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タイトルStructural basis for cooperativity of human monoclonal antibodies to meningococcal factor H-binding protein.
ジャーナル・号・ページCommun Biol, Vol. 2, Page 241, Year 2019
掲載日2019年6月26日
著者Ilaria Peschiera / Maria Giuliani / Fabiola Giusti / Roberto Melero / Eugenio Paccagnini / Danilo Donnarumma / Werner Pansegrau / José M Carazo / Carlos O S Sorzano / Maria Scarselli / Vega Masignani / Lassi J Liljeroos / Ilaria Ferlenghi /
PubMed 要旨Monoclonal antibody (mAb) cooperativity is a phenomenon triggered when mAbs couples promote increased bactericidal killing compared to individual partners. Cooperativity has been deeply investigated ...Monoclonal antibody (mAb) cooperativity is a phenomenon triggered when mAbs couples promote increased bactericidal killing compared to individual partners. Cooperativity has been deeply investigated among mAbs elicited by factor H-binding protein (fHbp), a surface-exposed lipoprotein and one of the key antigens included in both serogroup B meningococcus vaccine Bexsero and Trumenba. Here we report the structural and functional characterization of two cooperative mAbs pairs isolated from Bexsero vaccines. The 3D electron microscopy structures of the human mAb-fHbp-mAb cooperative complexes indicate that the angle formed between the antigen binding fragments (fAbs) assume regular angle and that fHbp is able to bind simultaneously and stably the cooperative mAbs pairs and human factor H (fH) in vitro. These findings shed light on molecular basis of the antibody-based mechanism of protection driven by simultaneous recognition of the different epitopes of the fHbp and underline that cooperativity is crucial in vaccine efficacy.
リンクCommun Biol / PubMed:31263785 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度23.0 - 28.0 Å
構造データ

EMDB-4713:
Negative staining of antibodies cooperative complex formed by human fab7B10 and fab2C1 bound to the N. meningitidis antigen factor H binding protein (fHbp)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 23.0 Å

EMDB-4714:
Negative staining of antibodies cooperative complex formed by human IgG1 mAb7B10 and mAb2C1 bound to the N. meningitidis antigen factor H binding protein (fHbp)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 28.0 Å

EMDB-4715:
Negative staining of antibodies cooperative complex formed by human IgG1 mAb1A3 and mAb1A12 bound to the N. meningitidis antigen factor H binding protein (fHbp)
手法: EM (単粒子) / 解像度: 26.0 Å

由来
  • Homo sapiens (ヒト)
  • Neisseria meningitidis serogroup B (髄膜炎菌)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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