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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Pathogenic bacteria remodel central metabolic enzyme to build a cyclopropanol warhead.
ジャーナル・号・ページ	Nat. Chem., Vol. 14, Page 884-890, Year 2022
掲載日	2021年8月3日 (構造データの登録日)
著者	Trottmann, F. / Ishida, K. / Ishida-Ito, M. / Kries, H. / Groll, M. / Hertweck, C.
リンク	Nat. Chem. / PubMed:35906404
手法	X線回折
解像度	1.35 - 2.9 Å
構造データ	PDB-7pcc: BurG in complex with Mg2+ and NAD+ (holo): Biosynthesis of cyclopropanol rings in bacterial toxins 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.85 Å PDB-7pce: BurG (apo): Biosynthesis of cyclopropanol rings in bacterial toxins 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.9 Å PDB-7pcg: BurG (holo) in complex with cyclopropane-1,1-dicarboxylate (7): Biosynthesis of cyclopropanol rings in bacterial toxins 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.9 Å PDB-7pci: BurG (holo) in complex with hydroxypyruvate-enol (8): Biosynthesis of cyclopropanol rings in bacterial toxins 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.9 Å PDB-7pcl: BurG (holo) in complex with 2-hydroxy-2-(hydroxy(isopropyl)amino)acetate (11): Biosynthesis of cyclopropanolrings in bacterial toxins 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.05 Å PDB-7pcm: BurG (holo) in complex with (Z)-2,3-dihydroxy-6-methyl-hept-2-enoate (13): Biosynthesis of cyclopropanol rings in bacterial toxins 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.05 Å PDB-7pcn: BurG (holo) in complex with gonyenediol (14), trigonic acid (6) and DMS: Biosynthesis of cyclopropanol rings in bacterial toxins 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.6 Å PDB-7pco: BurG E232Q mutant (holo) in complex with 2R,3R-2,3-dihydroxy-6-methyl-heptanoate (12): Biosynthesis of cyclopropanol rings in bacterial toxins 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.55 Å PDB-7pct: BurG E232Q mutant (holo) in complex with enol-oxalacetate (15): Biosynthesis of cyclopropanol rings in bacterial toxins 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.35 Å
化合物	ChemComp-NAD: NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE / NADYM ChemComp-MG: Unknown entry / マグネシウムジカチオン ChemComp-GOL: GLYCEROL / グリセロ-ル ChemComp-HOH: WATER ChemComp-ADP: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / ADP / ADP, エネルギー貯蔵分子YM ChemComp-PO4: PHOSPHATE ION / ホスファ-ト ChemComp-9TY: cyclopropane-1,1-dicarboxylic acid / シクロプロパン-1,1-ジカルボン酸 ChemComp-74I: (Z)-2,3-bis(oxidanyl)prop-2-enoic acid / 2,3-ジヒドロキシプロペン酸 ChemComp-IMD: IMIDAZOLE / 1H-イミダゾ-ル-3-カチオン ChemComp-76I: (2S)-2-oxidanyl-2-[oxidanyl(propan-2-yl)amino]ethanoic acid ChemComp-NAI: 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE / NADH ChemComp-7I3: (Z)-6-methyl-2,3-bis(oxidanyl)hept-2-enoic acid ChemComp-NA: Unknown entry / ナトリウムカチオン ChemComp-MSM: (METHYLSULFANYL)METHANE / (メチルチオメチリジン)ラジカル ChemComp-7BI: dimethyl-[(Z)-3,4,5-tris(oxidanyl)-5-oxidanylidene-pent-3-enyl]sulfanium ChemComp-78I: (2R)-2-oxidanyl-2-(1-oxidanylcyclopropyl)ethanoic acid ChemComp-7FI: (2R,3R)-6-methyl-2,3-bis(oxidanyl)heptanoic acid ChemComp-Y3P: (~{Z})-2-oxidanylbut-2-enedioic acid / 2-ヒドロキシフマル酸
由来	burkholderia thailandensis (strain atcc 700388 / dsm 13276 / cip 106301 / e264) (バクテリア)
キーワード	LYASE / Pathogens / Natural Products / Toxins / Biosynthesis / Catalysis / Mutagenesis