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タイトルHuman mAbs Broadly Protect against Arthritogenic Alphaviruses by Recognizing Conserved Elements of the Mxra8 Receptor-Binding Site.
ジャーナル・号・ページCell Host Microbe, Vol. 28, Issue 5, Page 699-711.e7, Year 2020
掲載日2020年11月11日
著者Laura A Powell / Andrew Miller / Julie M Fox / Nurgun Kose / Thomas Klose / Arthur S Kim / Robin Bombardi / Rashika N Tennekoon / A Dharshan de Silva / Robert H Carnahan / Michael S Diamond / Michael G Rossmann / Richard J Kuhn / James E Crowe /
PubMed 要旨Mosquito inoculation of humans with arthritogenic alphaviruses results in a febrile syndrome characterized by debilitating musculoskeletal pain and arthritis. Despite an expanding global disease ...Mosquito inoculation of humans with arthritogenic alphaviruses results in a febrile syndrome characterized by debilitating musculoskeletal pain and arthritis. Despite an expanding global disease burden, no approved therapies or licensed vaccines exist. Here, we describe human monoclonal antibodies (mAbs) that bind to and neutralize multiple distantly related alphaviruses. These mAbs compete for an antigenic site and prevent attachment to the recently discovered Mxra8 alphavirus receptor. Three cryoelectron microscopy structures of Fab in complex with Ross River (RRV), Mayaro, or chikungunya viruses reveal a conserved footprint of the broadly neutralizing mAb RRV-12 in a region of the E2 glycoprotein B domain. This mAb neutralizes virus in vitro by preventing virus entry and spread and is protective in vivo in mouse models. Thus, the RRV-12 mAb and its defined epitope have potential as a therapeutic agent or target of vaccine design against multiple emerging arthritogenic alphavirus infections.
リンクCell Host Microbe / PubMed:32783883 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度4.8 - 6.33 Å
構造データ

21473

6vyv

EMDB-21473, PDB-6vyv:
Human mAbs broadly protect against infection of arthritiogenic alphaviruses by recognizing conserved elements of the MXR8 receptor binding domain
手法: EM (単粒子) / 解像度: 6.33 Å

21496

6w09

EMDB-21496, PDB-6w09:
Human mAbs broadly protect against infection of arthritiogenic alphaviruses by recognizing conserved elements of the MXR8 receptor binding domain
手法: EM (単粒子) / 解像度: 5.3 Å

21509

6w1c

EMDB-21509, PDB-6w1c:
Human mAbs broadly protect against infection of arthritiogenic alphaviruses by recognizing conserved elements of the MXR8 receptor binding domain
手法: EM (単粒子) / 解像度: 5.3 Å

21532

6w2u

EMDB-21532: Native Mayaro virus cryo EM map, resolution 4.8 Angstroms
PDB-6w2u: Mayaro Virus glycoprotein E1 ectodomain and glycoportien E2 ectodomain asymmetric unit
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.8 Å

由来
  • ross river virus (strain t48) (ウイルス)
  • homo sapiens (ヒト)
  • chikungunya virus (チクングニヤウイルス)
  • mayaro virus (strain brazil) (ウイルス)
  • Mayaro virus (マヤロウイルス)
キーワードVIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM / virus / monoclonal antibody / complex / VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex / VIRUS/IMMUNE SYSTEM / VIRUS-IMMUNE SYSTEM complex

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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