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タイトルHost ANP32A mediates the assembly of the influenza virus replicase.
ジャーナル・号・ページNature, Vol. 587, Issue 7835, Page 638-643, Year 2020
掲載日2020年11月18日
著者Loïc Carrique / Haitian Fan / Alexander P Walker / Jeremy R Keown / Jane Sharps / Ecco Staller / Wendy S Barclay / Ervin Fodor / Jonathan M Grimes /
PubMed 要旨Aquatic birds represent a vast reservoir from which new pandemic influenza A viruses can emerge. Influenza viruses contain a negative-sense segmented RNA genome that is transcribed and replicated by ...Aquatic birds represent a vast reservoir from which new pandemic influenza A viruses can emerge. Influenza viruses contain a negative-sense segmented RNA genome that is transcribed and replicated by the viral heterotrimeric RNA polymerase (FluPol) in the context of viral ribonucleoprotein complexes. RNA polymerases of avian influenza A viruses (FluPolA) replicate viral RNA inefficiently in human cells because of species-specific differences in acidic nuclear phosphoprotein 32 (ANP32), a family of essential host proteins for FluPol activity. Host-adaptive mutations, particularly a glutamic-acid-to-lysine mutation at amino acid residue 627 (E627K) in the 627 domain of the PB2 subunit, enable avian FluPolA to overcome this restriction and efficiently replicate viral RNA in the presence of human ANP32 proteins. However, the molecular mechanisms of genome replication and the interplay with ANP32 proteins remain largely unknown. Here we report cryo-electron microscopy structures of influenza C virus polymerase (FluPolC) in complex with human and chicken ANP32A. In both structures, two FluPolC molecules form an asymmetric dimer bridged by the N-terminal leucine-rich repeat domain of ANP32A. The C-terminal low-complexity acidic region of ANP32A inserts between the two juxtaposed PB2 627 domains of the asymmetric FluPolA dimer, suggesting a mechanism for how the adaptive PB2(E627K) mutation enables the replication of viral RNA in mammalian hosts. We propose that this complex represents a replication platform for the viral RNA genome, in which one of the FluPol molecules acts as a replicase while the other initiates the assembly of the nascent replication product into a viral ribonucleoprotein complex.
リンクNature / PubMed:33208942 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.2 - 3.8 Å
構造データ

10659

6xzd

EMDB-10659, PDB-6xzd:
Influenza C virus polymerase complex without chicken ANP32A - Subclass 2
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.4 Å

10662

6xzg

EMDB-10662, PDB-6xzg:
Influenza C virus polymerase in complex with chicken ANP32A - Subclass 3
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.8 Å

10664

6xzp

EMDB-10664, PDB-6xzp:
Influenza C virus polymerase in complex with chicken ANP32A - Subclass 4
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.3 Å

10665

6xzq

EMDB-10665, PDB-6xzq:
Influenza C virus polymerase in complex with human ANP32A - Subclass 1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.6 Å

10666

6xzr

EMDB-10666, PDB-6xzr:
Influenza C virus polymerase in complex with chicken ANP32A - Subclass 1
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.3 Å

10667

6y0c

EMDB-10667, PDB-6y0c:
Influenza C virus polymerase in complex with human ANP32A - Subclass 2
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.2 Å

由来
  • influenza c virus (c/johannesburg/1/66) (インフルエンザウイルス)
  • synthetic construct (人工物)
  • influenza c virus (strain c/johannesburg/1/1966) (インフルエンザウイルス)
  • gallus gallus (ニワトリ)
  • homo sapiens (ヒト)
  • influenza a virus (a/nt/60/1968(h3n2)) (A型インフルエンザウイルス)
キーワードVIRAL PROTEIN (ウイルスタンパク質) / Influenza Polymerase / ANP32 / replication (DNA複製) / RNA-dependent RNA polymerase (RNA依存性RNAポリメラーゼ)

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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