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タイトルStructural Basis of the Activation of Heterotrimeric Gs-Protein by Isoproterenol-Bound β-Adrenergic Receptor.
ジャーナル・号・ページMol Cell, Vol. 80, Issue 1, Page 59-71.e4, Year 2020
掲載日2020年10月1日
著者Minfei Su / Lan Zhu / Yixiao Zhang / Navid Paknejad / Raja Dey / Jianyun Huang / Ming-Yue Lee / Dewight Williams / Kelsey D Jordan / Edward T Eng / Oliver P Ernst / Joel R Meyerson / Richard K Hite / Thomas Walz / Wei Liu / Xin-Yun Huang /
PubMed 要旨Cardiac disease remains the leading cause of morbidity and mortality worldwide. The β-adrenergic receptor (β-AR) is a major regulator of cardiac functions and is downregulated in the majority of ...Cardiac disease remains the leading cause of morbidity and mortality worldwide. The β-adrenergic receptor (β-AR) is a major regulator of cardiac functions and is downregulated in the majority of heart failure cases. A key physiological process is the activation of heterotrimeric G-protein Gs by β-ARs, leading to increased heart rate and contractility. Here, we use cryo-electron microscopy and functional studies to investigate the molecular mechanism by which β-AR activates Gs. We find that the tilting of α5-helix breaks a hydrogen bond between the sidechain of His373 in the C-terminal α5-helix and the backbone carbonyl of Arg38 in the N-terminal αN-helix of Gα. Together with the disruption of another interacting network involving Gln59 in the α1-helix, Ala352 in the β6-α5 loop, and Thr355 in the α5-helix, these conformational changes might lead to the deformation of the GDP-binding pocket. Our data provide molecular insights into the activation of G-proteins by G-protein-coupled receptors.
リンクMol Cell / PubMed:32818430 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.6 Å
構造データ

22357

7jjo

EMDB-22357, PDB-7jjo:
Structural Basis of the Activation of Heterotrimeric Gs-protein by Isoproterenol-bound Beta1-Adrenergic Receptor
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.6 Å

化合物

ChemComp-5FW:
ISOPRENALINE / (-)-イソプロテレノ-ル / 薬剤*YM

由来
  • bos taurus (ウシ)
  • lama glama (ラマ)
  • meleagris gallopavo (シチメンチョウ)
キーワードSIGNALING PROTEIN / Gs protein / GPCR-Gs complex / Agonist

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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