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タイトルInfluenza hemagglutinin-specific IgA Fc-effector functionality is restricted to stalk epitopes.
ジャーナル・号・ページProc Natl Acad Sci U S A, Vol. 118, Issue 8, Year 2021
掲載日2021年2月23日
著者Alec W Freyn / Julianna Han / Jenna J Guthmiller / Mark J Bailey / Karlynn Neu / Hannah L Turner / Victoria C Rosado / Veronika Chromikova / Min Huang / Shirin Strohmeier / Sean T H Liu / Viviana Simon / Florian Krammer / Andrew B Ward / Peter Palese / Patrick C Wilson / Raffael Nachbagauer /
PubMed 要旨In this study, we utilized a panel of human immunoglobulin (Ig) IgA monoclonal antibodies isolated from the plasmablasts of eight donors after 2014/2015 influenza virus vaccination (Fluarix) to study ...In this study, we utilized a panel of human immunoglobulin (Ig) IgA monoclonal antibodies isolated from the plasmablasts of eight donors after 2014/2015 influenza virus vaccination (Fluarix) to study the binding and functional specificities of this isotype. In this cohort, isolated IgA monoclonal antibodies were primarily elicited against the hemagglutinin protein of the H1N1 component of the vaccine. To compare effector functionalities, an H1-specific subset of antibodies targeting distinct epitopes were expressed as monomeric, dimeric, or secretory IgA, as well as in an IgG1 backbone. When expressed with an IgG Fc domain, all antibodies elicited Fc-effector activity in a primary polymorphonuclear cell-based assay which differs from previous observations that found only stalk-specific antibodies activate the low-affinity FcγRIIIa. However, when expressed with IgA Fc domains, only antibodies targeting the stalk domain showed Fc-effector activity in line with these previous findings. To identify the cause of this discrepancy, we then confirmed that IgG signaling through the high-affinity FcγI receptor was not restricted to stalk epitopes. Since no corresponding high-affinity Fcα receptor exists, the IgA repertoire may therefore be limited to stalk-specific epitopes in the context of Fc receptor signaling.
リンクProc Natl Acad Sci U S A / PubMed:33593910 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.72 - 25.0 Å
構造データ

EMDB-23313:
Negative stain map of monoclonal Fab 23 binding the lateral patch of H1 HA
手法: EM (単粒子) / 解像度: 25.0 Å

EMDB-23314:
Negative stain map of monoclonal Fab 45 binding the esterase domain of H1 HA
手法: EM (単粒子) / 解像度: 25.0 Å

EMDB-23315:
Negative stain map of monoclonal Fab 50 binding the lateral patch of H1 HA
手法: EM (単粒子) / 解像度: 25.0 Å

EMDB-23316:
Negative stain map of monoclonal Fab 56 binding the lateral patch of H1 HA
手法: EM (単粒子) / 解像度: 25.0 Å

EMDB-23317:
Negative stain map of monoclonal Fab 68 binding the Sa antigenic site of H1 HA
手法: EM (単粒子) / 解像度: 25.0 Å

EMDB-23318:
Negative stain map of monoclonal Fab 76 binding the stem of H1 HA
手法: EM (単粒子) / 解像度: 25.0 Å

EMDB-23319:
CryoEM map of monoclonal Fabs 45 and 56 binding the esterase and lateral patch of H1 HA
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.72 Å

由来
  • Homo sapiens (ヒト)
  • Influenza A virus (A型インフルエンザウイルス)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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