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タイトルCo-immunization with hemagglutinin stem immunogens elicits cross-group neutralizing antibodies and broad protection against influenza A viruses.
ジャーナル・号・ページImmunity, Vol. 55, Issue 12, Page 2405-22418.e7, Year 2022
掲載日2022年12月13日
著者Syed M Moin / Jeffrey C Boyington / Seyhan Boyoglu-Barnum / Rebecca A Gillespie / Gabriele Cerutti / Crystal Sao-Fong Cheung / Alberto Cagigi / John R Gallagher / Joshua Brand / Madhu Prabhakaran / Yaroslav Tsybovsky / Tyler Stephens / Brian E Fisher / Adrian Creanga / Sila Ataca / Reda Rawi / Kizzmekia S Corbett / Michelle C Crank / Gunilla B Karlsson Hedestam / Jason Gorman / Adrian B McDermott / Audray K Harris / Tongqing Zhou / Peter D Kwong / Lawrence Shapiro / John R Mascola / Barney S Graham / Masaru Kanekiyo /
PubMed 要旨Current influenza vaccines predominantly induce immunity to the hypervariable hemagglutinin (HA) head, requiring frequent vaccine reformulation. Conversely, the immunosubdominant yet conserved HA ...Current influenza vaccines predominantly induce immunity to the hypervariable hemagglutinin (HA) head, requiring frequent vaccine reformulation. Conversely, the immunosubdominant yet conserved HA stem harbors a supersite that is targeted by broadly neutralizing antibodies (bnAbs), representing a prime target for universal vaccines. Here, we showed that the co-immunization of two HA stem immunogens derived from group 1 and 2 influenza A viruses elicits cross-group protective immunity and neutralizing antibody responses in mice, ferrets, and nonhuman primates (NHPs). Immunized mice were protected from multiple group 1 and 2 viruses, and all animal models showed broad serum-neutralizing activity. A bnAb isolated from an immunized NHP broadly neutralized and protected against diverse viruses, including H5N1 and H7N9. Genetic and structural analyses revealed strong homology between macaque and human bnAbs, illustrating common biophysical constraints for acquiring cross-group specificity. Vaccine elicitation of stem-directed cross-group-protective immunity represents a step toward the development of broadly protective influenza vaccines.
リンクImmunity / PubMed:36356572 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.85 - 4.8 Å
構造データ

22302

6xsk

EMDB-22302: Cryo-EM structure of vaccine-elicited Rhesus VH6-1 antibody 789-203-3C12 in complex with stabilized SI06 (A/Solomon Islands/3/06) Influenza Hemagglutinin Trimer
PDB-6xsk: Cryo-EM Structure of Vaccine-Elicited Rhesus Antibody 789-203-3C12 in Complex with Stabilized SI06 (A/Solomon Islands/3/06) Influenza Hemagglutinin Trimer
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.85 Å

EMDB-26044: H10ssF: ferritin-based nanoparticle displaying H10 hemagglutinin stabilized stem epitopes
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.8 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-アセチル-β-D-グルコサミン

由来
  • macaca mulatta (アカゲザル)
  • influenza a virus (a/solomon islands/3/2006(h1n1)) (A型インフルエンザウイルス)
  • Influenza A virus (A型インフルエンザウイルス)
  • Helicobacter pylori (ピロリ菌)
キーワードIMMUNE SYSTEM/Viral Protein / Hemagglutinin ectodomain / Prefusion conformation / Vaccine-elicited antibody / Disulfide-stabilized trimer / IMMUNE SYSTEM / IMMUNE SYSTEM-Viral Protein complex

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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