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Structure paper

タイトルStructure and function of the human mitochondrial MRS2 channel.
ジャーナル・号・ページNat Struct Mol Biol, Vol. 32, Issue 3, Page 459-468, Year 2025
掲載日2024年11月28日
著者Zhihui He / Yung-Chi Tu / Chen-Wei Tsai / Jonathan Mount / Jingying Zhang / Ming-Feng Tsai / Peng Yuan /
PubMed 要旨The human mitochondrial RNA splicing 2 protein (MRS2) has been implicated in Mg transport across mitochondrial inner membranes, thus having an important role in Mg homeostasis critical for ...The human mitochondrial RNA splicing 2 protein (MRS2) has been implicated in Mg transport across mitochondrial inner membranes, thus having an important role in Mg homeostasis critical for mitochondrial integrity and function. However, the molecular mechanisms underlying its fundamental channel properties such as ion selectivity and regulation remain unclear. Here we present a structural and functional investigation of MRS2. Cryo-electron microscopy structures in various ionic conditions reveal a pentameric channel architecture and the molecular basis of ion permeation and potential regulation mechanisms. Electrophysiological analyses demonstrate that MRS2 is a Ca-regulated, nonselective channel permeable to Mg, Ca, Na and K, which contrasts with its prokaryotic ortholog, CorA, operating as a Mg-gated Mg channel. Moreover, a conserved arginine ring within the pore of MRS2 functions to restrict cation movements, thus preventing the channel from collapsing the proton motive force that drives mitochondrial adenosine triphosphate synthesis. Together, our results provide a molecular framework for further understanding MRS2 in mitochondrial function and disease.
リンクNat Struct Mol Biol / PubMed:39609651 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度2.92 - 3.11 Å
構造データ

41587

8ts1

EMDB-41587, PDB-8ts1:
Cryo-EM structure of human MRS2 with Mg2+
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.92 Å

41588

8ts2

EMDB-41588, PDB-8ts2:
Cryo-EM structure of human MRS2 with EDTA
手法: EM (単粒子) / 解像度: 2.95 Å

41589

8ts3

EMDB-41589, PDB-8ts3:
Cryo-EM structure of human MRS2 with Ca2+
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.11 Å

化合物

ChemComp-MG:
Unknown entry / マグネシウムジカチオン

ChemComp-CA:
Unknown entry / カルシウムジカチオン

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • escherichia coli (大腸菌)
キーワードMETAL TRANSPORT / mitochondria / pentamer / cation channel

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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