[日本語] English
文献
- EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース -

+
検索条件

キーワード
構造解析手法
著者・登録者
ジャーナル
IF

-
Structure paper

タイトルMolecular basis of the higher-order assembly of CatSper.
ジャーナル・号・ページProc Natl Acad Sci U S A, Vol. 123, Issue 2, Page e2510754123, Year 2026
掲載日2026年1月13日
著者Qikui Xu / Shiyi Lin / Qingqing Zhao / Yanfei Ru / Hang Kang / Xuhui Zeng / Min Jiang / Zhen Yan / Jianping Wu /
PubMed 要旨CatSper serves as the primary Ca entry pathway in the principal piece of sperm flagellum and is crucial for sperm motility and fertility. Sperm lacking functional CatSper channels fail to undergo ...CatSper serves as the primary Ca entry pathway in the principal piece of sperm flagellum and is crucial for sperm motility and fertility. Sperm lacking functional CatSper channels fail to undergo hyperactivation during fertilization, leading to complete male infertility. Along the longitudinal axis of the sperm flagellum, staggered CatSper complexes align in a hand-in-hand arrangement, forming a distinctive quadrilinear zigzag arrays known as CatSper nanodomains. However, the molecular details of how CatSper oligomerizes to form such higher-order assembly remain unclear. In this study, we present the cryoelectron microscopy (cryo-EM) structures of native CatSper dimer (~1.5 MDa) and trimer (~2.3 MDa) megacomplexes, which represent the fundamental units of the zigzag array. We reveal the overall configuration of the zigzag assembly by characterizing the two distinct dimer interfaces that mediate CatSper oligomerization. Specifically, we elucidate the interaction details of two extracellular interfaces formed by CATSPERβ and CATSPERγ at the two dimer interfaces, respectively, and find that CATSPERη, a recently identified component of CatSper, constitutes the transmembrane interface within one of these dimer interfaces. Functional studies in mice demonstrate that CATSPERη is essential for the formation of functional CatSper on the sperm flagellum, and CATSPERη-deficient sperm fail to hyperactivate during fertilization, resulting in male infertility both in vivo and in vitro. Our data provide insights into the higher-order assembly of CatSper at the molecular level, offering clues for the development of male contraceptives.
リンクProc Natl Acad Sci U S A / PubMed:41490491 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.0 - 6.8 Å
構造データ

EMDB-64017: The overall cryo-EM map of the mouse CatSper dimer
PDB-9ubw: The atomic coordinates of the mouse CatSper dimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.9 Å

EMDB-64018: The local cryo-EM map of CATSPERBeta of Monomer A of the CatSper dimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

EMDB-64019: The local cryo-EM map of CATSPERGamma of Monomer A of the CatSper dimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.1 Å

EMDB-64020: The local cryo-EM map of CATSPERDelta of Monomer A of the CatSper dimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.3 Å

EMDB-64021: The local cryo-EM map of CATSPEREpsilon of Monomer A of the CatSper dimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.4 Å

EMDB-64022: The local cryo-EM map of CATSPERBeta of Monomer B of the CatSper dimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

EMDB-64023: The local cryo-EM map of CATSPERGamma of Monomer B of the CatSper dimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.0 Å

EMDB-64024: The local cryo-EM map of CATSPERDelta of Monomer B of the CatSper dimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

EMDB-64025: The local cryo-EM map of CATSPEREpsilon of Monomer B of the CatSper dimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

EMDB-64026: The local cryo-EM map of the transmembrane region of the CatSper dimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.5 Å

EMDB-64027: The local cryo-EM map of the eta-eta interface of the CatSper dimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.6 Å

EMDB-64028: The overall cryo-EM map of the mouse CatSper trimer
PDB-9ubx: The atomic coordinates of the mouse CatSper trimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 6.8 Å

EMDB-64029: The local cryo-EM map of the extracellular region of Monomer A of the CatSper trimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.6 Å

EMDB-64030: The local cryo-EM map of the extracellular region of the Monomers B and A' of the CatSper trimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.0 Å

EMDB-64031: The local cryo-EM map of the gamma-gamma interface of the CatSper trimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.4 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose

ChemComp-CLR:
CHOLESTEROL

由来
  • mus musculus (ハツカネズミ)
キーワードPROTEIN TRANSPORT / sperm / hyperactivation / calcium channel

+
万見文献について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見文献

EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース

  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る