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タイトルCryoET of β-amyloid and tau within postmortem Alzheimer's disease brain.
ジャーナル・号・ページNature, Year 2024
掲載日2024年7月10日
著者Madeleine A G Gilbert / Nayab Fatima / Joshua Jenkins / Thomas J O'Sullivan / Andreas Schertel / Yehuda Halfon / Martin Wilkinson / Tjado H J Morrema / Mirjam Geibel / Randy J Read / Neil A Ranson / Sheena E Radford / Jeroen J M Hoozemans / René A W Frank /
PubMed 要旨A defining pathological feature of most neurodegenerative diseases is the assembly of proteins into amyloid that form disease-specific structures. In Alzheimer's disease, this is characterized by the ...A defining pathological feature of most neurodegenerative diseases is the assembly of proteins into amyloid that form disease-specific structures. In Alzheimer's disease, this is characterized by the deposition of β-amyloid and tau with disease-specific conformations. The in situ structure of amyloid in the human brain is unknown. Here, using cryo-fluorescence microscopy-targeted cryo-sectioning, cryo-focused ion beam-scanning electron microscopy lift-out and cryo-electron tomography, we determined in-tissue architectures of β-amyloid and tau pathology in a postmortem Alzheimer's disease donor brain. β-amyloid plaques contained a mixture of fibrils, some of which were branched, and protofilaments, arranged in parallel arrays and lattice-like structures. Extracellular vesicles and cuboidal particles defined the non-amyloid constituents of β-amyloid plaques. By contrast, tau inclusions formed parallel clusters of unbranched filaments. Subtomogram averaging a cluster of 136 tau filaments in a single tomogram revealed the polypeptide backbone conformation and filament polarity orientation of paired helical filaments within tissue. Filaments within most clusters were similar to each other, but were different between clusters, showing amyloid heterogeneity that is spatially organized by subcellular location. The in situ structural approaches outlined here for human donor tissues have applications to a broad range of neurodegenerative diseases.
リンクNature / PubMed:38987603
手法EM (らせん対称) / EM (サブトモグラム平均)
解像度3.0 - 33.0 Å
構造データ

EMDB-18990: CryoEM map of tau PHF sarkosyl-extracted from a human AD patient (associated with in situ tomography)
手法: EM (らせん対称) / 解像度: 3.0 Å

EMDB-50148: Tau PHF subtomogram average relating to CS1 extended data Figure 9A
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 32.64 Å

EMDB-50152: Tau PHF subtomogram average relating to CS2 Figure 3i-j.
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 8.7 Å

EMDB-50153: Tau PHF subtomogram average relating to CS3 extended data Figure 9c
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 19.04 Å

EMDB-50155: Tau PHF subtomogram average relating to CS4 extended data Figure 9d
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 28.56 Å

EMDB-50156: Tau PHF subtomogram average relating to CS5 extended data Figure 9b
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 20.77 Å

EMDB-50157: Tau PHF subtomogram average relating to CS6 extended data Figure 9e
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 33.0 Å

EMDB-50159: Tau PHF subtomogram average relating to CS7 extended data Figure 9f
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 25.0 Å

EMDB-50160: Tau PHF subtomogram average relating to LOL1_PHF Figure 4g-h
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 19.4 Å

EMDB-50161: Tau SF subtomogram average relating to LOL1_SF Figure 4g-h
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 19.0 Å

EMDB-50162: Tau SF subtomogram average relating to LOL2_SF Figure 4i-j
手法: EM (サブトモグラム平均) / 解像度: 19.0 Å

由来
  • Homo sapiens (ヒト)

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EMN文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

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ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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3DEM構造データから引用されている文献のデータベース

  • EMDDBとPDBの3次元電子顕微鏡エントリから引用されている文献のデータベースです。
  • PubMedのデータを利用しています。

関連情報:EMDB / PDB / Q: EM Navigatorの情報源は? / EM Navigator / 万見文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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