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タイトルEstablishing a universal IVRP method for quadrivalent HPV vaccines to replace in vivo potency tests.
ジャーナル・号・ページNPJ Vaccines, Vol. 10, Issue 1, Page 55, Year 2025
掲載日2025年3月22日
著者Jinpan Hu / Zijing Jia / Meng Wang / Lingling Nie / Wangjun Fu / Qingfeng Zhang / Haiyang Qin / Jianhui Nie / Xiaoyu Xu / Lingjie Xu / Fengze Wang / Yingping Chen / Bo Xing / Tao Li / Danfeng Li / Shaowei Li / Ningshao Xia / Xiangxi Wang / Weijin Huang /
PubMed 要旨Several human papillomavirus (HPV) L1-based virus-like particle (VLP) vaccines are in development to meet future global vaccination needs. Type-specific monoclonal antibodies with good reactivity to ...Several human papillomavirus (HPV) L1-based virus-like particle (VLP) vaccines are in development to meet future global vaccination needs. Type-specific monoclonal antibodies with good reactivity to all types of vaccines are urgently needed to evaluate vaccine potency. In this study, binding activity, neutralizing activity, conformational sensitivity, immunodominance in human serum, and versatility were compared among antibodies. A broad-spectrum binding antibody (C4-F5-127) was selected as the capture antibody; four type-specific neutralizing antibodies (6-F5-77, 11-F5-187, 16-F5-196, and 18-F5-203) were selected as detection antibodies for HPV6, 11, 16, and 18, respectively. These antibodies formed a standardized and universal in vitro relative potency (IVRP) assay kit. High-resolution cryo-electron microscopy (cryo-EM) structures of HPV6-6-F5-77, HPV11-11-F5-187, HPV16-16-F5-196 and HPV18-18-F5-203 complexes define the location and nature of epitopes, revealing serotype specific binding modes and neutralization mechanisms. The IVRP results were correlated with potency data from mouse models, offering an efficient alternative to in vivo potency experiments.
リンクNPJ Vaccines / PubMed:40118915 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.86 - 4.3 Å
構造データ

39193

8yef

EMDB-39193, PDB-8yef:
HPV6 L1 pentamer in complex with Fab F5-77
手法: EM (単粒子) / 解像度: 4.3 Å

39194

8yeg

EMDB-39194, PDB-8yeg:
HPV11 L1 pentamer in complex with Fab F5-187
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.1 Å

39195

8yeh

EMDB-39195, PDB-8yeh:
HPV16 L1 pentamer in complex with Fab F5-196
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.86 Å

39196

8yei

EMDB-39196, PDB-8yei:
HPV18 L1 pentamer in complex with Fab F5-203
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.93 Å

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • alphapapillomavirus 10 (パピローマウイルス)
  • human papillomavirus 11 (パピローマウイルス)
  • Human papillomavirus 16 (パピローマウイルス)
  • human papillomavirus type 16 (パピローマウイルス)
  • human papillomavirus 18 (パピローマウイルス)
キーワードVIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM / HPV / L1 / antibody / VIRAL PROTEIN / VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex / HPV16

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

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  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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