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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Congeneric but still distinct: how closely related trypsin ligands exhibit different thermodynamic and structural properties
ジャーナル・号・ページ	J. Mol. Biol., Vol. 405, Page 1170-1187, Year 2011
掲載日	2007年11月26日 (構造データの登録日)
著者	Brandt, T. / Holzmann, N. / Muley, L. / Khayat, M. / Wegscheid-Gerlach, C. / Baum, B. / Heine, A. / Hangauer, D. / Klebe, G.
リンク	J. Mol. Biol. / PubMed:21111747
手法	X線回折
解像度	1.4 - 1.98 Å
構造データ	PDB-2zdk: Exploring Trypsin S3 Pocket 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.67 Å PDB-2zdl: Exploring trypsin S3 pocket 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.8 Å PDB-2zdm: Exploring trypsin S3 pocket 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.93 Å PDB-2zdn: Exploring trypsin S3 pocket 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.98 Å PDB-2zfs: Exploring trypsin S3 pocket 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.51 Å PDB-2zft: Exploring trypsin S3 pocket 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.76 Å PDB-2zhd: Exploring trypsin S3 pocket 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.94 Å PDB-2zq1: Exploring trypsin S3 pocket 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.68 Å PDB-2zq2: Exploring trypsin S3 pocket 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.4 Å PDB-3ljj: Bovine trypsin in complex with UB-THR 10 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.55 Å PDB-3ljo: Bovine trypsin in complex with UB-THR 11 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.5 Å
化合物	ChemComp-CA: Unknown entry / カルシウムジカチオン ChemComp-SO4: SULFATE ION / 硫酸ジアニオン / 硫酸塩 ChemComp-50U: (S)-N-(4-carbamimidoylbenzyl)-1-(3-cyclohexylpropanoyl)pyrrolidine-2-carboxamide ChemComp-DMS: DIMETHYL SULFOXIDE / 2-チアプロパン2-オキシド / DMSO, 沈殿剤YM / ジメチルスルホキシド ChemComp-GOL: GLYCEROL / グリセロ-ル / グリセリン ChemComp-HOH: WATER / 水 ChemComp-45U: (S)-N-(4-carbamimidoylbenzyl)-1-(2-(cyclopentyloxy)ethanoyl)pyrrolidine-2-carboxamide ChemComp-46U: (S)-N-(4-carbamimidoylbenzyl)-1-(2-(cyclohexyloxy)ethanoyl)pyrrolidine-2-carboxamide ChemComp-49U: (S)-N-(4-carbamimidoylbenzyl)-1-(3-cyclopentylpropanoyl)pyrrolidine-2-carboxamide ChemComp-12U: N-cycloheptylglycyl-N-(4-carbamimidoylbenzyl)-L-prolinamide ChemComp-10U: (S)-N-(4-carbamimidoylbenzyl)-1-(2-(cyclopentylamino)ethanoyl)pyrrolidine-2-carboxamide / 4-(N-シクロペンチル-Gly-Pro-アミノメチル)ベンズアミジン ChemComp-11U: (S)-N-(4-carbamimidoylbenzyl)-1-(2-(cyclohexylamino)ethanoyl)pyrrolidine-2-carboxamide / 4-(N-シクロヘキシル-Gly-Pro-アミノメチル)ベンズアミジン ChemComp-13U*: N-cyclooctylglycyl-N-(4-carbamimidoylbenzyl)-L-prolinamide
由来	bos taurus (ウシ)
キーワード	Hydrolase/Hydrolase Inhibitor / Hydrolase Inhibitors / Digestion (消化) / Metal-binding / Protease (プロテアーゼ) / Secreted (分泌) / Serine protease (セリンプロテアーゼ) / Zymogen (酵素前駆体) / Hydrolase-Hydrolase Inhibitor complex / Hydrolase (加水分解酵素)