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タイトルAntibodies from a Human Survivor Define Sites of Vulnerability for Broad Protection against Ebolaviruses.
ジャーナル・号・ページCell, Vol. 169, Issue 5, Page 878-890.e15, Year 2017
掲載日2017年5月18日
著者Anna Z Wec / Andrew S Herbert / Charles D Murin / Elisabeth K Nyakatura / Dafna M Abelson / J Maximilian Fels / Shihua He / Rebekah M James / Marc-Antoine de La Vega / Wenjun Zhu / Russell R Bakken / Eileen Goodwin / Hannah L Turner / Rohit K Jangra / Larry Zeitlin / Xiangguo Qiu / Jonathan R Lai / Laura M Walker / Andrew B Ward / John M Dye / Kartik Chandran / Zachary A Bornholdt /
PubMed 要旨Experimental monoclonal antibody (mAb) therapies have shown promise for treatment of lethal Ebola virus (EBOV) infections, but their species-specific recognition of the viral glycoprotein (GP) has ...Experimental monoclonal antibody (mAb) therapies have shown promise for treatment of lethal Ebola virus (EBOV) infections, but their species-specific recognition of the viral glycoprotein (GP) has limited their use against other divergent ebolaviruses associated with human disease. Here, we mined the human immune response to natural EBOV infection and identified mAbs with exceptionally potent pan-ebolavirus neutralizing activity and protective efficacy against three virulent ebolaviruses. These mAbs recognize an inter-protomer epitope in the GP fusion loop, a critical and conserved element of the viral membrane fusion machinery, and neutralize viral entry by targeting a proteolytically primed, fusion-competent GP intermediate (GP) generated in host cell endosomes. Only a few somatic hypermutations are required for broad antiviral activity, and germline-approximating variants display enhanced GP recognition, suggesting that such antibodies could be elicited more efficiently with suitably optimized GP immunogens. Our findings inform the development of both broadly effective immunotherapeutics and vaccines against filoviruses.
リンクCell / PubMed:28525755 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度18.2 - 25.3 Å
構造データ

EMDB-8698:
EBOV GPdMuc:ADI-16061
手法: EM (単粒子) / 解像度: 25.3 Å

EMDB-8699:
EBOV GPdMuc in complex with ADI-15742 Fab
手法: EM (単粒子) / 解像度: 20.8 Å

EMDB-8700:
EBOV GPdMuc:ADI-15878
手法: EM (単粒子) / 解像度: 18.2 Å

EMDB-8701:
EBOV GPdMuc:ADI-15946
手法: EM (単粒子) / 解像度: 24.7 Å

由来
  • Homo sapiens (ヒト)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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