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タイトルHuman FcRn Is a Two-in-One Attachment-Uncoating Receptor for Echovirus 18.
ジャーナル・号・ページmBio, Vol. 13, Issue 4, Page e0116622, Year 2022
掲載日2022年8月30日
著者Xiangpeng Chen / Xiao Qu / Congcong Liu / Yong Zhang / Guigen Zhang / Pu Han / Yali Duan / Qi Li / Liang Wang / Wenjing Ruan / Peiyi Wang / Wensheng Wei / George F Gao / Xin Zhao / Zhengde Xie /
PubMed 要旨Virus-receptor interactions determine viral host range and tissue tropism. CD55 and human neonatal Fc receptor (FcRn) were found to be the binding and uncoating receptors for some of the echovirus- ...Virus-receptor interactions determine viral host range and tissue tropism. CD55 and human neonatal Fc receptor (FcRn) were found to be the binding and uncoating receptors for some of the echovirus-related enterovirus species B serotypes in our previous study. Echovirus 18 (E18), as a member of enterovirus species B, is a significant causative agent of aseptic meningitis and viral encephalitis in children. However, it does not use CD55 as a critical host factor. We conducted CRISPR/Cas9 knockout screening to determine the receptors and entry mechanisms and identified FcRn working as a dual-function receptor for E18. Knockout of and , which encode the two subunits of FcRn, prevented infection by E18 and other echoviruses in the same physiological cluster. We then elucidated the underlying molecular mechanism of receptor recognition by E18 using cryogenic electron microscopy. The binding of the FCGRT subunit to the canyon region rotates the residues around the pocket, triggering the release of the pocket factor as observed for other enterovirus species B members. E18 is a member of enterovirus species B. As one of the most common enterovirus serotypes in nonpolio enterovirus detection, it easily infects children and causes various clinical symptoms. Aseptic meningitis and viral encephalitis are the most commonly reported syndromes associated with E18. No effective antiviral drugs or approved vaccines are available. Previous studies showed that CD55 and FcRn were the binding and uncoating receptors for some echoviruses. However, we found that CD55 is not the critical host factor for E18. Thus, we want to determine the receptors and elucidate the entry mechanism of E18. Our findings reveal that FcRn is a two-in-one attachment-uncoating receptor for E18.
リンクmBio / PubMed:35862785 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.09 - 3.37 Å
構造データ

33499

7xxa

EMDB-33499, PDB-7xxa:
Complex of Echo 18 and FcRn at pH7.4
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.09 Å

33502

7xxg

EMDB-33502, PDB-7xxg:
Echo 18 at pH5.5
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.37 Å

33505

7xxj

EMDB-33505, PDB-7xxj:
Echo 18 incubated with FcRn at pH5.5
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.33 Å

化合物

ChemComp-PLM:
PALMITIC ACID / パルミチン酸

由来
  • echovirus e18 (ウイルス)
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードVIRUS / Complex / Receptor / Echo 18 / pH5.5 / RcRn

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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