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タイトルNovel tau filament fold in corticobasal degeneration.
ジャーナル・号・ページNature, Vol. 580, Issue 7802, Page 283-287, Year 2020
掲載日2020年2月12日
著者Wenjuan Zhang / Airi Tarutani / Kathy L Newell / Alexey G Murzin / Tomoyasu Matsubara / Benjamin Falcon / Ruben Vidal / Holly J Garringer / Yang Shi / Takeshi Ikeuchi / Shigeo Murayama / Bernardino Ghetti / Masato Hasegawa / Michel Goedert / Sjors H W Scheres /
PubMed 要旨Corticobasal degeneration (CBD) is a neurodegenerative tauopathy-a class of disorders in which the tau protein forms insoluble inclusions in the brain-that is characterized by motor and cognitive ...Corticobasal degeneration (CBD) is a neurodegenerative tauopathy-a class of disorders in which the tau protein forms insoluble inclusions in the brain-that is characterized by motor and cognitive disturbances. The H1 haplotype of MAPT (the tau gene) is present in cases of CBD at a higher frequency than in controls, and genome-wide association studies have identified additional risk factors. By histology, astrocytic plaques are diagnostic of CBD; by SDS-PAGE, so too are detergent-insoluble, 37 kDa fragments of tau. Like progressive supranuclear palsy, globular glial tauopathy and argyrophilic grain disease, CBD is characterized by abundant filamentous tau inclusions that are made of isoforms with four microtubule-binding repeats. This distinguishes such '4R' tauopathies from Pick's disease (the filaments of which are made of three-repeat (3R) tau isoforms) and from Alzheimer's disease and chronic traumatic encephalopathy (CTE) (in which both 3R and 4R isoforms are found in the filaments). Here we use cryo-electron microscopy to analyse the structures of tau filaments extracted from the brains of three individuals with CBD. These filaments were identical between cases, but distinct from those seen in Alzheimer's disease, Pick's disease and CTE. The core of a CBD filament comprises residues lysine 274 to glutamate 380 of tau, spanning the last residue of the R1 repeat, the whole of the R2, R3 and R4 repeats, and 12 amino acids after R4. The core adopts a previously unseen four-layered fold, which encloses a large nonproteinaceous density. This density is surrounded by the side chains of lysine residues 290 and 294 from R2 and lysine 370 from the sequence after R4.
リンクNature / PubMed:32050258 / PubMed Central
手法EM (らせん対称)
解像度3.0 - 3.2 Å
構造データ

10512

6tjo

EMDB-10512: Cryo-EM reconstruction of TypeI tau filaments extracted from the brains of an individual (Case 1) with Corticobasal degeneration
PDB-6tjo: Cryo-EM structure of TypeI tau filaments extracted from the brains of individuals with Corticobasal degeneration
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.2 Å

10514

6tjx

EMDB-10514: Cryo-EM reconstruction of TypeII tau filaments extracted from the brains of individuals with Corticobasal degeneration
PDB-6tjx: Cryo-EM structure of TypeII tau filaments extracted from the brains of individuals with Corticobasal degeneration
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.0 Å

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードPROTEIN FIBRIL / tau protein / filament / cross-beta structure

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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