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タイトルStructural and signaling mechanisms of TAAR1 enabled preferential agonist design.
ジャーナル・号・ページCell, Vol. 186, Issue 24, Page 5347-5362.e24, Year 2023
掲載日2023年11月22日
著者Pan Shang / Naikang Rong / Jing-Jing Jiang / Jie Cheng / Ming-Hui Zhang / Dongwei Kang / Lei Qi / Lulu Guo / Gong-Ming Yang / Qun Liu / Zhenzhen Zhou / Xiao-Bing Li / Kong-Kai Zhu / Qing-Biao Meng / Xiang Han / Wenqi Yan / Yalei Kong / Lejin Yang / Xiaohui Wang / Dapeng Lei / Xin Feng / Xinyong Liu / Xiao Yu / Yue Wang / Qian Li / Zhen-Hua Shao / Fan Yang / Jin-Peng Sun /
PubMed 要旨Trace amine-associated receptor 1 (TAAR1) senses a spectrum of endogenous amine-containing metabolites (EAMs) to mediate diverse psychological functions and is useful for schizophrenia treatment ...Trace amine-associated receptor 1 (TAAR1) senses a spectrum of endogenous amine-containing metabolites (EAMs) to mediate diverse psychological functions and is useful for schizophrenia treatment without the side effects of catalepsy. Here, we systematically profiled the signaling properties of TAAR1 activation and present nine structures of TAAR1-Gs/Gq in complex with EAMs, clinical drugs, and synthetic compounds. These structures not only revealed the primary amine recognition pocket (PARP) harboring the conserved acidic D for conserved amine recognition and "twin" toggle switch for receptor activation but also elucidated that targeting specific residues in the second binding pocket (SBP) allowed modulation of signaling preference. In addition to traditional drug-induced Gs signaling, Gq activation by EAM or synthetic compounds is beneficial to schizophrenia treatment. Our results provided a structural and signaling framework for molecular recognition by TAAR1, which afforded structural templates and signal clues for TAAR1-targeted candidate compounds design.
リンクCell / PubMed:37963465
手法EM (単粒子)
解像度2.9 - 3.48 Å
構造データ

EMDB-37429, PDB-8wc3:
Cryo-EM structure of the SEP363856-bound mTAAR1-Gs complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.0 Å

EMDB-37430, PDB-8wc4:
Cryo-EM structure of the ZH8651-bound mTAAR1-Gs complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.1 Å

EMDB-37431, PDB-8wc5:
Cryo-EM structure of the TMA-bound mTAAR1-Gs complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.3 Å

EMDB-37432, PDB-8wc6:
Cryo-EM structure of the PEA-bound mTAAR1-Gs complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

EMDB-37433, PDB-8wc7:
Cryo-EM structure of the ZH8667-bound mTAAR1-Gs complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.1 Å

EMDB-37434, PDB-8wc8:
Cryo-EM structure of the ZH8651-bound hTAAR1-Gs complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.9 Å

EMDB-37435, PDB-8wc9:
Cryo-EM structure of the ZH8651-bound mTAAR1-Gq complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

EMDB-37436, PDB-8wca:
Cryo-EM structure of the PEA-bound hTAAR1-Gs complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.48 Å

EMDB-37437, PDB-8wcb:
Cryo-EM structure of the CHA-bound mTAAR1-Gq complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.1 Å

EMDB-37438, PDB-8wcc:
Cryo-EM structure of the CHA-bound mTAAR1 complex
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.04 Å

化合物

ChemComp-UJL:
1-[(7~{S})-5,7-dihydro-4~{H}-thieno[2,3-c]pyran-7-yl]-~{N}-methyl-methanamine

ChemComp-VMT:
2-(4-bromophenyl)ethanamine / 4-ブロモフェネチルアミン

ChemComp-TMA:
TETRAMETHYLAMMONIUM ION / テトラメチルアンモニウム

ChemComp-PEA:
2-PHENYLETHYLAMINE / フェネチルアンモニウム / alkaloid*YM

ChemComp-VMK:
2-[4-(3-fluorophenyl)phenyl]ethanamine

ChemComp-HAI:
CYCLOHEXYLAMMONIUM ION / シクロヘキシルアミニウム

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • mus musculus (ハツカネズミ)
  • synthetic construct (人工物)
キーワードMEMBRANE PROTEIN / SEP363856 / mTAAR1 / ZH8651 / Gq / TMA / PEA / ZH8667 / hTAAR1 / Gs / CHA

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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