[日本語] English
万見文献
- EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース -

+
検索条件

キーワード
構造解析手法
著者・登録者
ジャーナル
IF

-
Structure paper

タイトルAglycone Polyether Ionophores Affecting Actin Filaments as Broad-Spectrum Antiviral Agents.
ジャーナル・号・ページACS Pharmacol Transl Sci, Vol. 8, Issue 7, Page 2018-2032, Year 2025
掲載日2025年7月11日
著者Minjian Huang / Jiaqi Li / Jing Li / Ben Hu / Ran Liu / Lianghao Huang / Caiqian Wang / Rong Hua / Chuanjian Wu / Zhuli Li / Zherui Zhang / Yanan Zhang / Yingjun Wu / Qiuyan Zhang / Yong Wang / Jing Liu / Zixin Deng / Wei Wang / Wei Hou / Ling Zhao / Yucheng Xia / Xiaolian Zhang / Longfei Wang / Bo Zhang / Tiangang Liu /
PubMed 要旨RNA viruses have high mutation rates and constitute an increasing global risk. As the viral target approach to develop antiviral drugs is inadequate for responding to an increasing diversity of ...RNA viruses have high mutation rates and constitute an increasing global risk. As the viral target approach to develop antiviral drugs is inadequate for responding to an increasing diversity of viruses, an urgent need exists for the development of new antivirals to prevent future outbreaks. Here, we show that aglycone ionophores maduramycin (Mad) and endusamycin (End) from are broadly virucidal against cytoplasmic replicated viruses, including Japanese encephalitis virus (JEV), rabies virus, hepatitis C virus, vesicular stomatitis virus, hantavirus, dengue virus, Zika virus, chikungunya virus, and SARS-CoV-2 in vitro. Mechanistic studies suggest Mad and End can target actin filaments and displace the DNase-I-binding loop (D-loop) into an outward conformation for stabilizing actin filaments and primarily inhibit viral replication. Liposome-encapsulated Mad or End fully protects mice against JEV infection in vivo. Thus, our results may provide potential and naturally produced antivirals to prevent the spread of viruses in animals.
リンクACS Pharmacol Transl Sci / PubMed:40672661 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.44 - 2.45 Å
構造データ

38280

8xdl

EMDB-38280, PDB-8xdl:
F-actin-END
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.44 Å

38281

8xdm

EMDB-38281, PDB-8xdm:
F-actin-MAD
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.45 Å

化合物

ChemComp-ADP:
ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / ADP / ADP, エネルギー貯蔵分子*YM

ChemComp-MG:
Unknown entry / マグネシウムジカチオン

由来
  • oryctolagus cuniculus (ウサギ)
キーワードPROTEIN BINDING / aglycone polyether ionophores / anti-tumor

+
万見文献について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見文献

EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース

  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る