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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Crystal structures of complexes between aminoglycosides and decoding A site oligonucleotides: role of the number of rings and positive charges in the specific binding leading to miscoding
ジャーナル・号・ページ	Nucleic Acids Res., Vol. 33, Page 5677-5790, Year 2005
掲載日	2005年10月26日 (構造データの登録日)
著者	Francois, B. / Russel, R.J.M. / Murray, J.B. / Aboul-ela, F. / Masquida, B. / Vicens, Q. / Westhof, E.
リンク	Nucleic Acids Res. / PubMed:16214802
手法	X線回折
解像度	2.2 - 3 Å
構造データ	PDB-2esi: Complex between Kanamycin A and the 16S-Rrna A Site. 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 3.0 Å PDB-2esj: Complex between Lividomycin A and the 16S-Rrna A Site 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.2 Å PDB-2et3: Complex Between Gentamicin C1A and the 16S-RRNA A-Site 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.8 Å PDB-2et4: Complex Between Neomycin B and the 16S-RRNA A-Site 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.4 Å PDB-2et5: Complex Between Ribostamycin and the 16S-RRNA A-Site 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.2 Å PDB-2et8: Complex Between Neamine and the 16S-RRNA A-Site 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 2.5 Å
化合物	ChemComp-KAN: KANAMYCIN A / カナマイシン / 抗生剤YM ChemComp-HOH: WATER ChemComp-LIV: (2R,3S,4S,5S,6R)-2-((2S,3S,4R,5R,6R)-5-AMINO-2-(AMINOMETHYL)-6-((2R,3S,4R,5S)-5-((1R,2R,3S,5R,6S)-3,5-DIAMINO-2-((2S,3R / リビドマイシンA / 抗生剤YM ChemComp-LLL: (2R,3R,4R,5R)-2-((1S,2S,3R,4S,6R)-4,6-DIAMINO-3-((2R,3R,6S)-3-AMINO-6-(AMINOMETHYL)-TETRAHYDRO-2H-PYRAN-2-YLOXY)-2-HYDR / ゲンタマイシンC_1a ChemComp-NMY: NEOMYCIN / ネオマイシンB / 抗生剤YM ChemComp-RIO: RIBOSTAMYCIN / リボスタマイシン / 抗生剤YM ChemComp-SO4: SULFATE ION / 硫酸ジアニオン ChemComp-XXX: (1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-diamino-2,3-dihydroxycyclohexyl 2,6-diamino-2,6-dideoxy-alpha-D-glucopyranoside / ネアミン / 抗生剤*YM
キーワード	RNA / RNA-AMINOGLYCOSIDE INTERACTIONS / A SITE / UOU PAIRS / AA BULGES