[日本語] English
EMN文献
- 3DEM構造データから引用されている文献のデータベース -

+
検索条件

キーワード
著者・登録者
ジャーナル
IF

-
Structure paper

タイトルComparative host-coronavirus protein interaction networks reveal pan-viral disease mechanisms.
ジャーナル・号・ページScience, Vol. 370, Issue 6521, Year 2020
掲載日2020年12月4日
著者David E Gordon / Joseph Hiatt / Mehdi Bouhaddou / Veronica V Rezelj / Svenja Ulferts / Hannes Braberg / Alexander S Jureka / Kirsten Obernier / Jeffrey Z Guo / Jyoti Batra / Robyn M Kaake / Andrew R Weckstein / Tristan W Owens / Meghna Gupta / Sergei Pourmal / Erron W Titus / Merve Cakir / Margaret Soucheray / Michael McGregor / Zeynep Cakir / Gwendolyn Jang / Matthew J O'Meara / Tia A Tummino / Ziyang Zhang / Helene Foussard / Ajda Rojc / Yuan Zhou / Dmitry Kuchenov / Ruth Hüttenhain / Jiewei Xu / Manon Eckhardt / Danielle L Swaney / Jacqueline M Fabius / Manisha Ummadi / Beril Tutuncuoglu / Ujjwal Rathore / Maya Modak / Paige Haas / Kelsey M Haas / Zun Zar Chi Naing / Ernst H Pulido / Ying Shi / Inigo Barrio-Hernandez / Danish Memon / Eirini Petsalaki / Alistair Dunham / Miguel Correa Marrero / David Burke / Cassandra Koh / Thomas Vallet / Jesus A Silvas / Caleigh M Azumaya / Christian Billesbølle / Axel F Brilot / Melody G Campbell / Amy Diallo / Miles Sasha Dickinson / Devan Diwanji / Nadia Herrera / Nick Hoppe / Huong T Kratochvil / Yanxin Liu / Gregory E Merz / Michelle Moritz / Henry C Nguyen / Carlos Nowotny / Cristina Puchades / Alexandrea N Rizo / Ursula Schulze-Gahmen / Amber M Smith / Ming Sun / Iris D Young / Jianhua Zhao / Daniel Asarnow / Justin Biel / Alisa Bowen / Julian R Braxton / Jen Chen / Cynthia M Chio / Un Seng Chio / Ishan Deshpande / Loan Doan / Bryan Faust / Sebastian Flores / Mingliang Jin / Kate Kim / Victor L Lam / Fei Li / Junrui Li / Yen-Li Li / Yang Li / Xi Liu / Megan Lo / Kyle E Lopez / Arthur A Melo / Frank R Moss / Phuong Nguyen / Joana Paulino / Komal Ishwar Pawar / Jessica K Peters / Thomas H Pospiech / Maliheh Safari / Smriti Sangwan / Kaitlin Schaefer / Paul V Thomas / Aye C Thwin / Raphael Trenker / Eric Tse / Tsz Kin Martin Tsui / Feng Wang / Natalie Whitis / Zanlin Yu / Kaihua Zhang / Yang Zhang / Fengbo Zhou / Daniel Saltzberg / / Anthony J Hodder / Amber S Shun-Shion / Daniel M Williams / Kris M White / Romel Rosales / Thomas Kehrer / Lisa Miorin / Elena Moreno / Arvind H Patel / Suzannah Rihn / Mir M Khalid / Albert Vallejo-Gracia / Parinaz Fozouni / Camille R Simoneau / Theodore L Roth / David Wu / Mohd Anisul Karim / Maya Ghoussaini / Ian Dunham / Francesco Berardi / Sebastian Weigang / Maxime Chazal / Jisoo Park / James Logue / Marisa McGrath / Stuart Weston / Robert Haupt / C James Hastie / Matthew Elliott / Fiona Brown / Kerry A Burness / Elaine Reid / Mark Dorward / Clare Johnson / Stuart G Wilkinson / Anna Geyer / Daniel M Giesel / Carla Baillie / Samantha Raggett / Hannah Leech / Rachel Toth / Nicola Goodman / Kathleen C Keough / Abigail L Lind / / Reyna J Klesh / Kafi R Hemphill / Jared Carlson-Stevermer / Jennifer Oki / Kevin Holden / Travis Maures / Katherine S Pollard / Andrej Sali / David A Agard / Yifan Cheng / James S Fraser / Adam Frost / Natalia Jura / Tanja Kortemme / Aashish Manglik / Daniel R Southworth / Robert M Stroud / Dario R Alessi / Paul Davies / Matthew B Frieman / Trey Ideker / Carmen Abate / Nolwenn Jouvenet / Georg Kochs / Brian Shoichet / Melanie Ott / Massimo Palmarini / Kevan M Shokat / Adolfo García-Sastre / Jeremy A Rassen / Robert Grosse / Oren S Rosenberg / Kliment A Verba / Christopher F Basler / Marco Vignuzzi / Andrew A Peden / Pedro Beltrao / Nevan J Krogan /
PubMed 要旨The COVID-19 pandemic, caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), is a grave threat to public health and the global economy. SARS-CoV-2 is closely related to the more ...The COVID-19 pandemic, caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), is a grave threat to public health and the global economy. SARS-CoV-2 is closely related to the more lethal but less transmissible coronaviruses SARS-CoV-1 and Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV). Here, we have carried out comparative viral-human protein-protein interaction and viral protein localization analyses for all three viruses. Subsequent functional genetic screening identified host factors that functionally impinge on coronavirus proliferation, including Tom70, a mitochondrial chaperone protein that interacts with both SARS-CoV-1 and SARS-CoV-2 ORF9b, an interaction we structurally characterized using cryo-electron microscopy. Combining genetically validated host factors with both COVID-19 patient genetic data and medical billing records identified molecular mechanisms and potential drug treatments that merit further molecular and clinical study.
リンクScience / PubMed:33060197 / PubMed Central
手法EM (単粒子)
解像度3.05 Å
構造データ

EMDB-22829, PDB-7kdt:
Human Tom70 in complex with SARS CoV2 Orf9b
手法: EM (単粒子) / 解像度: 3.05 Å

由来
  • homo sapiens (ヒト)
  • severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (ウイルス)
キーワードVIRAL PROTEIN / Orf9b / Tom70 / mitochondria / virus infection / SARS CoV2

+
EMN文献について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

+
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

-
EMN文献

3DEM構造データから引用されている文献のデータベース

  • EMDDBとPDBの3次元電子顕微鏡エントリから引用されている文献のデータベースです。
  • PubMedのデータを利用しています。

関連情報:EMDB / PDB / Q: EM Navigatorの情報源は? / EM Navigator / 万見文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る