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キーワード
構造解析手法	All X線回折 NMR 電子顕微鏡小角散乱中性子線回折線維回折粉末回折赤外分光 EPR FRET 理論モデルハイブリッド
著者・登録者
ジャーナル
IF	>30 >20 >10 >5 all

タイトル	Substituent Position of Iminocyclitols Determines the Potency and Selectivity for Gut Microbial Xenobiotic-Reactivating Enzymes.
ジャーナル・号・ページ	J. Med. Chem., Vol. 63, Page 4617-4627, Year 2020
掲載日	2019年4月30日 (構造データの登録日)
著者	Dashnyam, P. / Lin, H.Y. / Chen, C.Y. / Gao, S. / Yeh, L.F. / Hsieh, W.C. / Tu, Z. / Lin, C.H.
リンク	J. Med. Chem. / PubMed:32105467
手法	X線回折
解像度	1.29 - 1.73 Å
構造データ	PDB-6jz1: Apo structure of b-glucuronidase from Ruminococcus gnavus at 1.7 Angstrom resolution 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.73 Å PDB-6jz2: b-glucuronidase from Ruminococcus gnavus in complex with uronic isofagomine at 1.3 Angstroms resolution 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.29 Å PDB-6jz3: b-glucuronidase from Ruminococcus gnavus in complex with uronic deoxynojirimycin 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.502 Å PDB-6jz4: b-glucuronidase from Ruminococcus gnavus in complex with D-glucaro-d-lactam 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.712 Å PDB-6jz5: b-glucuronidase from Ruminococcus gnavus in complex with D-glucuronic acid 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.58 Å PDB-6jz6: b-glucuronidase from Ruminococcus gnavus in complex with C6-substituted uronic isofagomine 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.605 Å PDB-6jz7: b-glucuronidase from Ruminococcus gnavus in complex with N1-substituted uronic isofagomine 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.45 Å PDB-6jz8: b-glucuronidase from Ruminococcus gnavus in complex with D-glucaro 1,5-lactone 手法: X-RAY DIFFRACTION / 解像度: 1.583 Å
化合物	ChemComp-MRD: (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL / (4R)-2-メチル-2,4-ペンタンジオ-ル / 沈殿剤YM ChemComp-HOH: WATER ChemComp-SJ5: (3S,4R,5R)-4,5-dihydroxypiperidine-3-carboxylic acid / (3S)-4β,5α-ジヒドロキシピペリジン-3α-カルボン酸 ChemComp-MPD: (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL / (S)-2-メチル-2,4-ペンタンジオ-ル / 沈殿剤YM ChemComp-CN0: (2~{S},3~{R},4~{R},5~{S})-3,4,5-tris(oxidanyl)piperidine-2-carboxylic acid / 3β,4α,5β-トリヒドロキシピペリジン-2α-カルボン酸 ChemComp-EVA: (2S,3R,4S,5R)-3,4,5-trihydroxy-6-oxopiperidine-2-carboxylic acid / D-グルカロ-1,5-ラクタム ChemComp-BDP: beta-D-glucopyranuronic acid / β-D-グルコピラヌロン酸 ChemComp-CKX: (2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-4,5-bis(oxidanyl)-2-propyl-piperidine-3-carboxylic acid ChemComp-CKU: (3~{S},4~{R},5~{R})-4,5-bis(oxidanyl)-1-propyl-piperidine-3-carboxylic acid ChemComp-GCB: (2S,3S,4S,5R)-3,4,5-trihydroxy-6-oxo-oxane-2-carboxylic acid
由来	[ruminococcus] gnavus (バクテリア) ruminococcus gnavus (バクテリア)
キーワード	HYDROLASE / b-glucuronidase