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Structure paper

タイトルStructure of mavacamten-free human cardiac thick filaments within the sarcomere by cryoelectron tomography.
ジャーナル・号・ページProc Natl Acad Sci U S A, Vol. 121, Issue 9, Page e2311883121, Year 2024
掲載日2024年2月27日
著者Liang Chen / Jun Liu / Hosna Rastegarpouyani / Paul M L Janssen / Jose R Pinto / Kenneth A Taylor /
PubMed 要旨Heart muscle has the unique property that it can never rest; all cardiomyocytes contract with each heartbeat which requires a complex control mechanism to regulate cardiac output to physiological ...Heart muscle has the unique property that it can never rest; all cardiomyocytes contract with each heartbeat which requires a complex control mechanism to regulate cardiac output to physiological requirements. Changes in calcium concentration regulate the thin filament activation. A separate but linked mechanism regulates the thick filament activation, which frees sufficient myosin heads to bind the thin filament, thereby producing the required force. Thick filaments contain additional nonmyosin proteins, myosin-binding protein C and titin, the latter being the protein that transmits applied tension to the thick filament. How these three proteins interact to control thick filament activation is poorly understood. Here, we show using 3-D image reconstruction of frozen-hydrated human cardiac muscle myofibrils lacking exogenous drugs that the thick filament is structured to provide three levels of myosin activation corresponding to the three crowns of myosin heads in each 429Å repeat. In one crown, the myosin heads are almost completely activated and disordered. In another crown, many myosin heads are inactive, ordered into a structure called the interacting heads motif. At the third crown, the myosin heads are ordered into the interacting heads motif, but the stability of that motif is affected by myosin-binding protein C. We think that this hierarchy of control explains many of the effects of length-dependent activation as well as stretch activation in cardiac muscle control.
リンクProc Natl Acad Sci U S A / PubMed:38386705 / PubMed Central
手法EM (サブトモグラム平均)
解像度16.5 - 26.4 Å
構造データ

EMDB-40468: In situ human cardiac thick filament in the relaxed state
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 16.5 Å

EMDB-40471: Human cardiac interacting heads motif (IHM-C) in complete form
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 20.3 Å

EMDB-40475: Human cardiac interacting heads motif (IHM-C) in semi form
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 22.7 Å

EMDB-40476: Human cardiac interacting heads motif (IHM-S)
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 21.7 Å

EMDB-40478: Human cardiac interacting heads motif (IHM-D) in semi form
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 26.4 Å

由来
  • Homo sapiens (ヒト)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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