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Structure paper

タイトルStructural basis for sugar perception by gustatory receptors.
ジャーナル・号・ページScience, Vol. 383, Issue 6685, Page eadj2609, Year 2024
掲載日2024年2月23日
著者Demin Ma / Meiqin Hu / Xiaotong Yang / Qiang Liu / Fan Ye / Weijie Cai / Yong Wang / Ximing Xu / Shenghai Chang / Ruiying Wang / Wei Yang / Sheng Ye / Nannan Su / Minrui Fan / Haoxing Xu / Jiangtao Guo /
PubMed 要旨Insects rely on a family of seven transmembrane proteins called gustatory receptors (GRs) to encode different taste modalities, such as sweet and bitter. We report structures of sweet taste ...Insects rely on a family of seven transmembrane proteins called gustatory receptors (GRs) to encode different taste modalities, such as sweet and bitter. We report structures of sweet taste receptors GR43a and GR64a in the apo and sugar-bound states. Both GRs form tetrameric sugar-gated cation channels composed of one central pore domain (PD) and four peripheral ligand-binding domains (LBDs). Whereas GR43a is specifically activated by the monosaccharide fructose that binds to a narrow pocket in LBDs, disaccharides sucrose and maltose selectively activate GR64a by binding to a larger and flatter pocket in LBDs. Sugar binding to LBDs induces local conformational changes, which are subsequently transferred to the PD to cause channel opening. Our studies reveal a structural basis for sugar recognition and activation of GRs.
リンクScience / PubMed:38305684
手法EM (単粒子)
解像度2.5 - 3.1 Å
構造データ

EMDB-36410, PDB-8jm9:
The cryo-EM structure of insect gustatory receptor Gr43a from Drosophila melanogaster
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.6 Å

EMDB-36411, PDB-8jma:
The cryo-EM structure of insect gustatory receptor Gr43a from Drosophila melanogaster in complex with fructose
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.5 Å

EMDB-36417, PDB-8jme:
The cryo-EM structure of insect gustatory receptor Gr64a from Drosophila melanogaster
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.5 Å

EMDB-36421, PDB-8jmh:
The cryo-EM structure of insect gustatory receptor Gr64a from Drosophila melanogaster in complex with sucrose
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.5 Å

EMDB-36422, PDB-8jmi:
The cryo-EM structure of insect gustatory receptor Gr64a from Drosophila melanogaster in complex with maltose
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.6 Å

EMDB-38133, PDB-8x82:
The cryo-EM structure of insect gustatory receptor Gr43a I418A from Drosophila melanogaster
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.8 Å

EMDB-38134, PDB-8x83:
The cryo-EM structure of insect gustatory receptor Gr43a I418A from Drosophila melanogaster in complex with fructose
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.8 Å

EMDB-38135, PDB-8x84:
The cryo-EM structure of insect gustatory receptor Gr43a I418A from Drosophila melanogaster in complex with fructose and calcium
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.1 Å

化合物

ChemComp-FRU:
beta-D-fructofuranose / β-D-フルクトフラノ-ス

ChemComp-NA:
Unknown entry / ナトリウムカチオン

ChemComp-HOH:
WATER

ChemComp-CA:
Unknown entry / カルシウムジカチオン

由来
  • drosophila melanogaster (キイロショウジョウバエ)
キーワードMEMBRANE PROTEIN / gustatory receptor / Gr43a / ligand-gated ion channel / fructose / Gr64a / sucrose / maltose

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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