[日本語] English
万見文献
- EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース -

+
検索条件

キーワード
構造解析手法
著者・登録者
ジャーナル
IF

-
Structure paper

タイトルAssembly of recombinant tau into filaments identical to those of Alzheimer's disease and chronic traumatic encephalopathy.
ジャーナル・号・ページElife, Vol. 11, Year 2022
掲載日2022年3月4日
著者Sofia Lövestam / Fujiet Adrian Koh / Bart van Knippenberg / Abhay Kotecha / Alexey G Murzin / Michel Goedert / Sjors H W Scheres /
PubMed 要旨Abundant filamentous inclusions of tau are characteristic of more than 20 neurodegenerative diseases that are collectively termed tauopathies. Electron cryo-microscopy (cryo-EM) structures of tau ...Abundant filamentous inclusions of tau are characteristic of more than 20 neurodegenerative diseases that are collectively termed tauopathies. Electron cryo-microscopy (cryo-EM) structures of tau amyloid filaments from human brain revealed that distinct tau folds characterise many different diseases. A lack of laboratory-based model systems to generate these structures has hampered efforts to uncover the molecular mechanisms that underlie tauopathies. Here, we report in vitro assembly conditions with recombinant tau that replicate the structures of filaments from both Alzheimer's disease (AD) and chronic traumatic encephalopathy (CTE), as determined by cryo-EM. Our results suggest that post-translational modifications of tau modulate filament assembly, and that previously observed additional densities in AD and CTE filaments may arise from the presence of inorganic salts, like phosphates and sodium chloride. In vitro assembly of tau into disease-relevant filaments will facilitate studies to determine their roles in different diseases, as well as the development of compounds that specifically bind to these structures or prevent their formation.
リンクElife / PubMed:35244536 / PubMed Central
手法EM (らせん対称)
解像度1.86 - 3.4 Å
構造データ

14023

7qjv

EMDB-14023, PDB-7qjv:
In vitro assembled tau filaments into Quadruple Helical Filaments type 1 (2c)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.29 Å

14024

7qjw

EMDB-14024, PDB-7qjw:
In vitro assembled tau filaments with structures like chronic traumatic encephalopathy type II (8a)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.81 Å

14025

7qjx

EMDB-14025, PDB-7qjx:
In vitro assembled 297-394 tau filaments, 700 rpm (34b)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.99 Å

14026

7qjy

EMDB-14026, PDB-7qjy:
In vitro assembled 266/297 - 391 tau filaments with LiCl (9a)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.14 Å

14027

7qjz

EMDB-14027, PDB-7qjz:
In vitro assembled 266/297 - 391 tau filaments with LiCl (9b)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.4 Å

14028

7qk1

EMDB-14028, PDB-7qk1:
In vitro assembled 297-394 tau filaments in PBS (35d)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.03 Å

14029

7qk2

EMDB-14029, PDB-7qk2:
In vitro assembled 300-391 tau filaments in PBS (36a)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.61 Å

14030

7qk3

EMDB-14030, PDB-7qk3:
In vitro assembled 258-391 tau filaments, 700 rpm (38a)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.44 Å

14038

7qk5

EMDB-14038, PDB-7qk5:
In vitro assembled 266/297 - 391 tau filaments with KCl (10a)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 1.92 Å

14039

7qk6

EMDB-14039, PDB-7qk6:
In vitro assembled 258-391 tau filaments with heparan sulfate, 700 rpm (40a)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.27 Å

14040

7qkf

EMDB-14040, PDB-7qkf:
In vitro assembled 266/297 - 391 tau filaments with CuCl2 (12a)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.83 Å

14041

7qkg

EMDB-14041, PDB-7qkg:
In vitro assembled 258-391 tau filaments with phosphoglycerate, 700 rpm (39a)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.36 Å

14042

7qkh

EMDB-14042, PDB-7qkh:
In vitro assembled 258-391 tau filaments with sodium azide, (41a)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.17 Å

14043

7qki

EMDB-14043, PDB-7qki:
In vitro assembled 297-408 S396D S400D T403D S404D tau filaments (42a)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.13 Å

14044

7qkj

EMDB-14044, PDB-7qkj:
In vitro assembled 266/297 - 391 tau filaments with MgCl2 and NaCl (14b)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.26 Å

14045

7qkk

EMDB-14045, PDB-7qkk:
In vitro assembled 258-391 tau filaments with phosphoglycerate, 700 rpm (39a)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.8 Å

14046

7qkl

EMDB-14046, PDB-7qkl:
In vitro assembled 266/297 - 391 tau filaments with ZnCl2 (11a)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.07 Å

14047

7qkm

EMDB-14047, PDB-7qkm:
In vitro assembled 266-391 S356D tau filaments with NaCl (45a)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.66 Å

14053

7qku

EMDB-14053, PDB-7qku:
in vitro assembled 266/297 - 391 tau filaments with MgCl2 and NaCl (14a)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.57 Å

14054

7qkv

EMDB-14054, PDB-7qkv:
In vitro assembled tau filaments with MgSO4 and NaCl (15a)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.23 Å

14055

7qkw

EMDB-14055, PDB-7qkw:
In vitro assembled 266-391 S356D tau filaments with KCl (44a)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.32 Å

14056

7qkx

EMDB-14056, PDB-7qkx:
In vitro assembled 266/297 - 391 tau filaments with MgSO4 and NaCl (15b)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.16 Å

14057

7qky

EMDB-14057, PDB-7qky:
In vitro assembled 0N4R tau filaments with phosphoserine (47a)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 1.86 Å

14058

7qkz

EMDB-14058, PDB-7qkz:
In vitro assembled 305-379 tau filaments (27a)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.65 Å

14059

7ql0

EMDB-14059, PDB-7ql0:
In vitro assembled 266/297 - 391 tau filaments with MgSO4 and NaCl (15c)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.13 Å

14060

7ql1

EMDB-14060, PDB-7ql1:
In vitro assembled 266-391 tau filaments in PBS (23a)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.34 Å

14061

7ql2

EMDB-14061, PDB-7ql2:
In vitro assembled 244-391 tau filaments with Na2P2O7 (20a)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.95 Å

14062

7ql3

EMDB-14062, PDB-7ql3:
in vitro assembled 266/297 - 391 tau filaments with NaCl (8b)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.32 Å

14063

7ql4

EMDB-14063, PDB-7ql4:
in vitro assembled tau filaments with structures like Paired Helical Filaments from Alzheimer's Disease
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.2 Å

14316

7r4t

EMDB-14316, PDB-7r4t:
In vitro assembled 266/297 - 391 tau filaments with NaHCO3 and NaCl (16a)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.75 Å

14320

7r5h

EMDB-14320, PDB-7r5h:
In vitro assembled 266/297 - 391 tau filaments with KCl (10b)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 2.59 Å

化合物

ChemComp-CL:
Unknown entry / クロリド

ChemComp-K:
Unknown entry / カリウムカチオン

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードPROTEIN FIBRIL / Neurodegeneration / Amyloid / Tau / Alzheimer's Disease / Chronic traumatic encephalopathy

+
万見文献について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見文献

EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース

  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る