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Structure paper

タイトルSARM1 senses dsDNA to promote NAD degradation and cell death.
ジャーナル・号・ページCell, Vol. 188, Issue 25, Page 7137-7154.e21, Year 2025
掲載日2025年12月11日
著者Lina Wang / Qiaoling Liu / Siru Li / Na Wang / Yan Chen / Junren Chen / Li Wang / Yuelin Huang / Zhen Sun / Ling Dong / Shao Li / Quentin Liu / Song Gao / Xiaochi Ma / Chengli Song / Qingkai Yang /
PubMed 要旨Detection of DNA is a fundamental strategy for life to recognize non-self or abnormal-self to subsequently trigger the downstream responses. However, the mechanism underlying DNA sensing is ...Detection of DNA is a fundamental strategy for life to recognize non-self or abnormal-self to subsequently trigger the downstream responses. However, the mechanism underlying DNA sensing is incompletely understood. Here, we show that a key neural executioner, sterile alpha and Toll/interleukin-1 receptor (TIR) motif containing 1 (SARM1), senses double-stranded DNA (dsDNA) to promote cell death. dsDNA-bound and -activated SARM1 to degrade nicotinamide adenine dinucleotide (NAD) in a sequence-independent manner. SARM1 bound dsDNA via the TIR domain, and lysine residues in the TIR domain contributed to dsDNA binding. In the cellular context, cytosolic dsDNA from dsDNA transfection or chemotherapy treatment was colocalized with SARM1 and activated SARM1 to elicit NAD degradation and cell death, which was abrogated by SARM1 knockout or DNA-binding residue mutation. Consistently, SARM1 knockout blocked chemotherapy-induced neuropathy (CIN) in mice. Our results reveal SARM1 as a DNA sensor, which might be targetable for therapeutic interventions.
リンクCell / PubMed:41138726
手法EM (単粒子)
解像度3.06 Å
構造データ

64134

9uga

EMDB-64134, PDB-9uga:
SARM1 senses DNA to promote NAD degradation
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.06 Å

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードHYDROLASE / DNA BINDING PROTEIN / OCTAMER

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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