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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1i7s | ||||||
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タイトル | ANTHRANILATE SYNTHASE FROM SERRATIA MARCESCENS IN COMPLEX WITH ITS END PRODUCT INHIBITOR L-TRYPTOPHAN | ||||||
要素 |
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キーワード | LYASE (リアーゼ) / ANTHRANILATE SYNTHASE (アントラニル酸シンターゼ) / END PRODUCT INHIBITION / TRYPTOPHAN BINDING (トリプトファン) / CONFORMATIONAL CHANGE (コンフォメーション変化) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 アントラニル酸シンターゼ / anthranilate synthase activity / phenazine biosynthetic process / anthranilate phosphoribosyltransferase activity / tryptophan biosynthetic process / glutamine metabolic process / metal ion binding / 細胞質基質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Serratia marcescens (霊菌) | ||||||
手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 2.4 Å | ||||||
データ登録者 | Spraggon, G. / Kim, C. / Nguyen-Huu, X. / Yee, M.-C. / Yanofsky, C. / Mills, S.E. | ||||||
引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2001 タイトル: The structures of anthranilate synthase of Serratia marcescens crystallized in the presence of (i) its substrates, chorismate and glutamine, and a product, glutamate, and (ii) its end- ...タイトル: The structures of anthranilate synthase of Serratia marcescens crystallized in the presence of (i) its substrates, chorismate and glutamine, and a product, glutamate, and (ii) its end-product inhibitor, L-tryptophan. 著者: Spraggon, G. / Kim, C. / Nguyen-Huu, X. / Yee, M.C. / Yanofsky, C. / Mills, S.E. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1i7s.cif.gz | 276.9 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1i7s.ent.gz | 222.2 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1i7s.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/i7/1i7s ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/i7/1i7s | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 57664.273 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Serratia marcescens (霊菌) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) 参照: UniProt: P00897, アントラニル酸シンターゼ #2: タンパク質 | 分子量: 20950.117 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Serratia marcescens (霊菌) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) 参照: UniProt: P00900, アントラニル酸シンターゼ #3: 化合物 | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.55 Å3/Da / 溶媒含有率: 51.76 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 5.4 / 詳細: pH 5.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS pH: 6.5 / 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 90 K |
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放射光源 | 由来: 回転陽極 / タイプ: その他 / 波長: 1.5418 |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2000年1月15日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.4→44.91 Å / % possible obs: 93.8 % / 冗長度: 5.4 % / Biso Wilson estimate: 54.3 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.055 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.4 Å / 最低解像度: 44.91 Å / Num. obs: 59826 / 冗長度: 5.4 % / Biso Wilson estimate: 54.3 Å2 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: PDB 1QDL 解像度: 2.4→44.9 Å / 交差検証法: THROUGHOUT
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原子変位パラメータ | Biso mean: 60.86 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.4→44.9 Å
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ソフトウェア | *PLUS 名称: CNS / バージョン: 1 / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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