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タイトルVaccination with different group 2 influenza subtypes alters epitope targeting and breadth of hemagglutinin stem-specific human B cells.
ジャーナル・号・ページSci Transl Med, Vol. 17, Issue 779, Page eadr8373, Year 2025
掲載日2025年1月1日
著者Grace E Mantus / Ankita J Chopde / Jason Gorman / Lauren Y Cominsky / Amine Ourahmane / Adrian Creanga / Geoffrey D Shimberg / Rebecca A Gillespie / David J Van Wazer / Tongqing Zhou / Suprabhath R Gajjala / Connor Williams / Emma Maestle / Douglas S Reed / Leonid Serebryannyy / Pamela Costner / Lasonji Holman / Joseph P Casazza / Richard A Koup / Lesia K Dropulic / Peter D Kwong / Adrian B McDermott / Masaru Kanekiyo / Sarah F Andrews /
PubMed 要旨The conserved influenza hemagglutinin stem, which is a target of cross-neutralizing antibodies, is now used in vaccine strategies focused on protecting against influenza pandemics. Antibody responses ...The conserved influenza hemagglutinin stem, which is a target of cross-neutralizing antibodies, is now used in vaccine strategies focused on protecting against influenza pandemics. Antibody responses to group 1 stem have been extensively characterized, but little is known about group 2. Here, we characterized the stem-specific repertoire of individuals vaccinated with one of three group 2 influenza subtypes (H3, H7, or H10). Epitope mapping revealed two epitope supersites on the group 2 stem. Antibodies targeting the central epitope were broadly cross-reactive, whereas antibodies targeting the lower epitope had narrower breadth but higher potency against H3 subtypes. The ratio of B cells targeting each of the supersites varied with the vaccine subtype, leading to differences in the cross-reactivity of the B cell response. Our findings suggest that vaccine strategies targeting both group 2 stem epitopes would be complementary, eliciting broader and more potent protection against both seasonal and pandemic influenza strains.
リンクSci Transl Med / PubMed:39742506
手法EM (単粒子)
解像度3.65 - 3.96 Å
構造データ

44901

9bu6

EMDB-44901, PDB-9bu6:
Vaccine elicited Fab C968.180 with influenza H10 JD13 HA trimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.65 Å

44903

9bu8

EMDB-44903, PDB-9bu8:
Vaccine elicited Fab c115.131 with influenza H10 JD13 HA trimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.96 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose

由来
  • influenza a virus (A型インフルエンザウイルス)
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードVIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM / Vaccine / VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex / IMMUNE SYSTEM

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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