タイトル RNA polymerase II trapped on a molecular treadmill: Structural basis of persistent transcriptional arrest by a minor groove DNA binder. ジャーナル・号・ページ Proc. Natl. Acad. Sci. USA , Vol. 119, Year 2022掲載日 2021年7月20日 (構造データの登録日) 著者Oh, J. / Jia, T. / Xu, J. / Chong, J. / Dervan, P.B. / Wang, D. リンク Proc. Natl. Acad. Sci. USA / PubMed:35022237手法 X線回折 解像度 1.8 - 3.7 Å 構造データ PDB-7ril : 構造ビューア Crystal structure of hairpin polyamide Py-Im 1 bound to 5' CCTGACCAGG手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 1.8 Å
PDB-7rim : 構造ビューア RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 1 手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 2.9 Å
PDB-7rip : 構造ビューア RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 1 soaked with CTP 手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 3.3 Å
PDB-7riq : 構造ビューア RNA polymerase II elongation complex scaffold 1 without polyamide手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 3.0 Å
PDB-7riw : 構造ビューア RNA polymerase II elongation complex scaffold 2, without polyamide手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 3.2 Å
PDB-7rix : 構造ビューア RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 2 手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 3.4 Å
PDB-7riy : 構造ビューア RNA polymerase II elongation complex with hairpin polyamide Py-Im 1, scaffold 2 soaked with UTP 手法 : X-RAY DIFFRACTION / 解像度 : 3.7 Å
化合物 ChemComp-5N0 : 構造ビューア 3-({3-[(3-{[4-({4-[(4-{[4-({(2R)-2-amino-4-[(1-methyl-4-{[1-methyl-4-({1-methyl-4-[(1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl)amino]-1H-imidazole-2-carbonyl}amino)-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]butanoyl}amino)-1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl]amino}-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl)amino]-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl}amino)-1-methyl-1H-pyrrole-2-carbonyl]amino}propyl)(methyl)amino]propyl}carbamoyl)benzoic acid
由来 synthetic construct (人工物) saccharomyces cerevisiae (strain atcc 204508 / s288c) (パン酵母) キーワード DNA / Polyamide / small molecule / DNA binding molecule / anticancer agent / DNA BINDING PROTEIN/DNA/RNA / RNA polymerase II / elongation complex / TRANSCRIPTION / DNA BINDING PROTEIN-DNA-RNA complex / unnatural base / TPT3 / NAM