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万見生物種
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生物種情報

和名 *1セラチア・マルセッセンス, 霊菌
名称 *2Serratia marcescens
その他の名称 *2別称: Bacillus marcescens / Serratia marcescens subsp. marcescens / Serratia marcescens subsp. sakuensis / includes: Enterobacteriaceae bacterium KO4 / Pantoea sp. NAB7 ...Enterobacteriaceae bacterium KO4 / Pantoea sp. NAB7 / Serratia sp. NCIM 2919 / Serratia sp. UENF-22GI / その他: ATCC 13880 / "Bacillus marcescens" (Bizio 1823) Trevisan in de Toni and Trevisan 1889 ...ATCC 13880 / "Bacillus marcescens" (Bizio 1823) Trevisan in de Toni and Trevisan 1889 / CCUG 1647 / CFBP 4226 / CIP 103235 / CIP 107489 [[Serratia marcescens subsp. sakuensis]] / DSM 17174 [[Serratia marcescens subsp. sakuensis]] / DSM 30121 / HAMBI 1286 / JCM 11315 [[Serratia marcescens subsp. sakuensis]] / JCM 1239 / LMG 2792 / LMG:2792 / NBRC 102204 / NCDC 813-60 / NCIB 9155 / NCIB:9155 / NCTC 10211 / NRRL B-2544 / NRRL:B 2544 / NRRL:B:2544 / Serratia marcescens Bizio 1823 / Serratia marcescens subsp. marcescens Bizio 1823 / Serratia marcescens subsp. sakuensis Ajithkumar et al. 2003 / strain KRED [[Serratia marcescens subsp. sakuensis]] / VKM B-1248 / VKM:B:1248
NCBI Taxonomy ID615
系統 *2細胞生物 > 細菌 > Pseudomonadota > ガンマプロテオバクテリア綱 > Enterobacterales > Yersiniaceae > セラチア属
ウィキペディアウィキペディア - Serratia marcescens:

Serratia marcescens () is a species of rod-shaped, Gram-negative bacteria in the family Yersiniaceae. It is a facultative anaerobe and an opportunistic pathogen in humans...

コメントバクテリア
出典*1: DBCLSメタ用語集-翻訳用テーブル-学名と和名の対応 ライフサイエンス統合データベースプロジェクト
*2: NCBI Taxonomy

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EMDB エントリ (8)

全8件を表示しています

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PDB エントリ (171)

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SASBDB エントリ (0)

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万見生物種について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見生物種

EMDB/PDB/SASBDBの生物種情報

EMDB/PDB/SASBDBの構造データの試料情報、由来する生物種に関するデータベース

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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