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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	In Silico Derived Small Molecules Bind the Filovirus VP35 Protein and Inhibit Its Polymerase Cofactor Activity.
ジャーナル・号・ページ	J. Mol. Biol., Vol. 426, Page 2045-2058, Year 2014
掲載日	2012年12月8日 (構造データの登録日)
著者	Brown, C.S. / Lee, M.S. / Leung, D.W. / Wang, T. / Xu, W. / Luthra, P. / Anantpadma, M. / Shabman, R.S. / Melito, L.M. / Macmillan, K.S. ...Brown, C.S. / Lee, M.S. / Leung, D.W. / Wang, T. / Xu, W. / Luthra, P. / Anantpadma, M. / Shabman, R.S. / Melito, L.M. / Macmillan, K.S. / Borek, D.M. / Otwinowski, Z. / Ramanan, P. / Stubbs, A.J. / Peterson, D.S. / Binning, J.M. / Tonelli, M. / Olson, M.A. / Davey, R.A. / Ready, J.M. / Basler, C.F. / Amarasinghe, G.K.
リンク	J. Mol. Biol. / PubMed:24495995
手法	X線回折
解像度	1.413 - 2.291 Å
構造データ	PDB-4ibb: Ebola virus VP35 bound to small molecule 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.752 Å PDB-4ibc: Ebola virus VP35 bound to small molecule 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.745 Å PDB-4ibd: Ebola virus VP35 bound to small molecule 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.84 Å PDB-4ibe: Ebola virus VP35 bound to small molecule 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.95 Å PDB-4ibf: Ebola virus VP35 bound to small molecule 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.291 Å PDB-4ibg: Ebola virus VP35 bound to small molecule 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.413 Å PDB-4ibi: Ebola virus VP35 bound to small molecule 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.473 Å PDB-4ibj: Ebola virus VP35 bound to small molecule 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.54 Å PDB-4ibk: Ebola virus VP35 bound to small molecule 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.85 Å
化合物	ChemComp-1DK: {4-[(5R)-3-hydroxy-2-oxo-4-(thiophen-2-ylcarbonyl)-5-(2,4,5-trimethylphenyl)-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl]phenyl}acetic acid ChemComp-HOH: WATER / 水 ChemComp-12G: {4-[(2R)-3-(2-chlorobenzoyl)-2-(2-chlorophenyl)-4-hydroxy-5-oxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl]phenyl}acetic acid ChemComp-DMS: DIMETHYL SULFOXIDE / 2-チアプロパン2-オキシド / DMSO, 沈殿剤YM / ジメチルスルホキシド ChemComp-1DL: 5-[(2R)-3-benzoyl-2-(4-bromothiophen-2-yl)-4-hydroxy-5-oxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl]-2-methylbenzoic acid ChemComp-GOL: GLYCEROL / グリセロ-ル / グリセリン ChemComp-MG: Unknown entry / マグネシウムジカチオン ChemComp-11Y: 5-[(2R)-3-benzoyl-2-(4-bromothiophen-2-yl)-4-hydroxy-5-oxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl]-2-chlorobenzoic acid ChemComp-1D5: (4-{(2R)-2-(4-bromothiophen-2-yl)-3-[(5-chlorothiophen-2-yl)carbonyl]-4-hydroxy-5-oxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl}phenyl)acetic acid ChemComp-1D6: {4-[(2S)-2-(7-chloro-1,3-benzodioxol-5-yl)-4-hydroxy-3-(3-methylbenzoyl)-5-oxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl]phenyl}acetic acid ChemComp-SO4: SULFATE ION / 硫酸ジアニオン / 硫酸塩 ChemComp-PO4: PHOSPHATE ION / ホスファ-ト / リン酸塩 ChemComp-1D8: 3-{(2S)-2-(7-chloro-1,3-benzodioxol-5-yl)-4-hydroxy-5-oxo-3-[3-(trifluoromethyl)benzoyl]-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl}benzoic acid ChemComp-1D9: 3-{(5S)-3-hydroxy-2-oxo-4-[3-(trifluoromethyl)benzoyl]-5-[3-(trifluoromethyl)phenyl]-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl}benzoic acid ChemComp-1DE*: 3-{(2S)-2-(7-chloro-1,3-benzodioxol-5-yl)-3-[(5-chlorothiophen-2-yl)carbonyl]-4-hydroxy-5-oxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl}benzoic acid
由来	ebola virus (エボラウイルス)
キーワード	TRANSCRIPTION/TRANSCRIPTION inhibitor / Structural Genomics (構造ゲノミクス) / NIAID / National Institute of Allergy and Infectious Diseases (アメリカ国立アレルギー・感染症研究所) / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases / CSGID / Interferon inhibitory domain / TRANSCRIPTION-TRANSCRIPTION inhibitor complex / interferon inhibitor domain