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- EMDB-56602: Structure of the Chlamydomonas reinhardtii chlororibosome with fa... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-56602
タイトルStructure of the Chlamydomonas reinhardtii chlororibosome with factor pY
マップデータ
試料
  • 複合体: Chloroplast ribosome
  • タンパク質・ペプチド: x 55種
  • RNA: x 5種
  • リガンド: x 2種
キーワードchloroplast / ribosome / translation / chlororibosome
機能・相同性
機能・相同性情報


negative regulation of translational elongation / mitochondrial large ribosomal subunit / mitochondrial small ribosomal subunit / mitochondrial translation / plastid / ribosomal small subunit binding / chloroplast / large ribosomal subunit / transferase activity / ribosomal small subunit biogenesis ...negative regulation of translational elongation / mitochondrial large ribosomal subunit / mitochondrial small ribosomal subunit / mitochondrial translation / plastid / ribosomal small subunit binding / chloroplast / large ribosomal subunit / transferase activity / ribosomal small subunit biogenesis / 5S rRNA binding / small ribosomal subunit / ribosomal large subunit assembly / small ribosomal subunit rRNA binding / cytosolic small ribosomal subunit / large ribosomal subunit rRNA binding / cytosolic large ribosomal subunit / negative regulation of translation / rRNA binding / structural constituent of ribosome / ribosome / translation / ribonucleoprotein complex / response to antibiotic / mRNA binding / mitochondrion / RNA binding / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
Ribosomal protein PSRP-3/Ycf65 / PSRP-3/Ycf65 superfamily / Plastid and cyanobacterial ribosomal protein (PSRP-3 / Ycf65) / Ribosomal protein L6, chloroplast / Family of unknown function (DUF5323) / TRAM domain / TRAM domain / TRAM domain profile. / Sigma 54 modulation/S30EA ribosomal protein, C-terminal / Sigma 54 modulation/S30EA ribosomal protein, C-terminal domain superfamily ...Ribosomal protein PSRP-3/Ycf65 / PSRP-3/Ycf65 superfamily / Plastid and cyanobacterial ribosomal protein (PSRP-3 / Ycf65) / Ribosomal protein L6, chloroplast / Family of unknown function (DUF5323) / TRAM domain / TRAM domain / TRAM domain profile. / Sigma 54 modulation/S30EA ribosomal protein, C-terminal / Sigma 54 modulation/S30EA ribosomal protein, C-terminal domain superfamily / Sigma 54 modulation/S30EA ribosomal protein C terminus / : / : / Ribosome hibernation promoting factor/RaiA / Ribosome hibernation promotion factor-like / Sigma 54 modulation protein / S30EA ribosomal protein / : / S1 domain profile. / Ribosomal protein L11, bacterial-type / Ribosomal protein S14, bacterial/plastid / Ribosomal protein S1-like RNA-binding domain / S1 RNA binding domain / S1 domain / Ribosomal protein L31 / Ribosomal protein L31 superfamily / Ribosomal protein L31 / Ribosomal protein L11, conserved site / Ribosomal protein L11 signature. / Ribosomal protein L10-like domain superfamily / Ribosomal protein L10P / Ribosomal protein L10 / Ribosomal protein L16 signature 1. / Ribosomal protein L9 signature. / Ribosomal protein L6, conserved site / Ribosomal protein L6 signature 1. / Ribosomal protein L21, conserved site / Ribosomal protein L21 signature. / Ribosomal protein L9, bacteria/chloroplast / Ribosomal protein L9, C-terminal / Ribosomal protein L9, C-terminal domain / Ribosomal protein L9, C-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L16 signature 2. / Ribosomal protein L16, conserved site / Ribosomal protein L11, N-terminal / Ribosomal protein L11, N-terminal domain / Ribosomal protein L11/L12 / Ribosomal protein L11, C-terminal / Ribosomal protein L11, C-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11/L12, N-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11/L12 / Ribosomal protein L11, RNA binding domain / Ribosomal protein L36 signature. / Ribosomal protein L28/L24 superfamily / Ribosomal protein L35, conserved site / Ribosomal protein L35 signature. / Ribosomal protein L9 / Ribosomal protein L9, N-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L9, N-terminal / Ribosomal protein L9, N-terminal domain / Ribosomal protein L28 / Ribosomal protein L35, non-mitochondrial / Ribosomal protein L18, bacterial-type / Ribosomal protein S3, bacterial-type / : / Ribosomal protein S13, bacterial-type / Ribosomal protein S19, bacterial-type / Ribosomal protein L6, bacterial-type / Ribosomal protein S7, bacterial/organellar-type / Ribosomal protein S11, bacterial-type / Ribosomal protein L5, bacterial-type / Ribosomal protein S20 / Ribosomal protein S20 superfamily / Ribosomal protein S20 / Ribosomal protein L19, conserved site / Ribosomal protein L19 signature. / Ribosomal protein S4, bacterial-type / Ribosomal protein L9/RNase H1, N-terminal / 30S ribosomal protein S17 / : / Ribosomal protein S6, plastid/chloroplast / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L36 superfamily / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L20 signature. / Ribosomal protein L14P, bacterial-type / Ribosomal protein S2, bacteria/mitochondria/plastid / Ribosomal protein L35 / Ribosomal protein L35 superfamily / Ribosomal protein L22, bacterial/chloroplast-type / Ribosomal protein L35 / Ribosomal protein L2, bacterial/organellar-type / Ribosomal protein L33 / Ribosomal protein L18 / Ribosomal L18 of archaea, bacteria, mitoch. and chloroplast / Ribosomal protein L33 / Ribosomal L28 family / Ribosomal protein L33 superfamily / Ribosomal protein L28/L24 / Ribosomal protein S16 / Ribosomal protein S16 domain superfamily
類似検索 - ドメイン・相同性
Small ribosomal subunit protein uS2c / Large ribosomal subunit protein bL9c / Sigma 54 modulation/S30EA ribosomal protein C-terminal domain-containing protein / Uncharacterized protein / Large ribosomal subunit protein uL18c / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Large ribosomal subunit protein bL28c / Uncharacterized protein ...Small ribosomal subunit protein uS2c / Large ribosomal subunit protein bL9c / Sigma 54 modulation/S30EA ribosomal protein C-terminal domain-containing protein / Uncharacterized protein / Large ribosomal subunit protein uL18c / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Large ribosomal subunit protein bL28c / Uncharacterized protein / 30S ribosomal protein S15 / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Large ribosomal subunit protein bL17c / 30S ribosomal protein 3, chloroplastic / Uncharacterized protein / Large ribosomal subunit protein uL11c / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Small ribosomal subunit protein uS10 domain-containing protein / 50S ribosomal protein L31 / Large ribosomal subunit protein uL6 alpha-beta domain-containing protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / KOW domain-containing protein / Uncharacterized protein / 30S ribosomal protein S16, chloroplastic / Uncharacterized protein / Large ribosomal subunit protein uL3c / 50S ribosomal protein L35 / Small ribosomal subunit protein uS17c / Small ribosomal subunit protein uS9c / Small ribosomal subunit protein bS18c / Large ribosomal subunit protein uL16c / Large ribosomal subunit protein uL14c / Small ribosomal subunit protein uS12c / Large ribosomal subunit protein bL20c / Small ribosomal subunit protein uS7c / Small ribosomal subunit protein uS4c / Large ribosomal subunit protein bL36c / Small ribosomal subunit protein uS8c / Small ribosomal subunit protein uS19c / Small ribosomal subunit protein uS3c / Plastid-specific ribosomal protein-7 / Ribosomal protein S1 homologue / Small ribosomal subunit protein uS11c / Large ribosomal subunit protein uL22c / Large ribosomal subunit protein uL4c / Large ribosomal subunit protein uL5c / Large ribosomal subunit protein uL2c / Large ribosomal subunit protein uL23c / Small ribosomal subunit protein uS14c
類似検索 - 構成要素
生物種Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.6 Å
データ登録者Waltz F / Kater L / Engel BD
資金援助 スイス, 2件
OrganizationGrant number国
Swiss National Science Foundation216094 スイス
Swiss State Secretariat for Education, Research and InnovationM822.00045 スイス
引用ジャーナル: bioRxiv / 年: 2026
タイトル: Chloroplast-encoded small subunit extensions reshape the Chlamydomonas chlororibosome.
著者: Florent Waltz / Philippe A Lehner / Philippe Van der Stappen / Lukas Kater / Stefan Pfeffer / Benjamin D Engel /
要旨: Chloroplast ribosomes (chlororibosomes) synthesize the core protein components of the photosynthetic apparatus, yet their structural diversity outside flowering plants remains largely unexplored. ...Chloroplast ribosomes (chlororibosomes) synthesize the core protein components of the photosynthetic apparatus, yet their structural diversity outside flowering plants remains largely unexplored. Here, we combine in situ cryo-electron tomography (cryo-ET) with single-particle cryo-electron microscopy (cryo-EM) to determine the structure of the chlororibosome from the unicellular green alga . Subtomogram averaging of chlororibosomes in their native environment, resolved to ~5 Å resolution and in distinct translational states, reveals particles both free in the stroma and loosely tethered to thylakoid membranes. These reconstructions uncover an additional "arm" domain on the small subunit. High-resolution single-particle reconstruction of isolated chlororibosomes to ~2.5 Å, in states bound either to the inhibitory translation factor pY or to a nascent chain-linked P-site tRNA, reveals that this domain is built primarily from extensive chloroplast-encoded insertions and extensions of conserved small subunit proteins, supported by chlororibosome-specific ribosomal proteins. The arm domain is located around the mRNA entry and exit channels, suggesting a role in stabilizing the mRNA trajectory through the small subunit and organizing chloroplast polysomes. Together, these data reveal unexpected structural variation of algal chlororibosomes and suggest that chloroplast translation has diversified substantially even among relatively closely related photosynthetic lineages.
履歴
登録2026年2月5日-
ヘッダ(付随情報) 公開2026年4月1日-
マップ公開2026年4月1日-
更新2026年4月1日-
現状2026年4月1日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_56602.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_56602.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 512 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.06 Å/pix.
x 512 pix.
= 544.307 Å		1.06 Å/pix.
x 512 pix.
= 544.307 Å		1.06 Å/pix.
x 512 pix.
= 544.307 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.0631 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.107
最小 - 最大-0.28945732 - 1.5380076
平均 (標準偏差)0.002138761 (±0.023718912)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ512512512
Spacing512512512
セルA=B=C: 544.3072 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : Chloroplast ribosome

全体名称: Chloroplast ribosome
要素
  • 複合体: Chloroplast ribosome
  • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S1 homologue
  • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS4c
  • タンパク質・ペプチド: bS6c
  • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS7c
  • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS8c
  • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS10 domain-containing protein
  • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS11c
  • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS12c
  • タンパク質・ペプチド: uS13c
  • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS14c
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S15
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S16, chloroplastic
  • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS17c
  • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein bS18c
  • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS19c
  • タンパク質・ペプチド: bS20c
  • タンパク質・ペプチド: bS21c
  • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein 3, chloroplastic
  • タンパク質・ペプチド: cS26/PSRP8
  • タンパク質・ペプチド: Plastid-specific ribosomal protein-7
  • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS2c
  • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS3c
  • タンパク質・ペプチド: uS5c
  • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS9c
  • タンパク質・ペプチド: Sigma 54 modulation/S30EA ribosomal protein C-terminal domain-containing protein
  • タンパク質・ペプチド: cL38/PSRP6
  • タンパク質・ペプチド: bL33c
  • タンパク質・ペプチド: bL34c
  • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L35
  • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL36c
  • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL2c
  • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL3c
  • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL4c
  • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL5c
  • タンパク質・ペプチド: Plastid ribosomal protein L6
  • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL9c
  • タンパク質・ペプチド: uL10c
  • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL11c
  • タンパク質・ペプチド: uL13c
  • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL14c
  • タンパク質・ペプチド: uL15c
  • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL16c
  • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL17c
  • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL18c
  • タンパク質・ペプチド: bL19c
  • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL20c
  • タンパク質・ペプチド: bL21c
  • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL22c
  • タンパク質・ペプチド: uL23c,Large ribosomal subunit protein uL23c
  • タンパク質・ペプチド: KOW domain-containing protein
  • タンパク質・ペプチド: bL27c
  • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL28c
  • タンパク質・ペプチド: uL29c
  • タンパク質・ペプチド: bL32c
  • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L31
  • RNA: 16S rRNA
  • RNA: 5S rRNA
  • RNA: 3S rRNA
  • RNA: 23S rRNA
  • RNA: 7S rRNA
  • リガンド: POTASSIUM ION
  • リガンド: MAGNESIUM ION

+
超分子 #1: Chloroplast ribosome

超分子名称: Chloroplast ribosome / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
株: mat3-4

+
分子 #1: Ribosomal protein S1 homologue

分子名称: Ribosomal protein S1 homologue / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 48.345176 KDa
配列文字列: MRLSARTLAQ RASLPARSTG VVSRRSLVAP APARKANLAT RVAAIEEQQT SFQGDEQPVE AALDPASILD VDPAAVEEMD LHELDQAQE DLLKWMMLDE ATQEEDLDEM VDYDDFGDEE YADMYEEVEE MLEAVDYEFK VGDKVSGTVI EVDDDGAYVE I GAKAIAFC ...文字列:
MRLSARTLAQ RASLPARSTG VVSRRSLVAP APARKANLAT RVAAIEEQQT SFQGDEQPVE AALDPASILD VDPAAVEEMD LHELDQAQE DLLKWMMLDE ATQEEDLDEM VDYDDFGDEE YADMYEEVEE MLEAVDYEFK VGDKVSGTVI EVDDDGAYVE I GAKAIAFC PVTECSFARL KTPLEALRPG MKRDFMVVED EEEYGQVIVS LAAMEATTFW QRIRQLQEED ITVTVSVESV NK GGMLVKF GIYDGFIPVS QFGPSITPDN MESLVGFELQ VKFLEVDEEA ERLVFSHKRA SSTVSNDIQG FKVGDVVAGV VQS VKPYGA FIDLGGVTGL LHVSQISHDR VLVLDKILQE GDKIKVMILS QDRERGRVTL STKKLEPTPG DMLRDPQLVY EKAE EMAEQ FRKRVEQAAQ SAAEPQPDTL GAAPEGQPFV Y

UniProtKB: Ribosomal protein S1 homologue

+
分子 #2: Small ribosomal subunit protein uS4c

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS4c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 30.082121 KDa
配列文字列: MSRYLGPRLR VIRRIGKLRG FTRKKPFRRV FKGFGGFKGK VIPPGQHGLT KLLKTRPYDS SESDYLIRLK VKQRLRFNYG ITERQLVNY VRKAKKIKES TGQVLLQFLE MRLDNIVFRL NMAPTIPAAR QLISHGHIRV NNKKVNIPSY MCKPKDVISV A MKQRSLQL ...文字列:
MSRYLGPRLR VIRRIGKLRG FTRKKPFRRV FKGFGGFKGK VIPPGQHGLT KLLKTRPYDS SESDYLIRLK VKQRLRFNYG ITERQLVNY VRKAKKIKES TGQVLLQFLE MRLDNIVFRL NMAPTIPAAR QLISHGHIRV NNKKVNIPSY MCKPKDVISV A MKQRSLQL VNKNLQEYYR RMRFYKKRLE KTLPFILLKI KPLGLTSVTA AVELITKGNV RVNNKSVKTP NYICRPRDTV SL RTKQGIK KVFLKNYLKG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS4c

+
分子 #3: bS6c

分子名称: bS6c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 19.096979 KDa
配列文字列:
MATMQKSSVA VRSSSSANLV AARPIAQRLC FQPVVRQSAQ QQRSSVGRAM PKVVAAAVAA DAAAETVKLP AGYHWYETMI ILKPTLSDE ERDRELAKFE AYLNKEECFN INALVRGRSK LAYPIKKEWE GIYVLYSYLA RRQTARAVQQ LLSNPEAGAE D TVLRHITL CKQ

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #4: Small ribosomal subunit protein uS7c

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS7c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 19.163799 KDa
配列文字列:
MPRRPINKKR TLLPDPVYNS VSVHMLVNRV LKSGKKSVAY RIVYNALKEI GDVTQKNPVE VFEKALDNVT PRVEVKPRRR AGAIQMVPR VLRLGDRARA NSLRWIMEAC DKRSGQPMVT KLKSEILDAY KKTGFAIRKK EELHKIAIAN AMYAKKPQVI I NAINLLVD

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS7c

+
分子 #5: Small ribosomal subunit protein uS8c

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS8c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 15.916647 KDa
配列文字列:
MKSHGLINDS IGDMLTRIRN ACLAKKSSVS IPFTRLNQNI AQILEQEGFI QTYQVSLDSQ DLTIRLKYRS KKIYRGKKKE SCITNLKRI SKPGLRIYSN HKDILRILGG TGIVIVSTPE GLMTDREARL RGIGGELLCS VW

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS8c

+
分子 #6: Small ribosomal subunit protein uS10 domain-containing protein

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS10 domain-containing protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 18.736729 KDa
配列文字列:
MAALTCRVRA FTTSRPQAAR PQVGARPAVR RPVSIVRAVA ESAVDVESYV DELDVPMAES TPLAAAGEKV RLRIRMRSYE KQLLEDCVA QIQAVAEATG AVFKGPVMLP TKRRIYCVLR SPHVNSNSRE HFEIRSHHRL VDLKNLSAET VSMMMQWVPP S GVEVECSI A

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS10 domain-containing protein

+
分子 #7: Small ribosomal subunit protein uS11c

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS11c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 14.260867 KDa
配列文字列:
MAKQTRKLTT NKTKKKIFRG VVHIQAGHHN TIVTITNIRG EVLCWSSAGA CGFRGKRKST SFAAKKAAET VARKSRDFTM KAAKILVTG PGQGRESAIR EIFKAGIKVS VIREKTGIPH NGCRPPKKRS V

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS11c

+
分子 #8: Small ribosomal subunit protein uS12c

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS12c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 14.637429 KDa
配列文字列:
MPTIQQLIRS ARKKITKKTK SPALKSCPQR RGICLRVYTV TPKKPNSALR KVARVRLTTG FEVTAYIPGV GHNLQEHAVV LVRGGRVKD LPGVRYHIVR GSLDTAGVKN RVQSRSKYGV KMGSKTAAKT AGKK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS12c

+
分子 #9: uS13c

分子名称: uS13c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 18.561682 KDa
配列文字列:
MQTLSACRCV AGARPFTAVR PLPAARPMQA AAPRRAPLHI MNLRVNNVEI PNSKRIEVSL QYIFGIGETT AQTILRDTGV ENKKTYELN EEEINKLRSE VEKYTTEADL RRVVAQNIKR LKDIGCYRGR RHIMGLPVRG QRTKTNARTR KGKAKTVANK K KATK

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #10: Small ribosomal subunit protein uS14c

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS14c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 11.776143 KDa
配列文字列:
MAKKSMIQRE LKRQKLVMKY ATKRAALKEQ IKQTTFLKEK LSLHRKLQQL PRNSSAVRLH NRCMITGRPK GYFRDFGLSR HVLREMAHQ GLLPGVCKSS W

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS14c

+
分子 #11: 30S ribosomal protein S15

分子名称: 30S ribosomal protein S15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 15.817261 KDa
配列文字列:
MQALQCKSGV FGKAAVARPV RVAAPSRARL AVCASYKNQE NINLEKVPAF KRHDADVGSS EVQVARLSAR IMQISAHLAQ NKKDFAARR GLEAILSQRK SLLQYMYKTD RDMYDRMVSE YKIRSVIVGD TRGAARKSEE RS

UniProtKB: 30S ribosomal protein S15

+
分子 #12: 30S ribosomal protein S16, chloroplastic

分子名称: 30S ribosomal protein S16, chloroplastic / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 14.474052 KDa
配列文字列:
MQALSAKRSL GSIQPFTSSR VAVARPARVA TVIENRVALR FQRFGRKKLP FYRLVAIDSK KRRDGEPLEY LGWYDPLKKE TNLNAPAIK EWLAKGALPS ETVENLLRKA YVMEPKVAKV VVPKDAVKV

UniProtKB: 30S ribosomal protein S16, chloroplastic

+
分子 #13: Small ribosomal subunit protein uS17c

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS17c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 11.767698 KDa
配列文字列:
MQSATMRTSA FRPAAVSRRS AVTVRAVQEV KGVVVSTKMN KTVVVEAERL ATDVTYQKRK KVTKRYMAHD ESGALRVGDF VRLDGTRPL SKTKRFSVTE VLRKAD

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS17c

+
分子 #14: Small ribosomal subunit protein bS18c

分子名称: Small ribosomal subunit protein bS18c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 16.315782 KDa
配列文字列:
MRGLKSNKPK PRIQKVSVRK FRRKVLSLSQ ILSRLRQKRN QKIEQQKRNK PIKPLIPPKT LVIVLKEKPE KTLYNRRYID YKHSGLLQR YIGLGGKILP RRQTRLTAKQ QRFVAKTIKT ARVMGLLPFV SKERSFFK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS18c

+
分子 #15: Small ribosomal subunit protein uS19c

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS19c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 10.463467 KDa
配列文字列:
MSRSLKKGPF VADHLLKKIE KLNAKGKKVV IKTWSRSSMI VPPMIGHTIG VYNGREHIPV FVSDQMVGHR LGEFSPTRTY RGHAKKDKK AKR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS19c

+
分子 #16: bS20c

分子名称: bS20c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 18.285582 KDa
配列文字列:
MQSTMLRAAS AVRAFQPAKP TFAPVSRPAV ERGALVVMAA EGKDAQKKKM PSPVKRALLS EERRVYNKSH KSACATRVKK VVKLAETLV AAPSKTEEEV KNLEKLISEA YTEIDKAVVK GILHENTAAR KKARCARWKK TVLMAAGLYK PAADSPDFAR Y QKLVKA

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #17: bS21c

分子名称: bS21c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 20.793336 KDa
配列文字列:
MLSTVTRQAL AAKPFGTVQP RVAPRLAKCQ MARKDSYMVE VEVAEDEPED VAVRRYMKLV MQSRVVEKLR ARRTKETKIE EYKRRFRER VEMRKAGIVD PTYDELYSAE LDPKPFEDFF QLRRDEDPEG AYDGAGAGSD DIFGSFAGGT YTDTTRWGSG Y PGGGYMNT SNSFGAQGGY MGGYMQ

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #18: 30S ribosomal protein 3, chloroplastic

分子名称: 30S ribosomal protein 3, chloroplastic / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 33.397238 KDa
配列文字列: MMLVRQVPCL AQRASARSAV RSRPAPFTPA RRVFARAQAD AALLEDDEVA YEVTNEDFEL DENDPDLLLG LEAVELMGSD VDAMTAAAV AAEMESAEDK EEAARAVEDV MASKLAAGEL SEAELSKVAA AVGDLEGAEL DDFVPALASD RYAEAAVSSD D KALMEPLK ...文字列:
MMLVRQVPCL AQRASARSAV RSRPAPFTPA RRVFARAQAD AALLEDDEVA YEVTNEDFEL DENDPDLLLG LEAVELMGSD VDAMTAAAV AAEMESAEDK EEAARAVEDV MASKLAAGEL SEAELSKVAA AVGDLEGAEL DDFVPALASD RYAEAAVSSD D KALMEPLK LSKGELRNLL PQDWDQINVD FFSNKKDENI PLPEYRLNVL WTDKNLAVAI DQVYSRGQVS PLTEYYFWPR QD AWEELRI NLESRPWISE RDRIILLNRL TQLINFWQDE EVKHTVEEAR AEFPDCAFAI A

UniProtKB: 30S ribosomal protein 3, chloroplastic

+
分子 #19: cS26/PSRP8

分子名称: cS26/PSRP8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 12.985022 KDa
配列文字列:
MLATPRASAR PFTSARPAAK APICPRRVTV RAAEEAVEAA PEAFEESMES GPRGRRSSVE KGMELKHFLP LPKPAHLVFI KPTVAVVAG TASRSSVGVK MSAGDQQLER YVVEYFARSV K

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #20: Plastid-specific ribosomal protein-7

分子名称: Plastid-specific ribosomal protein-7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 60.136863 KDa
配列文字列: MLRELGRTAT VKAHGRSVLR PVRGPAGRRQ VAFTGVRPSV RVFAEAPAAE QAAKAIKLED VKEGSEYEGT VTTVEEFGAF VNFGANTNG LVHISKLASG FTKNAKDVVQ PGQKVTVKVL SVDAEKKRVS LELKSAVAAE ASAEESDDII TEPDREGADA T DDDEDVEV ...文字列:
MLRELGRTAT VKAHGRSVLR PVRGPAGRRQ VAFTGVRPSV RVFAEAPAAE QAAKAIKLED VKEGSEYEGT VTTVEEFGAF VNFGANTNG LVHISKLASG FTKNAKDVVQ PGQKVTVKVL SVDAEKKRVS LELKSAVAAE ASAEESDDII TEPDREGADA T DDDEDVEV ELEDGQVEVR ADLPGFEDIP FVMEEADMDA EMSEAAIAAL EADLDGAEIR YELEAPAYME EVTGKVARIE DY GVFLEFE WNGKTLTGLL AKDEMKVPSS ALSAEAQAAL RAEWADTGFE MPAFVELPDD ELDVKKYYQP GESVPAFVLE SSL VDGRGI SLTHFTDKEV SAEAVAAYEE LEDDEDEELD KMMADAAGLE DEVLAFDPEA LMEEDEGEEA GAAADAGDDA EYEG VSADG LEGANGNYAL GATRSGLIKG KNGYQVAPMG LPSRPLNDAV TSSGLAILGT SEVDFDGDEV QLVDYWTSEA FDNIP KDVL KKLGLKMSYT EAGEAEFEER ADFEATDVPF YLYGGDVESR AKEFVADLLS DDVDEAELPA RAGRAPIVLA AAVQSQ

UniProtKB: Plastid-specific ribosomal protein-7

+
分子 #22: Small ribosomal subunit protein uS2c

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS2c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 102.698477 KDa
配列文字列: MLNKKPPYLI LSLIMIKTQK SKQTAVRKLI PGNVISLKIT AMGANNVGIN EFTFGIPVLV PNAKLGETVQ AKVLKILASK KIAIAKLIK VVTKTNATET NNLAALTPGA TLDVTITKLG PNSTGIADLG NNYNNVNKLI VKKSAITIGE KVTVLVTRVK N GYAFGVAT ...文字列:
MLNKKPPYLI LSLIMIKTQK SKQTAVRKLI PGNVISLKIT AMGANNVGIN EFTFGIPVLV PNAKLGETVQ AKVLKILASK KIAIAKLIK VVTKTNATET NNLAALTPGA TLDVTITKLG PNSTGIADLG NNYNNVNKLI VKKSAITIGE KVTVLVTRVK N GYAFGVAT VSTQRLNQVS TSLTQNSFKG TKFTVVLPKN AKRYLKHLVF KVTTATAQNL SVNGFEQTLF KKGAVGLDTR IN NQNGSAG NLTTVPTNTI LFVKPNLGAK LGDKVQIQII KFASIENGTL TYNVAIAKII KLNPLSTPQK KAFVRSSLRQ MLK SGMHYG EKAIKCNARM KNYVWTRKKG TDTKVEARPL IKKGRNLINL LKTRRCLTKA LAQLTKYAAK GKTFLFVGTK KAAS GLVAR AALFSKKAFF VNTRWLGGML TNWKTILKSI SKIRPILKEK QMIIKDILEK RQTIKARLIQ KALLLRKKSK LMLKK GRLL IQMLKQNNSN STSGKQAVRF LFTEKTNLLN TKRKEFVSKG ILLLEKRQQL VVKRQELITQ SQTLKSKAIQ LTNTYR NLL NNLICSRKKL RELKALLLVS HELYLFKQQA KQDNQNLYMV SYNKFKTLNS DYILSNPPKE ILNKMVSIIK GQGLVIK NN NLNLKTANNA KTLILSQLLS KFSLFVPTIK TSINNLQNYI STQKTALNKV LALLNVVKTK MNVYVTLKTK LVAELRQI K QTLQTERNII RVLRRKLKQI AAQKRFIKFL PKLRYLPTPV TKIEQTARFL VKKFVDPKMK YPMDSIYDKK LSRQSKKVA ASRKKKWQRL EKYLGGISNM TKIKEKQIAN NVAIIIGQQE EMNAVRECQK LGIKMFHIVD TNCNPGLADH FIPANDDARN SIKFILGKF LTRIRLAHKI KVKFKKTSLK K

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS2c

+
分子 #23: Small ribosomal subunit protein uS3c

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS3c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 82.015938 KDa
配列文字列: MGQKVHPLGF RVGITKKHQS QWFARFQKYA YSQSVFEDHM LRTTLVNLFS NLEKESALAT KQSKNRGATQ PKAPKITQIK IERGLIPYE IGIQIHSNDC LSITKAIDNI KVSKDLVTNL QKTRKYLFKA GTQLKNASMQ VSDNLNVAEG ENSTMLKTKT S ASGTSVLK ...文字列:
MGQKVHPLGF RVGITKKHQS QWFARFQKYA YSQSVFEDHM LRTTLVNLFS NLEKESALAT KQSKNRGATQ PKAPKITQIK IERGLIPYE IGIQIHSNDC LSITKAIDNI KVSKDLVTNL QKTRKYLFKA GTQLKNASMQ VSDNLNVAEG ENSTMLKTKT S ASGTSVLK KRTFKIQTQK PTKGKFVFKG KRKQKKKLSK AVFMRLKNIK RRFKKRQTIK KRYLNIISKG LLIRKKGNLI IR NVKIKRK NKTARLTSRK SQPTLRSGSN LRDNLAPVKS KMQRFNNRMS KKFANLFLTK LNKQFLVRLK AIMKFWHNQN VTK APLGYN KKWSLAKSYA LINNLKAKYL AKDILSLGSL RVQKLRKLIS ILEKKSLVKM ETLRKDFITF GTLSKTRAFG YYQM ITFLK QLKELVTKIK KQTIANVTTK QELCCYNKLA LNKTKIQNLI RAKSKQTKSI TQKVVNNFVK LVDDNQAMAN ESRKI KWIS YLKDLVNKHR TENIFYYLAT IATARKDLNA LKRYTKQHAN FLFGVNVENA KENPNALLQR VTKTLTQYSK NPLVNN DFE NAEGLTKLQT AFLTQIESQR KMYKANLALT PKISIKFFSV KTTNLLEKAS TVADSIVDAL EKRKAFRGVI KKAKEDL ML RSRVTRVKGV KIQVAGRLNG AEIARSEWVR AGRVPLQTLR ANIDYAYRTA NTIYGIIGVK VWIFKGYSKI

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS3c

+
分子 #24: uS5c

分子名称: uS5c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 72.090727 KDa
配列文字列: MATIQSGVAR AASRPQPKVA AGSISSLRVK PFTRATRSVL GAAPRQNVVP RAAEPEAVAT EADDFTFSLS DAKKGNEYTA GDVEAALRF YSGEASAVGA TNDEFVENVF GIEDADFFGD LDNNEAYDDE FIAAGIPEAA PKQRQGGKRG GEGEGAEDSD D IAAAKEAE ...文字列:
MATIQSGVAR AASRPQPKVA AGSISSLRVK PFTRATRSVL GAAPRQNVVP RAAEPEAVAT EADDFTFSLS DAKKGNEYTA GDVEAALRF YSGEASAVGA TNDEFVENVF GIEDADFFGD LDNNEAYDDE FIAAGIPEAA PKQRQGGKRG GEGEGAEDSD D IAAAKEAE AMKQIEEQMV LEAELQETGL DQEEEGTYKA VGPAVWDWMS DIAAEDDDEE ISAVAAGGAR SMAADVMAAL PS DEEVFAD LRNANLQDVD VETRDTIEFL LEDFDIENEV KAIPDNVEEV FSVPEFAGLG DADVARIDAL LGEDISLPEL DLS GLDFAD IEDDGLEMSE EAVQKYVASL KSATGAELSE EQIKEIFADE PVQLVDVAAE AAVTMDGVDL TEPAIEALAE SELV FNSVE DKLEDVDDVE EFRTELLALR AMPEANLEAP PEEEVEVLDQ YLSASEQFIA AEEARKAQLA EKVIKGELSA DVLEE EDGE YVDLEKELLM PDDMDDLVDA DDFDDGENWQ ERIIELSRVT KVVKGGKLMG FRCTAIIGNG NGLVGVGCQA GREVAT AVK RALVDAKKSV VRVPLVGAGT IPHRVEAKFN AARCVMVPAA DGTGVLAGSS IRSVLELAGV QNVLAKRIGC RSLLNNA RC AVAALEQLRT LQEVSKARGV PMDRLLLPSS K

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #25: Small ribosomal subunit protein uS9c

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS9c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 21.062168 KDa
配列文字列: MAILAKAVGR RKEAVAQVQI KEGNGLFIIN NKSAQEYLHN DFYSLLAVKA PFDVLSTSKK ADMVSPDLSL TNLESTFTNL MQFSGGENA VKFDTIVKVK GGGLMGQTEA IRLGISRALC LLSTNTNPSA NQNNLPNIYI PEGEGEALAI PNASDIRKQL K DKGYLTQD ...文字列:
MAILAKAVGR RKEAVAQVQI KEGNGLFIIN NKSAQEYLHN DFYSLLAVKA PFDVLSTSKK ADMVSPDLSL TNLESTFTNL MQFSGGENA VKFDTIVKVK GGGLMGQTEA IRLGISRALC LLSTNTNPSA NQNNLPNIYI PEGEGEALAI PNASDIRKQL K DKGYLTQD SRVKERRKYG LKKARKASQY HKR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS9c

+
分子 #26: Sigma 54 modulation/S30EA ribosomal protein C-terminal domain-con...

分子名称: Sigma 54 modulation/S30EA ribosomal protein C-terminal domain-containing protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / 詳細: The proper sequence is A8J8B2, but in Uniparc / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 31.825562 KDa
配列文字列: MALTLHQQRM AQIACRQQAS GRVSVRPVLQ LASTRVPVPY GPNMAVVATR PARSGLVVRA QSAKAAAGTV RIIIQGRKLP VTDAIKLYV EEKVAKAVAN FSHTLKEVDV TLSARGGDTG THGKKEQKVE VTIYTLRNGV VRVEDAENNL YAAIDLVCDK I RAKLQKIK ...文字列:
MALTLHQQRM AQIACRQQAS GRVSVRPVLQ LASTRVPVPY GPNMAVVATR PARSGLVVRA QSAKAAAGTV RIIIQGRKLP VTDAIKLYV EEKVAKAVAN FSHTLKEVDV TLSARGGDTG THGKKEQKVE VTIYTLRNGV VRVEDAENNL YAAIDLVCDK I RAKLQKIK EKAISRGAWP GRAGPKEDVD EEDFQEYLKE VKMDTQLFDK EEQLQRQFAE LNRIYPANVM RSKTVVLADP IT VEEAIDA LEAVGHSFYV FREMTTDTVQ IVYKRESGGY GVIVPQMRD

UniProtKB: Sigma 54 modulation/S30EA ribosomal protein C-terminal domain-containing protein

+
分子 #27: cL38/PSRP6

分子名称: cL38/PSRP6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / 詳細: Proper ID is A8IMN3 but sent to Uniparc / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 7.21533 KDa
配列文字列:
MFALSAVSSR NVACQASQPR HKGAKHHARS RPIKYNRADK NHGPAKYEPL PTPPPALIVV SKAESK

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #30: bL33c

分子名称: bL33c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 11.43135 KDa
配列文字列:
MQSVLRSSAS ALTNPMMGNK MSYRVSAAPV PTTTAFREVT TMAKKKGVRL IVTIECTESK GEGATPSRYC TQKNRKNTPE RLELMKYNP NLRRYTLHKE VK

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #31: bL34c

分子名称: bL34c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 12.987529 KDa
配列文字列:
MASMLMSRVA AAPVKAVACM RSAMTTRAIA PITARPATSS FMGGSFAGSS MTRVAPARGG LVVMANAKKS IACTKEGTNR KRRRTSGFK ARMATKNGRK VIKARRAKGR HSLCPASEGK SGGKK

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #32: 50S ribosomal protein L35

分子名称: 50S ribosomal protein L35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 12.106231 KDa
配列文字列:
MASLCMRSSL APKVASRSSA FLASPVAPVR SVAPVKAAPT TVVVEAKLKT RKSAAKRFKV TGSGKVTARH AGKQHFNEKM TRDHIRDSS KMFVLSPANI YNATKCLPNS GVGGK

UniProtKB: 50S ribosomal protein L35

+
分子 #33: Large ribosomal subunit protein bL36c

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL36c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 4.273327 KDa
配列文字列:
MKVRASVKKM CDNCRVIKRK GKVMVICSNA KHKQRQG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL36c

+
分子 #34: Large ribosomal subunit protein uL2c

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL2c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 30.95577 KDa
配列文字列: MGIRFLQAYT PGTRNRSVSD FSELTDKNST PEKALTVSLH RAKGRNNRGI ITCRHRGGGH KRLYRQIDFR RDKIGVTAKV VRIEYDPNR NARIALLRYE DGEKRYIIHP RGLNIGDIIQ SDLNAPILIG NSLPLRNIPL GAEVHNVEFQ PGSGGQLARS A GAMVEILA ...文字列:
MGIRFLQAYT PGTRNRSVSD FSELTDKNST PEKALTVSLH RAKGRNNRGI ITCRHRGGGH KRLYRQIDFR RDKIGVTAKV VRIEYDPNR NARIALLRYE DGEKRYIIHP RGLNIGDIIQ SDLNAPILIG NSLPLRNIPL GAEVHNVEFQ PGSGGQLARS A GAMVEILA KEGNFVTIRL PSKEIRLVSK NCWATVGQVG NIEAYNLTIG KAGRTRWLGK RPTVRGSVMN PVDHPHGGGE GR APIGRSR PVTPWGRPAL GQLTRKPKKY SNTLIVKKRK K

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL2c

+
分子 #35: Large ribosomal subunit protein uL3c

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL3c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 27.878426 KDa
配列文字列: MALQQTRAFS GRMSLKSAAA PVRVSRASRA RTVLVEARQF RKAMGVLGTK AGMMSYFTED GLCVPATVIA LEEGNVVTQV KTQDTDGYN AVQIGYKATA EKRVTKPELG HLKKAGVPPM RHLVEFKLKD RAAVEAYQPG QALDVAALLK EGEPVDIAGI T VGKGFQGT ...文字列:
MALQQTRAFS GRMSLKSAAA PVRVSRASRA RTVLVEARQF RKAMGVLGTK AGMMSYFTED GLCVPATVIA LEEGNVVTQV KTQDTDGYN AVQIGYKATA EKRVTKPELG HLKKAGVPPM RHLVEFKLKD RAAVEAYQPG QALDVAALLK EGEPVDIAGI T VGKGFQGT IKRWHHKRGA MSHGSKSHRE HGSIGSATTP SRVFPGLKMA GQMGNVRMTV KNQSLLKVDT ERHALVVKGS VP GKVGNVV EITPAKLVGV NW

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3c

+
分子 #36: Large ribosomal subunit protein uL4c

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL4c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 25.659525 KDa
配列文字列: MQTMRVAFRP AATSRSTVVT RASAVAAPAS IPYKAADGSS KGTQQLALKV AEDSAKGLVH RYLVMVQQNA RQGTASTLTR SEVRGGGKK PYAQKGTGNA RRGSSVSPLF PGGGVTFGPK PKDWSISMNK KERRLALATA LQSATADMIV VESLAGKLQD T KTKSMVAL ...文字列:
MQTMRVAFRP AATSRSTVVT RASAVAAPAS IPYKAADGSS KGTQQLALKV AEDSAKGLVH RYLVMVQQNA RQGTASTLTR SEVRGGGKK PYAQKGTGNA RRGSSVSPLF PGGGVTFGPK PKDWSISMNK KERRLALATA LQSATADMIV VESLAGKLQD T KTKSMVAL LEKLGANAME RKVLLITKEE RPDVTLAGRN IAKLTMNTAS AISVFDVLNA DHIIIEDEAL AHVQSFYGAA AP ASA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4c

+
分子 #37: Large ribosomal subunit protein uL5c

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL5c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 20.267668 KDa
配列文字列:
MTQRLKNLYT KTIVPKLTTN FNYSNMHEVP KIEKIVINRG IGDASQNQKI VESSLKELAM IAGQKGVVTR SKKAIAGFKL RQQMPVGVT VTLRGDRMYG FLDRLIHLAL PRVRDFQGIS SKSFDKKGNY SLGLEEQLMF PEIEYDKIDQ VRGMDISIVT T AKTQEEGL ALLKEFGLPF K

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL5c

+
分子 #38: Plastid ribosomal protein L6

分子名称: Plastid ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 22.275268 KDa
配列文字列: MLTTRVKPFR AAAVSRSSRL CVVAKDSRIG RAPITVPKGV TVTLEGQLVR VKGPNGTLEQ TLSPLVKIEQ ADGKLKLFKL ADDRVAMSQ HGLNRSLVNN LVVGVSTGFE KRMEMVGTGY RAAVAGKDLT LNVGYSKPRV LAIPEGLKVV VEKNTTLVIS G ADKVKVGD ...文字列:
MLTTRVKPFR AAAVSRSSRL CVVAKDSRIG RAPITVPKGV TVTLEGQLVR VKGPNGTLEQ TLSPLVKIEQ ADGKLKLFKL ADDRVAMSQ HGLNRSLVNN LVVGVSTGFE KRMEMVGTGY RAAVAGKDLT LNVGYSKPRV LAIPEGLKVV VEKNTTLVIS G ADKVKVGD FCATIRRQRP PEPYKGKGIR YAGEVIKLKE GKGAGGKKK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL6 alpha-beta domain-containing protein

+
分子 #39: Large ribosomal subunit protein bL9c

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL9c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 22.043705 KDa
配列文字列: MRGAPVSRAA FKAAPVRAAS SRTALVVEAN KKVAKKTKII LISDIPNVGK EGEIKTVPVG YWRNFLLPNG MAKIASEGIL NQIRAKKED EIRKKLEEKA QAQAFANALT TIGKFLLKKK TGEKDQIYGS VQVQEIADAI YQQTGRNVSD CEITVPEIKS V GTYECTIR ...文字列:
MRGAPVSRAA FKAAPVRAAS SRTALVVEAN KKVAKKTKII LISDIPNVGK EGEIKTVPVG YWRNFLLPNG MAKIASEGIL NQIRAKKED EIRKKLEEKA QAQAFANALT TIGKFLLKKK TGEKDQIYGS VQVQEIADAI YQQTGRNVSD CEITVPEIKS V GTYECTIR LHPEVVGTFS VVIQKEKNQI KVTTTEPKKA KK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL9c

+
分子 #40: uL10c

分子名称: uL10c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 25.94116 KDa
配列文字列: MQSSTMTLRG QRSQFGAKAF TSARVQRASL QVTNAITRQK KEQVVEVLKG KLEKSTVVFG LRFKGLDVPT VQKFRKILPA NTSVYVTKN SLMKVAVSQT KGWEALADKG CTGENAWVFV NEEEIAETVK AYFKFEEDLF VEAKKQAAKN VEVKRPTEVS C AVMSGQYL ...文字列:
MQSSTMTLRG QRSQFGAKAF TSARVQRASL QVTNAITRQK KEQVVEVLKG KLEKSTVVFG LRFKGLDVPT VQKFRKILPA NTSVYVTKN SLMKVAVSQT KGWEALADKG CTGENAWVFV NEEEIAETVK AYFKFEEDLF VEAKKQAAKN VEVKRPTEVS C AVMSGQYL SPAELKRCEN LPTKDQLYAT IARLAKQPAQ KLAVGIKAVP NKLAIAIKKV SELDDDKTKT VASVAKA

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #41: Large ribosomal subunit protein uL11c

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL11c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 18.562955 KDa
配列文字列:
MAAVMPRSGV CLPTRSARLA FAPARVATAN RKVTTMAAKV TGKIKLALPA GKANPAPPVG PALGSKGVNI MAFCKEYNAQ TSKMIGDII PVEITVYEDR SFTFVLKTSP ASILLKKAAG IDRGASKPNK ENVGQVTRKQ VAEIAAKKLV DTNATKVESV V RMIEGTAK NMGIKIVD

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL11c

+
分子 #42: uL13c

分子名称: uL13c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 24.590453 KDa
配列文字列: MALTASKLSG RTAFTTERRV AVRAAFQSTR VAARVAPVSR VQSVVCKASA TEFKGDLLNK SYYPTSADAS NVNKRWYVID AEGQTLGRL ASLAALYIRG KHLPTYTPSM DMGAYVIVIN ADKVTVSGKK PAAKTYFRHV TGRPGSWTIE SFNELQARLP E RIIERAVK ...文字列:
MALTASKLSG RTAFTTERRV AVRAAFQSTR VAARVAPVSR VQSVVCKASA TEFKGDLLNK SYYPTSADAS NVNKRWYVID AEGQTLGRL ASLAALYIRG KHLPTYTPSM DMGAYVIVIN ADKVTVSGKK PAAKTYFRHV TGRPGSWTIE SFNELQARLP E RIIERAVK GMLPKGALGR DIKLHLKVYK GTKHDHEAQQ PQDITKEISI KPKNGPGAAV LKAAKAQ

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #43: Large ribosomal subunit protein uL14c

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL14c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 13.466755 KDa
配列文字列:
MIKPLSYLNV ADNSGARELM CIRALGGSYR ESANIGDVII AVVKDALPNM PVKRSDIVRA VIVRTRKGIR RENGMAIRFD DNAAVIINK EGNPRGTRVF GPIARELRDK NFTKIVSLAP EVL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL14c

+
分子 #44: uL15c

分子名称: uL15c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44
詳細: Proper UNIPROT ID is A8JAL6 that has been sent to UniParc.
コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 25.570533 KDa
配列文字列: MQVASRASVR PFTAARQPRS LVVVNASSDA RLRLHNLSPE PGSRRDEKRK GRGYAAGQGG TCGFGNRGQK ARSGPSVRPG FEGGQTPLY RRLPKLRGIA GGMSAGLPDF VVVNLDDLEK HFNAGEDVTL AAVKEKVKSI SGRDASLPLK VLGTGSLSKS L NVHATAFS ...文字列:
MQVASRASVR PFTAARQPRS LVVVNASSDA RLRLHNLSPE PGSRRDEKRK GRGYAAGQGG TCGFGNRGQK ARSGPSVRPG FEGGQTPLY RRLPKLRGIA GGMSAGLPDF VVVNLDDLEK HFNAGEDVTL AAVKEKVKSI SGRDASLPLK VLGTGSLSKS L NVHATAFS ESAKAAIEAA GGKAEVLAAK TKWTKKVADM AAKGMDYEKE KLKKRIDNLK AKGMFEERVP KAKPAAAAAG KK K

+
分子 #45: Large ribosomal subunit protein uL16c

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL16c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 15.500425 KDa
配列文字列:
MLSPKRTKFR KPHRGHLRGK ATRGNKIVFG DFALQAQEPC WITSRQIEAG RRVLTRYVRR GGKLWIRIFP DKAVTMRPAG TRMGSGKGA PDYWVAVVHP GKILYEMQGV SETIARQAMR IAAYKMPVKT KFLTKTV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16c

+
分子 #46: Large ribosomal subunit protein bL17c

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL17c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 19.188451 KDa
配列文字列:
MATLQMARSG VFTSRASAPR AVVRAVVPVA PRSAQTSSFL GEATLVAPSS GMKWTMMRHG NRVKHLGRPA DQRKALIRSL VTEVIRHGA IRTTKVKAMV IRKYVDHMIT LAKDGSLHAR RQAMAFLYDK DLVGNLFENA PERYAERPGG YTRVKTEPVL R RGDATEMA VIELV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL17c

+
分子 #47: Large ribosomal subunit protein uL18c

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL18c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 15.818282 KDa
配列文字列:
MQSTMFKATL APTRPVSRAF TPVVCKAANK KASTQARHAR LRKKLSGTTE RPRMAVYKSN EHIYVQVIDD SKGHTLVSAS TVMKDLKES LESGANINAA TAVGKKVAEL CKAHNIEKVC FDRGGFQYHG RIQAVAEAAR EGGLVF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL18c

+
分子 #48: bL19c

分子名称: bL19c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 16.626418 KDa
配列文字列:
MLASRSAVRP FVAGRRPTVA CSAKLSLHTL RQDMARSQLK TNLPAVVVGD NVKVGLAVQE GNGKTRTQTL DGVIIAAHGA DSSRTLTFR RVFQGVGVEL VMPVHSPAVQ QIEFVRRGRV RRAKLFYLRE RVGKSARLKE VVGVRAADVA AGKQ

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #49: Large ribosomal subunit protein bL20c

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL20c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 13.578073 KDa
配列文字列:
MTRVKRGNVS RKRHKKILNM SKGFRGAAST LFRTANQQNM KALRYSYRNR RQKKRDFRRM WITRVNSAVR RYGLNYSEFM NYLKTHKIQ LNRKVIAQLS ICDPEAFMQL LLF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL20c

+
分子 #50: bL21c

分子名称: bL21c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 19.516861 KDa
配列文字列:
MALANMLSRK AGFATSRTSA PFVASRVSPV AAKARVSSAA PSFSRQQQSI VCQAAATAEV AEKKVHPSPL TIAAPATYAI VEIGGTQMF VEPGKWYTCN RLKVDVGSKI KFGRVLALKH EGKLTVGKPY LENVAVEAEV IEELRGPKVI VYKMRPKKHY R KKQGHRQD LSKFMVTSIS A

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #51: Large ribosomal subunit protein uL22c

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL22c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 18.959348 KDa
配列文字列:
MALRACSSSL VARSAARSVQ PFRPAAVRPA RIAPVARKTA TVVCSAATDA PAAPVAEAVV GEVKSGVAHL KFQRGSADKI RRVLDVIRG RSYEEALVLC EYMPYRACEK IIKCLMSAAA NAKHNKGALK TKLVVSECFA DEGPVLKRAR PRAQGRANLI M KPTFHMTI RVEERAQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL22c

+
分子 #52: uL23c,Large ribosomal subunit protein uL23c

分子名称: uL23c,Large ribosomal subunit protein uL23c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52
詳細: N-ter extension present in the structure but not in the Uniprot sequence,N-ter extension present in the structure but not in the Uniprot sequence
コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 12.565778 KDa
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) MLD LVKYPVITQK TYIALFKDRQ YTFDVDLRLT KPQIKKVFET LFNVDVISVN THIPPRQKIR VGLAQGYRPR YKRAIIT LK EGQSINYSLK NDN

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23c

+
分子 #53: KOW domain-containing protein

分子名称: KOW domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 18.307617 KDa
配列文字列:
MATMLSARTS AFSGATLGRS VAPRAPISSR TTVCAPVAAY GDLPKIGGGR KWEHLELGPG GKALRVPMHV KKGDTVQIIA GKDKGKVGT IIKVLAKKGK VVVEGVNQGQ KHLKPKMENE TGQIKTLEFP IHHSNVMLYS KEKGVRSRVG HKVLETGKKV R YLVKTGEI ID

UniProtKB: KOW domain-containing protein

+
分子 #54: bL27c

分子名称: bL27c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 17.20876 KDa
配列文字列:
MLASTIQSSV LRSSVRAAPA PKRALVIQNA HKKGSGSTKN GRDSNAKRRG VKVYGGQPVK AGGIIVRQCG STWNAGDNCM LGRDFTVFS TVEGVVVFDK KRVKPEIHVY PADHPKAVAA LAKTHTKQPA EGQQSRAERR KATYTSRKAT LSVAQVAAPT T P

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #55: Large ribosomal subunit protein bL28c

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL28c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 21.945557 KDa
配列文字列: MSLSMRSSIV GQSLAFKPAT AQVRVARVLT VDAKKVCDLT GKKRNKANSV CFSNKKSRKW QEPNLQNKKV FWEEGQRWVK LRICTKAIK TLENKGIATM AAEAGIDLWK LPFEDARPQR KAYLAENAGK VPVGSNPRAM KNAEKLASSK KQPKYPVYEE G GRIVFIRP ...文字列:
MSLSMRSSIV GQSLAFKPAT AQVRVARVLT VDAKKVCDLT GKKRNKANSV CFSNKKSRKW QEPNLQNKKV FWEEGQRWVK LRICTKAIK TLENKGIATM AAEAGIDLWK LPFEDARPQR KAYLAENAGK VPVGSNPRAM KNAEKLASSK KQPKYPVYEE G GRIVFIRP GMEDLIFGKK EQQAAPEDQE LKITLSE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL28c

+
分子 #56: uL29c

分子名称: uL29c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 14.965354 KDa
配列文字列:
MQVARAFTAV RPARSVAAPA QQRVSVVAMA KPTKLADFTG LSNEELVNKS NLLKRELAQT KWLQRTRGVG ELKPGENQPQ PDPEKVPKG HLNKHIRRQI AQCLTLLRQR QAAEGVDRKE ARRIEKRAAL ANGTM

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #57: bL32c

分子名称: bL32c / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 10.639328 KDa
配列文字列:
MLALSSSRSA AFSATVRVQP ARQVALAPSR SSLIVEAAVP KKKTSKSKTA IRKAAWKKEV LPYVEQALFK AKLALKEGSR DSADKDMVV STQTEEKSE

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #58: 50S ribosomal protein L31

分子名称: 50S ribosomal protein L31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 14.777946 KDa
配列文字列:
MATLTSSRVT AFSGSRLGNV RIGQARRGVT AARMAKEGIH PQWFEEAKVI CNGVEVMTVG GTKATYNVDI YSGNHPFYQG NRTTMVLDD GQLNKFKKRF AELEELAVVP ILQAGKAEDP SAKEKPAAAA NKKGKKK

UniProtKB: 50S ribosomal protein L31

+
分子 #21: 16S rRNA

分子名称: 16S rRNA / タイプ: rna / ID: 21 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 476.372562 KDa
配列文字列: CCAUGGAGAG UUUGAUCCUG GCUCAGGACG AACGCUGGCG GCAUGCUUAA CACAUGCAAG UCGAACGAGC AAAGAUUUGU GUAGUGGCG AACGGGUGCG UAACGCGUAA GAACCUACCU AUCGGAGGGG GAUAACAUUG GGAAACUGUU GCUAAUACCC C AUACAGCU ...文字列:
CCAUGGAGAG UUUGAUCCUG GCUCAGGACG AACGCUGGCG GCAUGCUUAA CACAUGCAAG UCGAACGAGC AAAGAUUUGU GUAGUGGCG AACGGGUGCG UAACGCGUAA GAACCUACCU AUCGGAGGGG GAUAACAUUG GGAAACUGUU GCUAAUACCC C AUACAGCU GAGGAGUGAA AGGUGAAAAA CCGCCGAUAG AGGGGCUUGC GUCUGAUUAG CUAGUUGGUG GGGGUAACGG CC UCCCAAG GCCACGAGCA GUAGCUGGUC UGAGAGGAUG AUCAGCCACA CUGGGACUGA GACACGGCCC AGACUCCUAC GGG AGGCAG CAGUGAGGAA UUUUUCGCAA UGGGCGCAAG CGACGGAGCA AAGUGCCGCG UGCAGGAAGA AGGCCUGUGG GUCG UAAAC UGCUUUUCUC AGAGAAGAAG UUCUGACGGU AUCUGAGGAA UAAGCACCGG CUAACUCUGU GCCAGCAGCC (G7M) CGGUAAUA CAGAGGGUGC AAGCGUUGUC CGCAAUGAUU GGGCGUAAAG CGUCUGUAGG UGGCUCGUAA AGUCUAAUGU CA AAUACCA GGGCUCAACC UUGGACCGGC AUUGGAGUAC UCACGAGCUU GAGUACGGUA GGGGCAGAGG GAAUUCCAUG UGG AGCGGU GAAAUGCGUA GAGAUAUGGA GGAACACCAG UGGCGAAGGC GCUCUGCUGG GCCGAAACUG ACACUGAGAG ACGA AAGCU GGGGGAGCGA AUAGGAUUAG AUACCCUAGU AGUCCCAGCC GUAAACUAUG GAGACUAAGU GCUGCCGCAA GCAGU GCUG UAGCUAACGC GUUAAGUCUC CCGCCUGGGG AGUAUGCUCG CAAGAGUGAA ACUCAAAGGA AUUGACGGGG GACCGC ACA AGCGGUGGAU UAUGUGGAUU AAUUCGAU(2MG)(5MC) AACGCGAAGA ACCUUACCAG GGUUUGACAU GUCAAGAAC CUCUCAGAAA UGGGAGGGUG CCCUAACGGA CACUUGAACA CAGGUGGUGC AUGGCUGUCG UCAGCUCGUG CUGUGAAGUG UAUAGUUAA GUCUCAUAAC GAGCGCAACC CUCGUCUUUA GUUGCCAUUU GGUUCUCUAA AGAGACUGCC AGUGUAAGCU G GAGGAAGG UGAGGAUGAC GUCAAGUCAG CAUGCCCCUU ACAUCCUGGG CUUCACACGU AAUACAAUGG UUGGGACAAU CA GAAGCGA CCUCGUGAGA GCUAGCGGAU CUGUUAAACC CAACCUCAGU UCGGAUUGUA GGCUGCAACU CGCCUACAUG AAG CCGGAA UCGCUAGUAA UCGCCAGUCA GCUAUAUGGC GGUGAAUACG UUCCCGGGUC UUGUACACAC CG(4OC)CCGUCAC ACCAUGGAA GCUGGUUCUG CUCCAAGUCG UUACCCUAAC CUUCGGGAGG GGGGCGCCUA AAGCAGGGCU AGUGACUAGG G UGAAGUCG (UR3)AACAAGGUA GGGCUACU(2MG)G (MA6)(MA6)GGUGGCCC UGGCUCAC

GENBANK: GENBANK: NC_005353.1

+
分子 #28: 5S rRNA

分子名称: 5S rRNA / タイプ: rna / ID: 28 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 38.858949 KDa
配列文字列:
CCUUGGUGCU CUUUGCUCAG UUGGACCCAC ACCAAUCCAU CCCGAACUUG GUUGUGAAAA AGCUGAGGGG ACUGAAGAAC UUUACGGGU CGCCGUCUGG AAUCUCAGUU CUAGUGCUAG GG

GENBANK: GENBANK: X03271.1

+
分子 #29: 3S rRNA

分子名称: 3S rRNA / タイプ: rna / ID: 29 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 15.149069 KDa
配列文字列:
UACGAAGCAG CUGAAUCCUG CACCAUAGAU GGUGAAAGUC CAGUAGU

+
分子 #59: 23S rRNA

分子名称: 23S rRNA / タイプ: rna / ID: 59 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 769.308625 KDa
配列文字列: CCCCGAGUAG CAUGGGGCAC GUGAAAUCCC GUGUGAAUCA GCGAGGACCA CCUCGUAAGG CUAAAUACUC CUGAGUGACC GAUAGCGAA AUAGUACCAC GAGGGAAAGG UGAAAAGAAC CCCUGUUGGG GAGUGAAAUA GAACAUGAAA CCGUAUGCUG A CAAGCAGU ...文字列:
CCCCGAGUAG CAUGGGGCAC GUGAAAUCCC GUGUGAAUCA GCGAGGACCA CCUCGUAAGG CUAAAUACUC CUGAGUGACC GAUAGCGAA AUAGUACCAC GAGGGAAAGG UGAAAAGAAC CCCUGUUGGG GAGUGAAAUA GAACAUGAAA CCGUAUGCUG A CAAGCAGU GGGAGCAAGA GCUUGUGACC GCGUGCCUGU UGAAGAAUGA GCCGGCGACU UAUAGGGAGU GGCUGGGUUA AG GAGUAAA AUCCGGAGCC CAAGCGAAAG CGAGUCUGAA UAGGGCGCAA GUCACUUCUU AUGGACCCGA ACCCGGGUGA UCU AUUCAU GGCCAGGAUG AAGCUUGGGU AACACCAAGU GGAGGUCCGA ACCGACCGAU GU(5MU)GAAAAAU CGGCGGAUGA GCUGUGAAU AGGGGAGAAA UUCCAAUCGA ACUCGGAGCU AGCUGGAUCU CCCCGAAAUG CGUUGAGGCG CAGCGGUAAC G AGAACUGU CUUGGGGUAA AGCUACUGUU UCGAUGAGGG GGUCAUCCCG ACUUACCAAC UCGUGGCAAA CUCAGAAUAC AA GACAUGU CCGUAAACCA GUGAGACAGU GGGGGAUAAG CUUCAUUGUC AAGAGGGAAA CAGCCCAGAU CACCAGCUAA GGC CCCUAA AUGGUCACUA AGUGGAAAAG GAUGUGAGAA UGCUGAAACA ACCAGGAGGU UUGCUUAGAA GCAGCCACCC UUCA AAGAG UGCGUAAUAG CUCACUGGUA AAGCGUUCUU GCGCCGAUAA UGGCCGGGAC UAAGUGACCU GCCGAAGCUG UGAUA UAAU UUAUAGGUAG GGGAGCGUUC CGCUCUCGGG UGAAGUUUUC ACGUAAGUGG GGAUGGACGA AGCGGAAGUG AGAAUG UCG GCUUGAGUAA CGAAAACAUU GGUGAGAAUC CAAUGCCCCG AAAACCUAAG GGUUCCUCCA CUAGGUUCGU CCAUGGG GG GUUAGUCAGG ACCUAAGACU AGGCCAAACG GCGUCGUCGA UGGAAAACAG GUUAAUAUUC CUGUACGAGU UAAAUUAU G AUCUGAGGGA CGAAGGAGGC UAAGCUAGAA CUGUUUUUGG AUUGCAGUGG AAGCGUUUAG ACGUUGAGAG AUAGAAAAA AAGCUAUCUU GAGUGGAGAC GUGAUCCCUA UUUGAUCGAG UAGCUAGUGA UGUCAUACUU CCAAGAAAAG CUCAUACAUC UUAUAAUUU AAUGACCUGU ACCUGAAACC GACACAGGUA GGUUGGUAGA GAAUACCAAG GGGCGCGAGA GAACUCUCUC U AAGGAACU CGGCAAACUG GCCCCGUAAC UUCGGAAGAA GGGGCACCCA UCCGUAACAA GGUGGGUCGC AGUGACCAGG CC CAGGCGA CUGUUUACCA AAAACACAGG UCUCCGCAAA GUCGUAAGAC AAUAUAUGGG GGCUGACGCC U(2MG)CCCAGUG CCGGAAGGUU AAGGAAGUUG GUUAUUUCGA AAAAAGCUGA CGACCGAAGC CCCGGUGAAC GGCGGUCGUA ACUAUAACGA UCCUAAGGU AGCGAAA(5MU)UC AUUGUCGAGU AAGUUUCGAC (5MC)UGCACGAAA GGCGUAACGA UCUGGGCGCU GUC UCGGAG AGAGGCUCGG UGAAAUAGAC UUGUCCCGUG (6MZ)AGAUGCGGA CUACCUACAC CUGGACAGAA AGACCCUAUG AAGCUUGAC UGUAUCUUGG AAUUGGGUUU GGAAUCCUAA UGGGGAUCCU UGAAUCAGGA CCCUUGACAG UUUCAGGUGG G CAGUUUAU UUG(OMG)GGCGAA UGCCUCCUAA AAGGUAACGG AGGCGUGCAA AGGUUCCCUC AGUCUGGACG GAAAUCAG A CAUUGAGUGU AAAGGCAAAA GGGAGCUUGA CUGCAAGACC UACAAGUCGA GCAGGGGCGA AAGCCGGCCU UAGUGAUCC GACGGUGCCG CGUGGAAGGG CCGUCGCUCA ACGGAUAAAA GUUACUCUA(2MG) GGA(H2U)AACAGG CUGAUCUUCC CC AAGAGUU CACAUCGACG GGAAGGUUUG GCA(OMC)CUCG(2MA)U GUCGGCUCAU CACAUCCUCG GUCUGUAGUA GGUCC GAAG GGUUGGGC(OMU)G UUCGCCCAUU AAAGUGGUAC GUGAGCUGGG UUCAAAACGU CGUGAGACAG UUUGGUCCAU AU CCGGUGU AGGCGUUAGA GCAUUGAGAG UAGCCUUUCA UAGUACGAGA GGACCUGAAA GGACAUGCCA AUUGUGUACC AGU UCUCAU UCCAAUGGGA AACGCUGGGU AGCUACGCAU GGAUAGAUAA CUGCUGAAAG CAUCUAAGUA GGAAGCUAAA CUCA AGAUG AGUGCUCUCU AAGGCCGCGG CUAGACAAGC CGUUAUAUAG GUAUCAGGUG UACAGUCAGC AAUGGCUUUA GCCGA GAUA UACUAAAGGC CGUUU

+
分子 #60: 7S rRNA

分子名称: 7S rRNA / タイプ: rna / ID: 60 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Chlamydomonas reinhardtii (クラミドモナス)
分子量理論値: 88.325664 KDa
配列文字列: AAGGCGUACG GUGGAGACCU AGGCACUCAG AGACGAAGAA GGGCGCAGAU ACCGGCGAUA CGCUUCGGGG AGCUGGCAAC AAGCUUUGA UCCGAAGAUU CCCGAAUAGG GCAACCUCAU AGAACUACCU AUAUAAUUCA UAGUUAGGUA AGAGGCAACC C AGUGAACU ...文字列:
AAGGCGUACG GUGGAGACCU AGGCACUCAG AGACGAAGAA GGGCGCAGAU ACCGGCGAUA CGCUUCGGGG AGCUGGCAAC AAGCUUUGA UCCGAAGAUU CCCGAAUAGG GCAACCUCAU AGAACUACCU AUAUAAUUCA UAGUUAGGUA AGAGGCAACC C AGUGAACU GAAACAUCUA AGUAGCUGGA GGAAAAGAAA GCAAACGCGA UUCCCGUAGU AGCGGCGAGC GAACCGGGAA CA GCCUAAA CCUAUGUAUG UAGGGGUCGU GGGAA

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分子 #61: POTASSIUM ION

分子名称: POTASSIUM ION / タイプ: ligand / ID: 61 / コピー数: 138 / 式: K
分子量理論値: 39.098 Da

+
分子 #62: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 62 / コピー数: 322 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

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実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

濃度2.5 mg/mL
緩衝液pH: 7.5
グリッドモデル: Quantifoil R2/1 / 材質: COPPER / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: HOLEY / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 20 sec.
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / 装置: FEI VITROBOT MARK IV

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電子顕微鏡法

顕微鏡TFS KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: TFS FALCON 4i (4k x 4k)
平均電子線量: 40.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.0 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.8 µm / 倍率（公称値）: 75000
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

CTF補正ソフトウェア - 名称: cryoSPARC / タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION
初期モデルモデルのタイプ: NONE
最終 再構成アルゴリズム: BACK PROJECTION / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.6 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC / 使用した粒子像数: 175058
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る