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タイトルMolecular assemblies and pharmacology of cerebellar GABA receptors.
ジャーナル・号・ページProc Natl Acad Sci U S A, Vol. 123, Issue 6, Page e2524504123, Year 2026
掲載日2026年2月10日
著者Chang Sun / Jennifer N Jahncke / Kevin M Wright / Eric Gouaux /
PubMed 要旨GABA receptors (GABARs) mediate fast inhibitory neurotransmission in the brain and are assembled from 19 subunit isoforms into multiple pentameric assemblies. Although α1-containing GABARs are ...GABA receptors (GABARs) mediate fast inhibitory neurotransmission in the brain and are assembled from 19 subunit isoforms into multiple pentameric assemblies. Although α1-containing GABARs are broadly expressed and are pharmacologically important, the molecular diversity of native α1-based assemblies in specific brain regions remains incompletely understood. Here, we use immunofluorescence, mass spectrometry, and cryogenic electron microscopy (cryo-EM) to characterize the spatial distribution, subunit composition, and structural architecture of native α1-containing GABARs in the rat cerebellum. Confocal microscopy reveals robust colocalization of α1 and γ2 subunits across cerebellar layers, including prominent labeling at glomerular synapses. Biochemical purification and proteomic analysis identify a range of α, β, and γ subunits, along with abundant α6 and δ subunits. Using cryo-EM and automated subunit identification, we resolve eight α1-containing receptor assemblies, including the first structure of α6-containing receptors. We further determine the binding mode of the α6-selective pyrazoloquinolinone modulator PZ-II-029 at the α/γ interface, showing ligand-induced expansion of the entire extracellular domain (ECD). Together, our study defines the structure and subunit composition of the α1-containing cerebellar GABARs and elaborates the molecular interactions between native receptors and pyrazoloquinolinone, thereby laying the groundwork for brain region and subunit-specific pharmacology.
リンクProc Natl Acad Sci U S A / PubMed:41650215 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.74 - 2.93 Å
構造データ

EMDB-70872, PDB-9oum:
Native GABA-A receptor from rat cerebella, beta2-alpha1-beta1-alpha6-gamma2 subtype, in complex with GABA and PZ-II-029
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.9 Å

EMDB-70873, PDB-9oun:
Native GABA-A receptor from rat cerebella, beta2-alpha1-beta2-alpha1-gamma2 subtype, in complex with GABA and PZ-II-029
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.74 Å

EMDB-70874, PDB-9ouo:
Native GABA-A receptor from rat cerebella, beta1-alpha1-beta1-alpha1-gamma2 subtype, in complex with GABA and PZ-II-029
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.92 Å

EMDB-70875, PDB-9oup:
Native GABA-A receptor from rat cerebella, beta2-alpha1-beta1-alpha6-gamma2 subtype, in complex with GABA
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.82 Å

EMDB-70876, PDB-9ouq:
Native GABA-A receptor from rat cerebella, beta1-alpha1-beta2-alpha1-gamma2 subtype, in complex with GABA
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.89 Å

EMDB-70877, PDB-9our:
Native GABA-A receptor from rat cerebella, beta2-alpha1-beta2-alpha1-gamma2 subtype, in complex with GABA
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.84 Å

EMDB-70889, PDB-9ov4:
Native GABA-A receptor from rat cerebella, beta1-alpha1-beta2-alpha1-gamma2 subtype, in complex with GABA and PZ-II-029
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.93 Å

化合物

ChemComp-ABU:
GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID / 神経伝達物質, 阻害剤*YM

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose

PDB-1cep:
Unknown entry

由来
  • rattus norvegicus (ドブネズミ)
  • mus musculus (ハツカネズミ)
キーワードMEMBRANE PROTEIN / neurotransmitter receptor / cys-loop receptor / ligand-gated ion channel

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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