoform 2 手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 1.901 Å
PDB-8c75 : 構造ビューア PBP AccA from A. tumefaciens Bo542 in apoform 3 手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 1.673 Å
PDB-8caw : 構造ビューア PBP AccA from A. tumefaciens Bo542 in complex with agrocin84 手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 1.256 Å
PDB-8cay : 構造ビューア PBP AccA from A. tumefaciens Bo542 in complex with Agrocinopine D-like 手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 1.626 Å
PDB-8cb9 : 構造ビューア PBP AccA from A. tumefaciens Bo542 in complex with D-Glucose-2-phosphate 手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 1.79 Å
PDB-8cdo : 構造ビューア PBP AccA-F144YG440Q from A. tumefaciens Bo542 in complex with agrocinopine C-like手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 1.32 Å
PDB-8ch1 : 構造ビューア PBP AccA from A. vitis S4 in complex with Agrocinopine A 手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 1.496 Å
PDB-8ch2 : 構造ビューア PBP AccA from A. vitis S4 in complex with L-arabinose-2-phosphate (A2P) 手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 1.404 Å
PDB-8ch3 : 構造ビューア PBP AccA from A. vitis S4 in complex with Agrocinopine C-like 手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 1.398 Å
PDB-8chc : 構造ビューア PBP AccA from A. vitis S4 in complex with Agrocinopine D-like 手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 1.679 Å
PDB-8ci6 : 構造ビューア PBP AccA from A. vitis S4 in complex with D-glucose-2-phosphate (G2P) 手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 1.199 Å
PDB-8cju : 構造ビューア PBP AccA from A. vitis S4 in complex with agrocin84 手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 1.349 Å
PDB-8ckd : 構造ビューア PBP AccA from A. fabrum C58 in complex with agrocinopine D-like手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 1.6 Å
PDB-8cke : 構造ビューア PBP AccA from A.tumefaciens C58 in complex with agrocinopine A in space group I222 手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 1.298 Å
PDB-8cko : 構造ビューア PBP AccA from A.tumefaciens C58 in complex with agrocinopine C-like手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 1.421 Å
化合物 ChemComp-C84 : 構造ビューア [(2R,3R,4S,5S,6R)-6-(hydroxymethyl)-2,4,5-tris(oxidanyl)oxan-3-yl]oxy-N-[9-[(2R,3S,5R)-5-[[[(2R,3S)-4-methyl-2,3-bis(oxidanyl)pentanoyl]amino]-oxidanyl-phosphoryl]oxy-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]purin-6-yl]phosphonamidic acid
ChemComp-UKU : 構造ビューア [(2S,3R,4S,5S,6R)-6-(hydroxymethyl)-2,4,5-tris(oxidanyl)oxan-3-yl]oxy-N-[9-[(2R,3S,5R)-5-[[[(2R,3S)-4-methyl-2,3-bis(oxidanyl)pentanoyl]amino]-oxidanyl-phosphoryl]oxy-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]purin-6-yl]phosphonamidic acid
ChemComp-Y4H : 構造ビューア Agrocinopine D-like (C2-C2 linked; with an alpha and beta-D-glucopyranose)
ChemComp-Y45 : 構造ビューア Agrocinopine D-like (C2-C2 linked; with two alpha-D-glucopyranoses)
由来 agrobacterium tumefaciens (植物への病原性)agrobacterium vitis s4 (バクテリア)allorhizobium ampelinum s4 (バクテリア)agrobacterium fabrum str. c58 (バクテリア) キーワード TRANSPORT PROTEIN / a Periplasmic binding protein / a solute binding protein / Periplasmic binding protein / solute binding protein