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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Probing molecular docking in a charged model binding site.
ジャーナル・号・ページ	J. Mol. Biol., Vol. 357, Page 1449-1470, Year 2006
掲載日	2005年8月11日 (構造データの登録日)
著者	Brenk, R. / Vetter, S.W. / Boyce, S.E. / Goodin, D.B. / Shoichet, B.K.
リンク	J. Mol. Biol. / PubMed:16490206
手法	X線回折
解像度	1.12 - 1.75 Å
構造データ	PDB-2anz: cytochrome c peroxidase in complex with 2,6-diaminopyridine 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.75 Å PDB-2aqd: cytochrome c peroxidase (CCP) in complex with 2,5-diaminopyridine 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.35 Å PDB-2as1: cytochrome c peroxidase in complex with thiopheneamidine 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.55 Å PDB-2as2: cytochrome c peroxidase in complex with 2-iminopiperidine 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.45 Å PDB-2as3: cytochrome c peroxidase in complex with phenol 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.4 Å PDB-2as4: cytochrome c peroxidase in complex with 3-fluorocatechol 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.3 Å PDB-2as6: cytochrome c peroxidase in complex with cyclopentylamine 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.45 Å PDB-2eun: Cytochrome c peroxidase (CCP) in complex with 2,4-diaminopyrimidine 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.7 Å PDB-2euo: Cytochrome c peroxidase (CCP) in complex with 1-methyl-1-lambda-5-pyridin-3-yl-amine 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.45 Å PDB-2eup: Cytochrome c peroxidase (CCP) in complex with 2-amino-5-picoline 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.4 Å PDB-2euq: Cytochrome c peroxydase (CCP) in complex with 3-thienylmethylamine 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.3 Å PDB-2eur: Cytochrome c peroxidase (CCP) in complex with 4-pyridylcarbinol 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.39 Å PDB-2eus: Cytochrome c peroxidase (CCP) in complex with benzylamine 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.55 Å PDB-2eut: Cytochrome c peroxidase (CCP) in complex with 2-amino-4-picoline 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.12 Å PDB-2euu: Cytochrome c peroxidase (CCP) in complex with 1H-imidazol-2-ylmethanol 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.45 Å
化合物	ChemComp-HEM: PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE / Heme B ChemComp-26D: PYRIDINE-2,6-DIAMINE / 2,6-ジアミノピリジン ChemComp-HOH: WATER / 水 ChemComp-DA1: PYRIDINE-2,5-DIAMINE / 2,5-ジアミノピリジン ChemComp-TP5: THIOPHENE-3-CARBOXIMIDAMIDE / チオフェン-3-カルボアミジン ChemComp-2IM: PIPERIDIN-2-IMINE / ピペリジン-2-イミン ChemComp-K: Unknown entry / カリウムカチオン ChemComp-IPH: PHENOL / フェノ-ル / フェノール ChemComp-3FA: 3-FLUOROBENZENE-1,2-DIOL / 3-フルオロカテコ-ル ChemComp-1CB: CYCLOPENTANAMINE / シクロペンチルアミン ChemComp-LG3: PYRIMIDINE-2,4-DIAMINE / 2,4-ジアミノピリミジン / 2,4-Diaminopyrimidine ChemComp-LG5: 1-METHYL-1,6-DIHYDROPYRIDIN-3-AMINE ChemComp-LG4: 5-METHYLPYRIDIN-2-AMINE / 2-アミノ-5-メチルピリジン ChemComp-BVC: 1-THIEN-3-YLMETHANAMINE / チオフェン-3-メタンアミン ChemComp-PY7: PYRIDIN-4-YLMETHANOL / 4-ピリジンメタノ-ル ChemComp-ABN: BENZYLAMINE / ベンジルアミン / ベンジルアミン ChemComp-BVF: 4-METHYLPYRIDIN-2-AMINE / 2-アミノ-4-メチルピリジン ChemComp-BVG: 1H-IMIDAZOL-2-YLMETHANOL / 1H-イミダゾ-ル-2-メタノ-ル
由来	saccharomyces cerevisiae (パン酵母)
キーワード	OXIDOREDUCTASE (酸化還元酵素) / PEROXIDASE (ペルオキシダーゼ) / MODEL BINDING SITE / oxidureductase / engineered ligand binding site