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タイトルPolymerization of ZBTB transcription factors regulates chromatin occupancy.
ジャーナル・号・ページMol Cell, Vol. 84, Issue 13, Page 2511-22524.e8, Year 2024
掲載日2024年7月11日
著者Paul M C Park / Jiho Park / Jared Brown / Moritz Hunkeler / Shourya S Roy Burman / Katherine A Donovan / Hojong Yoon / Radosław P Nowak / Mikołaj Słabicki / Benjamin L Ebert / Eric S Fischer /
PubMed 要旨BCL6, an oncogenic transcription factor (TF), forms polymers in the presence of a small-molecule molecular glue that stabilizes a complementary interface between homodimers of BCL6's broad-complex, ...BCL6, an oncogenic transcription factor (TF), forms polymers in the presence of a small-molecule molecular glue that stabilizes a complementary interface between homodimers of BCL6's broad-complex, tramtrack, and bric-à-brac (BTB) domain. The BTB domains of other proteins, including a large class of TFs, have similar architectures and symmetries, raising the possibility that additional BTB proteins self-assemble into higher-order structures. Here, we surveyed 189 human BTB proteins with a cellular fluorescent reporter assay and identified 18 ZBTB TFs that show evidence of polymerization. Through biochemical and cryoelectron microscopy (cryo-EM) studies, we demonstrate that these ZBTB TFs polymerize into filaments. We found that BTB-domain-mediated polymerization of ZBTB TFs enhances chromatin occupancy within regions containing homotypic clusters of TF binding sites, leading to repression of target genes. Our results reveal a role of higher-order structures in regulating ZBTB TFs and suggest an underappreciated role for TF polymerization in modulating gene expression.
リンクMol Cell / PubMed:38996460 / PubMed Central
手法EM (単粒子) / EM (らせん対称)
解像度3.7 - 8.1 Å
構造データ

EMDB-44389, PDB-9b9r:
Cryo-EM structure of the ZBTB5 BTB domain filament
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.7 Å

EMDB-44391, PDB-9b9v:
Cryo-EM structure of the ZBTB9 BTB domain filament
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 8.1 Å

由来
  • homo sapiens (ヒト)
キーワードTRANSCRIPTION / BTB domain / transcription factor / ZBTB protein

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EMN文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN文献

3DEM構造データから引用されている文献のデータベース

  • EMDDBとPDBの3次元電子顕微鏡エントリから引用されている文献のデータベースです。
  • PubMedのデータを利用しています。

関連情報:EMDB / PDB / Q: EM Navigatorの情報源は? / EM Navigator / 万見文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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