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タイトルSingle-domain antibodies directed against hemagglutinin and neuraminidase protect against influenza B viruses.
ジャーナル・号・ページNat Commun, Vol. 16, Issue 1, Page 5831, Year 2025
掲載日2025年7月1日
著者Arne Matthys / Jan Felix / Joao Paulo Portela Catani / Kenny Roose / Wim Nerinckx / Benthe Van Buyten / Daria Fijalkowska / Nico Callewaert / Savvas N Savvides / Xavier Saelens /
PubMed 要旨Influenza B viruses are antigenically diverse and contribute significantly to the annual influenza burden. Here we report influenza B virus neutralizing single-domain antibodies that target highly ...Influenza B viruses are antigenically diverse and contribute significantly to the annual influenza burden. Here we report influenza B virus neutralizing single-domain antibodies that target highly conserved regions of the hemagglutinin and neuraminidase. Structural studies by single particle electron cryo-microscopy (cryo-EM) revealed that one of these single-domain antibodies prevents the conformational transition of the viral hemagglutinin to the post-fusion state by targeting a quaternary epitope spanning two protomers in the hemagglutinin-stem region. A second single-domain antibody broadly inhibits influenza B neuraminidase activity, including an oseltamivir-resistant neuraminidase, and its complex with neuraminidase elucidated by single particle cryo-EM established that it binds to residues in the neuraminidase catalytic site. Head-to-tail fusions of these single-domain antibodies led to bispecific binders that further improved the neutralization breadth and potency against influenza B viruses. These single-domain antibodies, fused to a human IgG1-Fc domain, fully protected female mice against an otherwise lethal influenza B virus challenge. Our findings underscore the potential of engineered single-domain antibodies to help control influenza B virus infections.
リンクNat Commun / PubMed:40593518 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.93 - 3.6 Å
構造データ

50546

9fm1

EMDB-50546, PDB-9fm1:
Cryo-EM structure of Influenza B/Washington/02/2019 virus hemagglutinin in complex with single-domain antibody hVHH-69.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.93 Å

50547

9fm2

EMDB-50547, PDB-9fm2:
Cryo-EM structure of Influenza B/Washington/02/2019 virus neuraminidase in complex with single-domain antibody hVHH-525.
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.6 Å

化合物

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-アセチル-β-D-グルコサミン

由来
  • influenza b virus (B型インフルエンザウイルス)
  • lama glama (ラマ)
キーワードANTIVIRAL PROTEIN / hemagglutinin / single-domain antibody / complex / neuraminidase

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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